Protein–RNA interactions for Protein: Q12217

TY1A-BR, Transposon Ty1-BR Gag polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-BRQ12217 GAS3YMR215W 1575 nt5.32□□□□□ -1.56
TY1A-BRQ12217 DSF2YBR007C 2211 nt5.32□□□□□ -1.56
TY1A-BRQ12217 ESF1YDR365C 1887 nt5.32□□□□□ -1.56
TY1A-BRQ12217 SAC1YKL212W 1872 nt5.32□□□□□ -1.56
TY1A-BRQ12217 PYC1YGL062W 3537 nt5.32□□□□□ -1.56
TY1A-BRQ12217 snR68snR68 136 nt5.31□□□□□ -1.56
TY1A-BRQ12217 MIC19YFR011C 513 nt5.31□□□□□ -1.56
TY1A-BRQ12217 YJL135WYJL135W 318 nt5.31□□□□□ -1.56
TY1A-BRQ12217 YLL056CYLL056C 897 nt5.31□□□□□ -1.56
TY1A-BRQ12217 RPL15AYLR029C 615 nt5.31□□□□□ -1.56
TY1A-BRQ12217 OST6YML019W 999 nt5.31□□□□□ -1.56
TY1A-BRQ12217 YBR137WYBR137W 540 nt5.31□□□□□ -1.56
TY1A-BRQ12217 MNN5YJL186W 1761 nt5.31□□□□□ -1.56
TY1A-BRQ12217 PRS5YOL061W 1491 nt5.31□□□□□ -1.56
TY1A-BRQ12217 VTC2YFL004W 2487 nt5.31□□□□□ -1.56
TY1A-BRQ12217 PPR1YLR014C 2715 nt5.31□□□□□ -1.56
TY1A-BRQ12217 YJL016WYJL016W 1686 nt5.31□□□□□ -1.56
TY1A-BRQ12217 YFH1YDL120W 525 nt5.3□□□□□ -1.56
TY1A-BRQ12217 TIF35YDR429C 825 nt5.3□□□□□ -1.56
TY1A-BRQ12217 CAX4YGR036C 720 nt5.3□□□□□ -1.56
TY1A-BRQ12217 NSG1YHR133C 876 nt5.3□□□□□ -1.56
TY1A-BRQ12217 RPS4BYHR203C 786 nt5.3□□□□□ -1.56
TY1A-BRQ12217 NIT2YJL126W 924 nt5.3□□□□□ -1.56
TY1A-BRQ12217 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt5.3□□□□□ -1.56
TY1A-BRQ12217 YOR302WYOR302W 78 nt5.3□□□□□ -1.56
TY1A-BRQ12217 RIM13YMR154C 2184 nt5.3□□□□□ -1.56
TY1A-BRQ12217 YGR054WYGR054W 1929 nt5.3□□□□□ -1.56
TY1A-BRQ12217 CTT1YGR088W 1689 nt5.3□□□□□ -1.56
TY1A-BRQ12217 ACK1YDL203C 1872 nt5.3□□□□□ -1.56
TY1A-BRQ12217 UTP13YLR222C 2454 nt5.3□□□□□ -1.56
TY1A-BRQ12217 CDC9YDL164C 2268 nt5.29□□□□□ -1.56
TY1A-BRQ12217 HCS1YKL017C 2052 nt5.29□□□□□ -1.56
TY1A-BRQ12217 YDR526CYDR526C 471 nt5.29□□□□□ -1.56
TY1A-BRQ12217 SOD2YHR008C 702 nt5.29□□□□□ -1.56
TY1A-BRQ12217 CYS3YAL012W 1185 nt5.29□□□□□ -1.56
TY1A-BRQ12217 YAR070CYAR070C 300 nt5.29□□□□□ -1.56
TY1A-BRQ12217 IRC23YOR044W 474 nt5.29□□□□□ -1.56
TY1A-BRQ12217 PDR18YNR070W 4002 nt5.29□□□□□ -1.56
TY1A-BRQ12217 PRP28YDR243C 1767 nt5.29□□□□□ -1.56
TY1A-BRQ12217 MCD1YDL003W 1701 nt5.28□□□□□ -1.56
TY1A-BRQ12217 RIM101YHL027W 1878 nt5.28□□□□□ -1.56
TY1A-BRQ12217 YOL019WYOL019W 1656 nt5.28□□□□□ -1.56
TY1A-BRQ12217 RGT1YKL038W 3513 nt5.28□□□□□ -1.56
TY1A-BRQ12217 IZH3YLR023C 1632 nt5.28□□□□□ -1.56
TY1A-BRQ12217 SLX8YER116C 825 nt5.28□□□□□ -1.56
TY1A-BRQ12217 PRE5YMR314W 705 nt5.28□□□□□ -1.56
TY1A-BRQ12217 SIL1YOL031C 1266 nt5.28□□□□□ -1.56
TY1A-BRQ12217 YBL109WYBL109W 336 nt5.28□□□□□ -1.56
TY1A-BRQ12217 snR13snR13 124 nt5.28□□□□□ -1.56
TY1A-BRQ12217 YHK8YHR048W 1545 nt5.28□□□□□ -1.56
TY1A-BRQ12217 BOI2YER114C 3123 nt5.28□□□□□ -1.56
TY1A-BRQ12217 DBF20YPR111W 1695 nt5.28□□□□□ -1.56
TY1A-BRQ12217 GSY1YFR015C 2127 nt5.27□□□□□ -1.57
TY1A-BRQ12217 VPS73YGL104C 1461 nt5.27□□□□□ -1.57
TY1A-BRQ12217 TPA1YER049W 1935 nt5.27□□□□□ -1.57
TY1A-BRQ12217 YFR010W-AYFR010W-A 189 nt5.27□□□□□ -1.57
TY1A-BRQ12217 NOP19YGR251W 591 nt5.27□□□□□ -1.57
TY1A-BRQ12217 MAL11YGR289C 1851 nt5.27□□□□□ -1.57
TY1A-BRQ12217 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt5.27□□□□□ -1.57
TY1A-BRQ12217 YAR068WYAR068W 486 nt5.27□□□□□ -1.57
TY1A-BRQ12217 NRD1YNL251C 1728 nt5.26□□□□□ -1.57
TY1A-BRQ12217 GPI14YJR013W 1212 nt5.26□□□□□ -1.57
TY1A-BRQ12217 TMA22YJR014W 597 nt5.26□□□□□ -1.57
TY1A-BRQ12217 MEH1YKR007W 555 nt5.26□□□□□ -1.57
TY1A-BRQ12217 COF1YLL050C 432 nt5.26□□□□□ -1.57
TY1A-BRQ12217 RPS7BYNL096C 573 nt5.26□□□□□ -1.57
TY1A-BRQ12217 ATX1YNL259C 222 nt5.26□□□□□ -1.57
TY1A-BRQ12217 PRP39YML046W 1890 nt5.26□□□□□ -1.57
TY1A-BRQ12217 MEF2YJL102W 2460 nt5.25□□□□□ -1.57
TY1A-BRQ12217 RLF2YPR018W 1821 nt5.25□□□□□ -1.57
TY1A-BRQ12217 PCK1YKR097W 1650 nt5.25□□□□□ -1.57
TY1A-BRQ12217 STI1YOR027W 1770 nt5.25□□□□□ -1.57
TY1A-BRQ12217 YDR048CYDR048C 315 nt5.25□□□□□ -1.57
TY1A-BRQ12217 UTR4YEL038W 684 nt5.25□□□□□ -1.57
TY1A-BRQ12217 GPP2YER062C 753 nt5.25□□□□□ -1.57
TY1A-BRQ12217 YJR023CYJR023C 402 nt5.25□□□□□ -1.57
TY1A-BRQ12217 HXT14YNL318C 1623 nt5.25□□□□□ -1.57
TY1A-BRQ12217 YJL132WYJL132W 2253 nt5.25□□□□□ -1.57
TY1A-BRQ12217 YJL150WYJL150W 303 nt5.24□□□□□ -1.57
TY1A-BRQ12217 ILV5YLR355C 1188 nt5.24□□□□□ -1.57
TY1A-BRQ12217 ATP1YBL099W 1638 nt5.23□□□□□ -1.57
TY1A-BRQ12217 YER088C-AYER088C-A 324 nt5.23□□□□□ -1.57
TY1A-BRQ12217 VEL1YGL258W 621 nt5.23□□□□□ -1.57
TY1A-BRQ12217 RPL11BYGR085C 525 nt5.23□□□□□ -1.57
TY1A-BRQ12217 EPT1YHR123W 1176 nt5.23□□□□□ -1.57
TY1A-BRQ12217 SIP18YMR175W 240 nt5.23□□□□□ -1.57
TY1A-BRQ12217 YBL083CYBL083C 426 nt5.23□□□□□ -1.57
TY1A-BRQ12217 MBF1YOR298C-A 456 nt5.23□□□□□ -1.57
TY1A-BRQ12217 RPL11AYPR102C 525 nt5.23□□□□□ -1.57
TY1A-BRQ12217 RAD61YDR014W 1944 nt5.23□□□□□ -1.57
TY1A-BRQ12217 OSW7YFR039C 1533 nt5.23□□□□□ -1.57
TY1A-BRQ12217 ROG3YFR022W 2202 nt5.22□□□□□ -1.57
TY1A-BRQ12217 YFR054CYFR054C 579 nt5.22□□□□□ -1.57
TY1A-BRQ12217 HSK3YKL138C-A 210 nt5.22□□□□□ -1.57
TY1A-BRQ12217 YOL131WYOL131W 327 nt5.22□□□□□ -1.57
TY1A-BRQ12217 YPL142CYPL142C 318 nt5.22□□□□□ -1.57
TY1A-BRQ12217 ADE6YGR061C 4077 nt5.22□□□□□ -1.57
TY1A-BRQ12217 MPH3YJR160C 1809 nt5.22□□□□□ -1.57
TY1A-BRQ12217 UBP10YNL186W 2379 nt5.22□□□□□ -1.57
TY1A-BRQ12217 UTP25YIL091C 2166 nt5.22□□□□□ -1.57
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