Protein–RNA interactions for Protein: P52292

KPNA2, Importin subunit alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA2P52292 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
KPNA2P52292 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
KPNA2P52292 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KPNA2P52292 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KPNA2P52292 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KPNA2P52292 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KPNA2P52292 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
KPNA2P52292 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
KPNA2P52292 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KPNA2P52292 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
KPNA2P52292 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
KPNA2P52292 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
KPNA2P52292 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
KPNA2P52292 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
KPNA2P52292 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
KPNA2P52292 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KPNA2P52292 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KPNA2P52292 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KPNA2P52292 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KPNA2P52292 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KPNA2P52292 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KPNA2P52292 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KPNA2P52292 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KPNA2P52292 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KPNA2P52292 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KPNA2P52292 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KPNA2P52292 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KPNA2P52292 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KPNA2P52292 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KPNA2P52292 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
KPNA2P52292 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KPNA2P52292 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KPNA2P52292 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KPNA2P52292 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KPNA2P52292 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KPNA2P52292 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KPNA2P52292 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KPNA2P52292 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KPNA2P52292 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KPNA2P52292 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KPNA2P52292 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KPNA2P52292 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KPNA2P52292 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KPNA2P52292 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KPNA2P52292 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KPNA2P52292 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KPNA2P52292 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KPNA2P52292 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KPNA2P52292 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KPNA2P52292 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KPNA2P52292 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
KPNA2P52292 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KPNA2P52292 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms