Protein–RNA interactions for Protein: P38316

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, yeast

Predictions only

Length 186 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG12	P38316	GIN4	YDR507C	3429 nt		2.62	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	TOM1	YDR457W	9807 nt		2.61	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	CIK1	YMR198W	1785 nt		2.61	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	ESC1	YMR219W	4977 nt		2.61	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	APC5	YOR249C	2058 nt		2.61	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	SNU23	YDL098C	585 nt		2.61	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	YER165C-A	YER165C-A	357 nt		2.61	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	SMX2	YFL017W-A	234 nt		2.61	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	EFG1	YGR271C-A	702 nt		2.61	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	PFS1	YHR185C	714 nt		2.61	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	ALB1	YJL122W	528 nt		2.61	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	YAL034C-B	YAL034C-B	354 nt		2.61	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	VMA5	YKL080W	1179 nt		2.61	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	RIF2	YLR453C	1188 nt		2.61	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	APD1	YBR151W	951 nt		2.61	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	ICS2	YBR157C	768 nt		2.61	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	NSA1	YGL111W	1392 nt		2.61	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	MUS81	YDR386W	1899 nt		2.6	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	YDR442W	YDR442W	393 nt		2.6	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	YGR073C	YGR073C	372 nt		2.6	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	NNT1	YLR285W	786 nt		2.6	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	ATG34	YOL083W	1239 nt		2.6	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	TPT1	YOL102C	693 nt		2.6	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	SGT1	YOR057W	1188 nt		2.6	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	YBR201C-A	YBR201C-A	204 nt		2.6	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	KAR1	YNL188W	1302 nt		2.6	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	PSK1	YAL017W	4071 nt		2.59	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	YBL005W-B	YBL005W-B	5268 nt		2.59	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	snR68	snR68	136 nt		2.59	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	RMT2	YDR465C	1239 nt		2.59	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	YDR535C	YDR535C	501 nt		2.59	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	BRR6	YGL247W	594 nt		2.59	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	PPE1	YHR075C	1203 nt		2.59	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	ASG7	YJL170C	630 nt		2.59	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	RPA12	YJR063W	378 nt		2.59	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	YKL066W	YKL066W	444 nt		2.59	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	YLR076C	YLR076C	423 nt		2.59	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	GAB1	YLR459W	1185 nt		2.59	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	YIP3	YNL044W	531 nt		2.59	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	ATG19	YOL082W	1248 nt		2.59	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	YOR203W	YOR203W	354 nt		2.59	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	RRP7	YCL031C	894 nt		2.59	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	HAA1	YPR008W	2085 nt		2.59	□□□□□ -2
ATG12	P38316	PDR1	YGL013C	3207 nt		2.58	□□□□□ -2
ATG12	P38316	YDR131C	YDR131C	1671 nt		2.58	□□□□□ -2
ATG12	P38316	MRPL32	YCR003W	552 nt		2.58	□□□□□ -2
ATG12	P38316	TCA17	YEL048C	459 nt		2.58	□□□□□ -2
ATG12	P38316	RPB9	YGL070C	369 nt		2.58	□□□□□ -2
ATG12	P38316	GLG2	YJL137C	1143 nt		2.58	□□□□□ -2
ATG12	P38316	YML090W	YML090W	387 nt		2.58	□□□□□ -2
ATG12	P38316	YOL114C	YOL114C	609 nt		2.58	□□□□□ -2
ATG12	P38316	GRX7	YBR014C	612 nt		2.58	□□□□□ -2
ATG12	P38316	RPN8	YOR261C	1017 nt		2.58	□□□□□ -2
ATG12	P38316	RRD2	YPL152W	1077 nt		2.58	□□□□□ -2
ATG12	P38316	DIA2	YOR080W	2199 nt		2.58	□□□□□ -2
ATG12	P38316	BNI4	YNL233W	2679 nt		2.57	□□□□□ -2
ATG12	P38316	NUM1	YDR150W	8247 nt		2.57	□□□□□ -2
ATG12	P38316	DSE1	YER124C	1722 nt		2.57	□□□□□ -2
ATG12	P38316	VTC3	YPL019C	2508 nt		2.57	□□□□□ -2
ATG12	P38316	FMN1	YDR236C	657 nt		2.57	□□□□□ -2
ATG12	P38316	PIB1	YDR313C	861 nt		2.57	□□□□□ -2
ATG12	P38316	RGI1	YER067W	486 nt		2.57	□□□□□ -2
ATG12	P38316	RTT105	YER104W	627 nt		2.57	□□□□□ -2
ATG12	P38316	PAU14	YIL176C	363 nt		2.57	□□□□□ -2
ATG12	P38316	PAU1	YJL223C	363 nt		2.57	□□□□□ -2
ATG12	P38316	YLR198C	YLR198C	360 nt		2.57	□□□□□ -2
ATG12	P38316	YLR285C-A	YLR285C-A	171 nt		2.57	□□□□□ -2
ATG12	P38316	MRPS8	YMR158W	468 nt		2.57	□□□□□ -2
ATG12	P38316	YOR050C	YOR050C	348 nt		2.57	□□□□□ -2
ATG12	P38316	AME1	YBR211C	975 nt		2.57	□□□□□ -2
ATG12	P38316	DPB3	YBR278W	606 nt		2.57	□□□□□ -2
ATG12	P38316	AI2	Q0055	2565 nt		2.57	□□□□□ -2
ATG12	P38316	SLY41	YOR307C	1362 nt		2.57	□□□□□ -2
ATG12	P38316	PDC2	YDR081C	2778 nt		2.57	□□□□□ -2
ATG12	P38316	TAF2	YCR042C	4224 nt		2.57	□□□□□ -2
ATG12	P38316	YCK2	YNL154C	1641 nt		2.57	□□□□□ -2
ATG12	P38316	ATP22	YDR350C	2055 nt		2.56	□□□□□ -2
ATG12	P38316	KIN82	YCR091W	2163 nt		2.56	□□□□□ -2
ATG12	P38316	NUP170	YBL079W	4509 nt		2.56	□□□□□ -2
ATG12	P38316	RSM24	YDR175C	960 nt		2.56	□□□□□ -2
ATG12	P38316	FSH1	YHR049W	732 nt		2.56	□□□□□ -2
ATG12	P38316	ECM13	YBL043W	774 nt		2.56	□□□□□ -2
ATG12	P38316	MIC27	YNL100W	705 nt		2.56	□□□□□ -2
ATG12	P38316	ATG29	YPL166W	642 nt		2.56	□□□□□ -2
ATG12	P38316	ERV15	YBR210W	429 nt		2.56	□□□□□ -2
ATG12	P38316	CTP1	YBR291C	900 nt		2.56	□□□□□ -2
ATG12	P38316	OSW7	YFR039C	1533 nt		2.56	□□□□□ -2
ATG12	P38316	SRP68	YPL243W	1800 nt		2.56	□□□□□ -2
ATG12	P38316	GCD2	YGR083C	1956 nt		2.56	□□□□□ -2
ATG12	P38316	YDR210W-B	YDR210W-B	5313 nt		2.55	□□□□□ -2
ATG12	P38316	YDR261W-B	YDR261W-B	5313 nt		2.55	□□□□□ -2
ATG12	P38316	YFL002W-A	YFL002W-A	5313 nt		2.55	□□□□□ -2
ATG12	P38316	YGR161W-B	YGR161W-B	5313 nt		2.55	□□□□□ -2
ATG12	P38316	YLR410W-B	YLR410W-B	5313 nt		2.55	□□□□□ -2
ATG12	P38316	YCL019W	YCL019W	5313 nt		2.55	□□□□□ -2
ATG12	P38316	BI3	Q0115	1554 nt		2.55	□□□□□ -2
ATG12	P38316	MET14	YKL001C	609 nt		2.55	□□□□□ -2
ATG12	P38316	HYM1	YKL189W	1200 nt		2.55	□□□□□ -2
ATG12	P38316	ARP9	YMR033W	1404 nt		2.55	□□□□□ -2
ATG12	P38316	AVT5	YBL089W	1380 nt		2.55	□□□□□ -2

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