Protein–RNA interactions for Protein: Q12463

TRM11, tRNA (guanine(10)-N2)-methyltransferase, yeastyeast

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TRM11Q12463 CMP2YML057W 1815 nt10.23□□□□□ -0.77
TRM11Q12463 YJL064WYJL064W 396 nt10.23□□□□□ -0.77
TRM11Q12463 YPL251WYPL251W 303 nt10.2□□□□□ -0.78
TRM11Q12463 CSM1YCR086W 573 nt10.19□□□□□ -0.78
TRM11Q12463 MEP3YPR138C 1470 nt10.17□□□□□ -0.78
TRM11Q12463 PAU19YMR325W 375 nt10.17□□□□□ -0.78
TRM11Q12463 TAF13YML098W 504 nt10.16□□□□□ -0.78
TRM11Q12463 YMR103CYMR103C 363 nt10.16□□□□□ -0.78
TRM11Q12463 HSL7YBR133C 2484 nt10.16□□□□□ -0.78
TRM11Q12463 DBP1YPL119C 1854 nt10.15□□□□□ -0.78
TRM11Q12463 THI72YOR192C 1800 nt10.15□□□□□ -0.78
TRM11Q12463 BRR1YPR057W 1026 nt10.15□□□□□ -0.78
TRM11Q12463 LSB5YCL034W 1065 nt10.15□□□□□ -0.78
TRM11Q12463 NME1NME1 340 nt10.14□□□□□ -0.79
TRM11Q12463 YBL086CYBL086C 1401 nt10.14□□□□□ -0.79
TRM11Q12463 LEU9YOR108W 1815 nt10.13□□□□□ -0.79
TRM11Q12463 HXT1YHR094C 1713 nt10.13□□□□□ -0.79
TRM11Q12463 YJL118WYJL118W 660 nt10.12□□□□□ -0.79
TRM11Q12463 GAL3YDR009W 1563 nt10.12□□□□□ -0.79
TRM11Q12463 TIM44YIL022W 1296 nt10.11□□□□□ -0.79
TRM11Q12463 TOA2YKL058W 369 nt10.11□□□□□ -0.79
TRM11Q12463 SLG1YOR008C 1137 nt10.11□□□□□ -0.79
TRM11Q12463 RPT5YOR117W 1305 nt10.08□□□□□ -0.8
TRM11Q12463 NUC1YJL208C 990 nt10.08□□□□□ -0.8
TRM11Q12463 RIB7YBR153W 735 nt10.08□□□□□ -0.8
TRM11Q12463 SSN3YPL042C 1668 nt10.08□□□□□ -0.8
TRM11Q12463 YMR262WYMR262W 942 nt10.06□□□□□ -0.8
TRM11Q12463 HIF1YLL022C 1158 nt10.05□□□□□ -0.8
TRM11Q12463 SNZ1YMR096W 894 nt10.05□□□□□ -0.8
TRM11Q12463 SAM3YPL274W 1764 nt10.04□□□□□ -0.8
TRM11Q12463 PHO23YNL097C 993 nt10.04□□□□□ -0.8
TRM11Q12463 BNI5YNL166C 1347 nt10.04□□□□□ -0.8
TRM11Q12463 GND2YGR256W 1479 nt10.04□□□□□ -0.8
TRM11Q12463 PAR32YDL173W 888 nt10.03□□□□□ -0.8
TRM11Q12463 YJR114WYJR114W 393 nt10.03□□□□□ -0.8
TRM11Q12463 TRT2tT(CGU)K 72 nt10.02□□□□□ -0.81
TRM11Q12463 RPC82YPR190C 1965 nt10.01□□□□□ -0.81
TRM11Q12463 TIP1YBR067C 633 nt10.01□□□□□ -0.81
TRM11Q12463 MHF1YOL086W-A 273 nt10□□□□□ -0.81
TRM11Q12463 MSC1YML128C 1542 nt9.99□□□□□ -0.81
TRM11Q12463 SPT20YOL148C 1815 nt9.99□□□□□ -0.81
TRM11Q12463 POT1YIL160C 1254 nt9.99□□□□□ -0.81
TRM11Q12463 GSF2YML048W 1212 nt9.99□□□□□ -0.81
TRM11Q12463 RIB1YBL033C 1038 nt9.97□□□□□ -0.81
TRM11Q12463 YPR126CYPR126C 309 nt9.97□□□□□ -0.81
TRM11Q12463 TUB4YLR212C 1422 nt9.97□□□□□ -0.81
TRM11Q12463 SHY1YGR112W 1170 nt9.96□□□□□ -0.82
TRM11Q12463 SEC61YLR378C 1443 nt9.95□□□□□ -0.82
TRM11Q12463 TPS1YBR126C 1488 nt9.95□□□□□ -0.82
TRM11Q12463 UFO1YML088W 2007 nt9.95□□□□□ -0.82
TRM11Q12463 SAM2YDR502C 1155 nt9.94□□□□□ -0.82
TRM11Q12463 RDN25-1RDN25-1 3396 nt9.94□□□□□ -0.82
TRM11Q12463 RDN25-2RDN25-2 3396 nt9.94□□□□□ -0.82
TRM11Q12463 CTI6YPL181W 1521 nt9.93□□□□□ -0.82
TRM11Q12463 OXA1YER154W 1209 nt9.93□□□□□ -0.82
TRM11Q12463 INA1YLR413W 2028 nt9.93□□□□□ -0.82
TRM11Q12463 OYE2YHR179W 1203 nt9.92□□□□□ -0.82
TRM11Q12463 RAS2YNL098C 969 nt9.92□□□□□ -0.82
TRM11Q12463 ERG6YML008C 1152 nt9.91□□□□□ -0.82
TRM11Q12463 DAK2YFL053W 1776 nt9.91□□□□□ -0.82
TRM11Q12463 YIA6YIL006W 1122 nt9.9□□□□□ -0.82
TRM11Q12463 APS2YJR058C 444 nt9.9□□□□□ -0.82
TRM11Q12463 IML3YBR107C 738 nt9.9□□□□□ -0.82
TRM11Q12463 FUB1YCR076C 753 nt9.89□□□□□ -0.83
TRM11Q12463 SOD2YHR008C 702 nt9.89□□□□□ -0.83
TRM11Q12463 OYE3YPL171C 1203 nt9.89□□□□□ -0.83
TRM11Q12463 YER188WYER188W 720 nt9.88□□□□□ -0.83
TRM11Q12463 URA6YKL024C 615 nt9.88□□□□□ -0.83
TRM11Q12463 NIF3YGL221C 867 nt9.87□□□□□ -0.83
TRM11Q12463 EAF3YPR023C 1206 nt9.87□□□□□ -0.83
TRM11Q12463 YNL024CYNL024C 741 nt9.86□□□□□ -0.83
TRM11Q12463 YGR139WYGR139W 339 nt9.84□□□□□ -0.83
TRM11Q12463 PET8YNL003C 855 nt9.83□□□□□ -0.84
TRM11Q12463 YCP4YCR004C 744 nt9.8□□□□□ -0.84
TRM11Q12463 IGD1YFR017C 588 nt9.8□□□□□ -0.84
TRM11Q12463 TMA23YMR269W 636 nt9.8□□□□□ -0.84
TRM11Q12463 DLD2YDL178W 1593 nt9.79□□□□□ -0.84
TRM11Q12463 ZRT3YKL175W 1512 nt9.77□□□□□ -0.84
TRM11Q12463 FLR1YBR008C 1647 nt9.76□□□□□ -0.85
TRM11Q12463 DDI1YER143W 1287 nt9.76□□□□□ -0.85
TRM11Q12463 MUP1YGR055W 1725 nt9.76□□□□□ -0.85
TRM11Q12463 SAM50YNL026W 1455 nt9.75□□□□□ -0.85
TRM11Q12463 HEL2YDR266C 1920 nt9.75□□□□□ -0.85
TRM11Q12463 OSH7YHR001W 1314 nt9.75□□□□□ -0.85
TRM11Q12463 RIM8YGL045W 1629 nt9.74□□□□□ -0.85
TRM11Q12463 YJL067WYJL067W 351 nt9.74□□□□□ -0.85
TRM11Q12463 LSM5YER146W 282 nt9.73□□□□□ -0.85
TRM11Q12463 IMO32YGR031W 1029 nt9.73□□□□□ -0.85
TRM11Q12463 SPS100YHR139C 981 nt9.72□□□□□ -0.85
TRM11Q12463 POP2YNR052C 1302 nt9.72□□□□□ -0.85
TRM11Q12463 YCR025CYCR025C 411 nt9.71□□□□□ -0.86
TRM11Q12463 SOL2YCR073W-A 948 nt9.71□□□□□ -0.86
TRM11Q12463 IPL1YPL209C 1104 nt9.71□□□□□ -0.86
TRM11Q12463 HOL1YNR055C 1761 nt9.7□□□□□ -0.86
TRM11Q12463 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt9.7□□□□□ -0.86
TRM11Q12463 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt9.7□□□□□ -0.86
TRM11Q12463 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt9.7□□□□□ -0.86
TRM11Q12463 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt9.7□□□□□ -0.86
TRM11Q12463 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt9.7□□□□□ -0.86
TRM11Q12463 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt9.7□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 27.1 ms