Protein–RNA interactions for Protein: Q12267

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, yeastyeast

Predictions only

Length 1,418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SMC4Q12267 SNZ1YMR096W 894 nt14.49□□□□□ -0.09
SMC4Q12267 BRR1YPR057W 1026 nt14.46□□□□□ -0.09
SMC4Q12267 SSN3YPL042C 1668 nt14.45□□□□□ -0.1
SMC4Q12267 HXT1YHR094C 1713 nt14.43□□□□□ -0.1
SMC4Q12267 GND2YGR256W 1479 nt14.41□□□□□ -0.1
SMC4Q12267 IRC24YIR036C 792 nt14.41□□□□□ -0.1
SMC4Q12267 BMT6YLR063W 1098 nt14.41□□□□□ -0.1
SMC4Q12267 BNI5YNL166C 1347 nt14.4□□□□□ -0.1
SMC4Q12267 SAM3YPL274W 1764 nt14.4□□□□□ -0.1
SMC4Q12267 ERG6YML008C 1152 nt14.4□□□□□ -0.1
SMC4Q12267 PRP4YPR178W 1398 nt14.39□□□□□ -0.11
SMC4Q12267 APS2YJR058C 444 nt14.38□□□□□ -0.11
SMC4Q12267 RPT5YOR117W 1305 nt14.37□□□□□ -0.11
SMC4Q12267 RIB1YBL033C 1038 nt14.35□□□□□ -0.11
SMC4Q12267 RIB7YBR153W 735 nt14.35□□□□□ -0.11
SMC4Q12267 PAR32YDL173W 888 nt14.34□□□□□ -0.11
SMC4Q12267 SOD2YHR008C 702 nt14.34□□□□□ -0.11
SMC4Q12267 TUB4YLR212C 1422 nt14.34□□□□□ -0.11
SMC4Q12267 DBP1YPL119C 1854 nt14.32□□□□□ -0.12
SMC4Q12267 SAM2YDR502C 1155 nt14.32□□□□□ -0.12
SMC4Q12267 TRT2tT(CGU)K 72 nt14.29□□□□□ -0.12
SMC4Q12267 DPS1YLL018C 1674 nt14.29□□□□□ -0.12
SMC4Q12267 TPS1YBR126C 1488 nt14.28□□□□□ -0.12
SMC4Q12267 LEU9YOR108W 1815 nt14.26□□□□□ -0.13
SMC4Q12267 POT1YIL160C 1254 nt14.26□□□□□ -0.13
SMC4Q12267 GSF2YML048W 1212 nt14.25□□□□□ -0.13
SMC4Q12267 YPR126CYPR126C 309 nt14.25□□□□□ -0.13
SMC4Q12267 CTI6YPL181W 1521 nt14.24□□□□□ -0.13
SMC4Q12267 PHO23YNL097C 993 nt14.24□□□□□ -0.13
SMC4Q12267 MHF1YOL086W-A 273 nt14.23□□□□□ -0.13
SMC4Q12267 HIF1YLL022C 1158 nt14.21□□□□□ -0.13
SMC4Q12267 OYE2YHR179W 1203 nt14.19□□□□□ -0.14
SMC4Q12267 YIA6YIL006W 1122 nt14.17□□□□□ -0.14
SMC4Q12267 RAS2YNL098C 969 nt14.16□□□□□ -0.14
SMC4Q12267 MSC1YML128C 1542 nt14.15□□□□□ -0.14
SMC4Q12267 BOR1YNL275W 1731 nt14.14□□□□□ -0.15
SMC4Q12267 DDI1YER143W 1287 nt14.14□□□□□ -0.15
SMC4Q12267 SHY1YGR112W 1170 nt14.14□□□□□ -0.15
SMC4Q12267 UFO1YML088W 2007 nt14.13□□□□□ -0.15
SMC4Q12267 SNF1YDR477W 1902 nt14.11□□□□□ -0.15
SMC4Q12267 YER188WYER188W 720 nt14.1□□□□□ -0.15
SMC4Q12267 OYE3YPL171C 1203 nt14.1□□□□□ -0.15
SMC4Q12267 DAK2YFL053W 1776 nt14.1□□□□□ -0.15
SMC4Q12267 ACO2YJL200C 2370 nt14.1□□□□□ -0.15
SMC4Q12267 NIF3YGL221C 867 nt14.08□□□□□ -0.15
SMC4Q12267 POP2YNR052C 1302 nt14.08□□□□□ -0.16
SMC4Q12267 SEC61YLR378C 1443 nt14.07□□□□□ -0.16
SMC4Q12267 SAM50YNL026W 1455 nt14.06□□□□□ -0.16
SMC4Q12267 YCR025CYCR025C 411 nt14.06□□□□□ -0.16
SMC4Q12267 FUB1YCR076C 753 nt14.06□□□□□ -0.16
SMC4Q12267 EAF3YPR023C 1206 nt14.06□□□□□ -0.16
SMC4Q12267 QDR2YIL121W 1629 nt14.05□□□□□ -0.16
SMC4Q12267 YCP4YCR004C 744 nt14.04□□□□□ -0.16
SMC4Q12267 YNL024CYNL024C 741 nt14.04□□□□□ -0.16
SMC4Q12267 KRE1YNL322C 942 nt14.04□□□□□ -0.16
SMC4Q12267 LSM5YER146W 282 nt14.03□□□□□ -0.16
SMC4Q12267 IGD1YFR017C 588 nt14.03□□□□□ -0.16
SMC4Q12267 IML3YBR107C 738 nt14.03□□□□□ -0.16
SMC4Q12267 YER152W-AYER152W-A 567 nt14.01□□□□□ -0.17
SMC4Q12267 TMA23YMR269W 636 nt13.98□□□□□ -0.17
SMC4Q12267 FLR1YBR008C 1647 nt13.97□□□□□ -0.17
SMC4Q12267 NAS2YIL007C 663 nt13.96□□□□□ -0.18
SMC4Q12267 CDD1YLR245C 429 nt13.95□□□□□ -0.18
SMC4Q12267 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt13.93□□□□□ -0.18
SMC4Q12267 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt13.93□□□□□ -0.18
SMC4Q12267 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt13.93□□□□□ -0.18
SMC4Q12267 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt13.93□□□□□ -0.18
SMC4Q12267 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt13.93□□□□□ -0.18
SMC4Q12267 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt13.93□□□□□ -0.18
SMC4Q12267 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt13.93□□□□□ -0.18
SMC4Q12267 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt13.93□□□□□ -0.18
SMC4Q12267 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt13.93□□□□□ -0.18
SMC4Q12267 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt13.93□□□□□ -0.18
SMC4Q12267 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt13.93□□□□□ -0.18
SMC4Q12267 LYS20YDL182W 1287 nt13.92□□□□□ -0.18
SMC4Q12267 URA6YKL024C 615 nt13.92□□□□□ -0.18
SMC4Q12267 OSH7YHR001W 1314 nt13.92□□□□□ -0.18
SMC4Q12267 SPE2YOL052C 1191 nt13.91□□□□□ -0.18
SMC4Q12267 RSC8YFR037C 1674 nt13.91□□□□□ -0.18
SMC4Q12267 DLD2YDL178W 1593 nt13.91□□□□□ -0.18
SMC4Q12267 PET8YNL003C 855 nt13.9□□□□□ -0.18
SMC4Q12267 ADE8YDR408C 645 nt13.88□□□□□ -0.19
SMC4Q12267 IPL1YPL209C 1104 nt13.88□□□□□ -0.19
SMC4Q12267 SOL2YCR073W-A 948 nt13.87□□□□□ -0.19
SMC4Q12267 OXA1YER154W 1209 nt13.87□□□□□ -0.19
SMC4Q12267 SPS100YHR139C 981 nt13.87□□□□□ -0.19
SMC4Q12267 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt13.85□□□□□ -0.19
SMC4Q12267 BUD20YLR074C 501 nt13.85□□□□□ -0.19
SMC4Q12267 FLX1YIL134W 936 nt13.83□□□□□ -0.2
SMC4Q12267 IMO32YGR031W 1029 nt13.81□□□□□ -0.2
SMC4Q12267 SPP2YOR148C 558 nt13.81□□□□□ -0.2
SMC4Q12267 ABZ2YMR289W 1125 nt13.8□□□□□ -0.2
SMC4Q12267 YPS3YLR121C 1527 nt13.79□□□□□ -0.2
SMC4Q12267 BIO5YNR056C 1686 nt13.77□□□□□ -0.2
SMC4Q12267 YDR455CYDR455C 309 nt13.77□□□□□ -0.21
SMC4Q12267 ADH3YMR083W 1128 nt13.76□□□□□ -0.21
SMC4Q12267 TGA1tA(UGC)A 73 nt13.75□□□□□ -0.21
SMC4Q12267 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt13.75□□□□□ -0.21
SMC4Q12267 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt13.75□□□□□ -0.21
SMC4Q12267 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 32.2 ms