Protein–RNA interactions for Protein: Q12221

PUF2, mRNA-binding protein PUF2, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 1,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF2Q12221 GPN2YOR262W 1044 nt9.47□□□□□ -0.89
PUF2Q12221 ZRT3YKL175W 1512 nt9.46□□□□□ -0.89
PUF2Q12221 BNI5YNL166C 1347 nt9.46□□□□□ -0.9
PUF2Q12221 NAR1YNL240C 1476 nt9.46□□□□□ -0.9
PUF2Q12221 URA6YKL024C 615 nt9.45□□□□□ -0.9
PUF2Q12221 OYE3YPL171C 1203 nt9.45□□□□□ -0.9
PUF2Q12221 PAU15YIR041W 375 nt9.44□□□□□ -0.9
PUF2Q12221 SAM3YPL274W 1764 nt9.44□□□□□ -0.9
PUF2Q12221 CYT2YKL087C 675 nt9.43□□□□□ -0.9
PUF2Q12221 YJL067WYJL067W 351 nt9.42□□□□□ -0.9
PUF2Q12221 YJL118WYJL118W 660 nt9.42□□□□□ -0.9
PUF2Q12221 PHO23YNL097C 993 nt9.42□□□□□ -0.9
PUF2Q12221 LSB5YCL034W 1065 nt9.41□□□□□ -0.9
PUF2Q12221 MSC1YML128C 1542 nt9.41□□□□□ -0.9
PUF2Q12221 SAM2YDR502C 1155 nt9.4□□□□□ -0.9
PUF2Q12221 GAL3YDR009W 1563 nt9.39□□□□□ -0.91
PUF2Q12221 CPD1YGR247W 720 nt9.38□□□□□ -0.91
PUF2Q12221 NUC1YJL208C 990 nt9.38□□□□□ -0.91
PUF2Q12221 PET8YNL003C 855 nt9.37□□□□□ -0.91
PUF2Q12221 FLR1YBR008C 1647 nt9.37□□□□□ -0.91
PUF2Q12221 SEC61YLR378C 1443 nt9.37□□□□□ -0.91
PUF2Q12221 RPT5YOR117W 1305 nt9.36□□□□□ -0.91
PUF2Q12221 FUB1YCR076C 753 nt9.35□□□□□ -0.91
PUF2Q12221 OXA1YER154W 1209 nt9.34□□□□□ -0.91
PUF2Q12221 YAT1YAR035W 2064 nt9.33□□□□□ -0.92
PUF2Q12221 CCT5YJR064W 1689 nt9.33□□□□□ -0.92
PUF2Q12221 DLD2YDL178W 1593 nt9.33□□□□□ -0.92
PUF2Q12221 YER188WYER188W 720 nt9.32□□□□□ -0.92
PUF2Q12221 TPS1YBR126C 1488 nt9.31□□□□□ -0.92
PUF2Q12221 FMS1YMR020W 1527 nt9.31□□□□□ -0.92
PUF2Q12221 RSC8YFR037C 1674 nt9.3□□□□□ -0.92
PUF2Q12221 SNZ1YMR096W 894 nt9.3□□□□□ -0.92
PUF2Q12221 RAS2YNL098C 969 nt9.3□□□□□ -0.92
PUF2Q12221 YPS3YLR121C 1527 nt9.3□□□□□ -0.92
PUF2Q12221 RIB7YBR153W 735 nt9.28□□□□□ -0.92 RIP-Chip
PUF2Q12221 RDN25-1RDN25-1 3396 nt9.28□□□□□ -0.92
PUF2Q12221 RDN25-2RDN25-2 3396 nt9.28□□□□□ -0.92
PUF2Q12221 OYE2YHR179W 1203 nt9.27□□□□□ -0.93
PUF2Q12221 EAF3YPR023C 1206 nt9.27□□□□□ -0.93
PUF2Q12221 ESS1YJR017C 513 nt9.26□□□□□ -0.93
PUF2Q12221 SPP2YOR148C 558 nt9.26□□□□□ -0.93
PUF2Q12221 HEM13YDR044W 987 nt9.25□□□□□ -0.93
PUF2Q12221 CWC15YDR163W 528 nt9.24□□□□□ -0.93
PUF2Q12221 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt9.24□□□□□ -0.93
PUF2Q12221 THI72YOR192C 1800 nt9.24□□□□□ -0.93 RIP-Chip
PUF2Q12221 ACH1YBL015W 1581 nt9.23□□□□□ -0.93
PUF2Q12221 OSH7YHR001W 1314 nt9.22□□□□□ -0.93
PUF2Q12221 TAT2YOL020W 1779 nt9.2□□□□□ -0.94
PUF2Q12221 DDI1YER143W 1287 nt9.2□□□□□ -0.94
PUF2Q12221 PGC1YPL206C 966 nt9.2□□□□□ -0.94
PUF2Q12221 YPR126CYPR126C 309 nt9.2□□□□□ -0.94
PUF2Q12221 RPC82YPR190C 1965 nt9.19□□□□□ -0.94
PUF2Q12221 SOL2YCR073W-A 948 nt9.19□□□□□ -0.94
PUF2Q12221 PAU5YFL020C 369 nt9.19□□□□□ -0.94
PUF2Q12221 TMA23YMR269W 636 nt9.18□□□□□ -0.94
PUF2Q12221 DAK2YFL053W 1776 nt9.17□□□□□ -0.94
PUF2Q12221 INA1YLR413W 2028 nt9.17□□□□□ -0.94 RIP-Chip
PUF2Q12221 YDR455CYDR455C 309 nt9.16□□□□□ -0.94
PUF2Q12221 LSM5YER146W 282 nt9.16□□□□□ -0.94
PUF2Q12221 TAF13YML098W 504 nt9.14□□□□□ -0.95
PUF2Q12221 CTI6YPL181W 1521 nt9.14□□□□□ -0.95
PUF2Q12221 YMR262WYMR262W 942 nt9.13□□□□□ -0.95
PUF2Q12221 FRE6YLL051C 2139 nt9.13□□□□□ -0.95 RIP-Chip
PUF2Q12221 YBR232CYBR232C 360 nt9.11□□□□□ -0.95
PUF2Q12221 IMO32YGR031W 1029 nt9.1□□□□□ -0.95
PUF2Q12221 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt9.1□□□□□ -0.95
PUF2Q12221 MHF1YOL086W-A 273 nt9.1□□□□□ -0.95
PUF2Q12221 YOR325WYOR325W 474 nt9.1□□□□□ -0.95
PUF2Q12221 VPS62YGR141W 1404 nt9.1□□□□□ -0.95
PUF2Q12221 STP3YLR375W 1032 nt9.09□□□□□ -0.95
PUF2Q12221 SEN2YLR105C 1134 nt9.08□□□□□ -0.96
PUF2Q12221 IML3YBR107C 738 nt9.08□□□□□ -0.96
PUF2Q12221 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt9.07□□□□□ -0.96
PUF2Q12221 POT1YIL160C 1254 nt9.07□□□□□ -0.96
PUF2Q12221 APS2YJR058C 444 nt9.07□□□□□ -0.96
PUF2Q12221 YNL024CYNL024C 741 nt9.06□□□□□ -0.96
PUF2Q12221 ASP3-1YLR155C 1089 nt9.05□□□□□ -0.96
PUF2Q12221 ASP3-2YLR157C 1089 nt9.05□□□□□ -0.96
PUF2Q12221 ASP3-3YLR158C 1089 nt9.05□□□□□ -0.96
PUF2Q12221 ASP3-4YLR160C 1089 nt9.05□□□□□ -0.96
PUF2Q12221 CCT2YIL142W 1584 nt9.04□□□□□ -0.96
PUF2Q12221 ERG13YML126C 1476 nt9.04□□□□□ -0.96
PUF2Q12221 YDL086WYDL086W 822 nt9.04□□□□□ -0.96
PUF2Q12221 ILV3YJR016C 1758 nt9.02□□□□□ -0.97
PUF2Q12221 NIF3YGL221C 867 nt9.02□□□□□ -0.97
PUF2Q12221 SPS100YHR139C 981 nt9.02□□□□□ -0.97
PUF2Q12221 SPT20YOL148C 1815 nt9.02□□□□□ -0.97 RIP-Chip
PUF2Q12221 AIM1YAL046C 357 nt9.01□□□□□ -0.97
PUF2Q12221 TUB4YLR212C 1422 nt9.01□□□□□ -0.97
PUF2Q12221 GSF2YML048W 1212 nt9.01□□□□□ -0.97
PUF2Q12221 RRT8YOL048C 1029 nt9.01□□□□□ -0.97
PUF2Q12221 ADE8YDR408C 645 nt9□□□□□ -0.97
PUF2Q12221 OPI10YOL032W 741 nt9□□□□□ -0.97
PUF2Q12221 PUP1YOR157C 786 nt9□□□□□ -0.97
PUF2Q12221 LSB6YJL100W 1824 nt8.99□□□□□ -0.97
PUF2Q12221 YJL064WYJL064W 396 nt8.99□□□□□ -0.97
PUF2Q12221 NAP1YKR048C 1254 nt8.97□□□□□ -0.97
PUF2Q12221 BET2YPR176C 978 nt8.97□□□□□ -0.97
PUF2Q12221 SAC7YDR389W 1965 nt8.96□□□□□ -0.98
PUF2Q12221 PAR32YDL173W 888 nt8.94□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 26.3 ms