Protein–RNA interactions for Protein: Q12150

CSF1, Protein CSF1, yeastyeast

Predictions only

Length 2,958 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSF1Q12150 YBL086CYBL086C 1401 nt8.59□□□□□ -1.03
CSF1Q12150 YGR259CYGR259C 441 nt8.59□□□□□ -1.03
CSF1Q12150 CTI6YPL181W 1521 nt8.59□□□□□ -1.03
CSF1Q12150 SED1YDR077W 1017 nt8.58□□□□□ -1.04
CSF1Q12150 PRM5YIL117C 957 nt8.57□□□□□ -1.04
CSF1Q12150 DBP1YPL119C 1854 nt8.57□□□□□ -1.04
CSF1Q12150 NUC1YJL208C 990 nt8.57□□□□□ -1.04
CSF1Q12150 PAR32YDL173W 888 nt8.55□□□□□ -1.04
CSF1Q12150 MHF1YOL086W-A 273 nt8.54□□□□□ -1.04
CSF1Q12150 YPR126CYPR126C 309 nt8.53□□□□□ -1.04
CSF1Q12150 YOR268CYOR268C 399 nt8.52□□□□□ -1.04
CSF1Q12150 RPL12BYDR418W 498 nt8.52□□□□□ -1.05
CSF1Q12150 HIF1YLL022C 1158 nt8.52□□□□□ -1.05
CSF1Q12150 YMR262WYMR262W 942 nt8.52□□□□□ -1.05
CSF1Q12150 YCR025CYCR025C 411 nt8.51□□□□□ -1.05
CSF1Q12150 IGD1YFR017C 588 nt8.51□□□□□ -1.05
CSF1Q12150 SSN3YPL042C 1668 nt8.5□□□□□ -1.05
CSF1Q12150 YCP4YCR004C 744 nt8.5□□□□□ -1.05
CSF1Q12150 POT1YIL160C 1254 nt8.5□□□□□ -1.05
CSF1Q12150 MFG1YDL233W 1377 nt8.49□□□□□ -1.05
CSF1Q12150 BNI5YNL166C 1347 nt8.49□□□□□ -1.05
CSF1Q12150 TPS1YBR126C 1488 nt8.49□□□□□ -1.05
CSF1Q12150 QDR2YIL121W 1629 nt8.48□□□□□ -1.05
CSF1Q12150 YKR005CYKR005C 1578 nt8.48□□□□□ -1.05
CSF1Q12150 FUR4YBR021W 1902 nt8.47□□□□□ -1.05
CSF1Q12150 KAE1YKR038C 1161 nt8.47□□□□□ -1.05
CSF1Q12150 CDD1YLR245C 429 nt8.46□□□□□ -1.06
CSF1Q12150 CSM1YCR086W 573 nt8.45□□□□□ -1.06
CSF1Q12150 TGA1tA(UGC)A 73 nt8.43□□□□□ -1.06
CSF1Q12150 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt8.43□□□□□ -1.06
CSF1Q12150 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt8.43□□□□□ -1.06
CSF1Q12150 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt8.43□□□□□ -1.06
CSF1Q12150 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt8.43□□□□□ -1.06
CSF1Q12150 LEU9YOR108W 1815 nt8.43□□□□□ -1.06
CSF1Q12150 TOA2YKL058W 369 nt8.42□□□□□ -1.06
CSF1Q12150 YMR210WYMR210W 1350 nt8.42□□□□□ -1.06
CSF1Q12150 DDI1YER143W 1287 nt8.41□□□□□ -1.06
CSF1Q12150 RAS2YNL098C 969 nt8.41□□□□□ -1.06
CSF1Q12150 SNF1YDR477W 1902 nt8.41□□□□□ -1.06
CSF1Q12150 IRC24YIR036C 792 nt8.4□□□□□ -1.06
CSF1Q12150 IPL1YPL209C 1104 nt8.4□□□□□ -1.06
CSF1Q12150 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt8.4□□□□□ -1.07
CSF1Q12150 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt8.4□□□□□ -1.07
CSF1Q12150 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt8.4□□□□□ -1.07
CSF1Q12150 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt8.4□□□□□ -1.07
CSF1Q12150 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt8.4□□□□□ -1.07
CSF1Q12150 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt8.4□□□□□ -1.07
CSF1Q12150 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt8.4□□□□□ -1.07
CSF1Q12150 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt8.4□□□□□ -1.07
CSF1Q12150 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt8.4□□□□□ -1.07
CSF1Q12150 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt8.4□□□□□ -1.07
CSF1Q12150 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt8.4□□□□□ -1.07
CSF1Q12150 YMR007WYMR007W 381 nt8.4□□□□□ -1.07
CSF1Q12150 YMR103CYMR103C 363 nt8.4□□□□□ -1.07
CSF1Q12150 LIP1YMR298W 453 nt8.4□□□□□ -1.07
CSF1Q12150 SAM35YHR083W 990 nt8.39□□□□□ -1.07
CSF1Q12150 YMR206WYMR206W 942 nt8.39□□□□□ -1.07
CSF1Q12150 PHO23YNL097C 993 nt8.38□□□□□ -1.07
CSF1Q12150 RIB7YBR153W 735 nt8.38□□□□□ -1.07
CSF1Q12150 GND2YGR256W 1479 nt8.37□□□□□ -1.07
CSF1Q12150 SWM1YDR260C 513 nt8.37□□□□□ -1.07
CSF1Q12150 LSM5YER146W 282 nt8.37□□□□□ -1.07
CSF1Q12150 RPT5YOR117W 1305 nt8.37□□□□□ -1.07
CSF1Q12150 SPE2YOL052C 1191 nt8.37□□□□□ -1.07
CSF1Q12150 TOS1YBR162C 1368 nt8.37□□□□□ -1.07
CSF1Q12150 YOR343CYOR343C 327 nt8.36□□□□□ -1.07
CSF1Q12150 MSC1YML128C 1542 nt8.36□□□□□ -1.07
CSF1Q12150 UFO1YML088W 2007 nt8.35□□□□□ -1.07
CSF1Q12150 SAM2YDR502C 1155 nt8.35□□□□□ -1.07
CSF1Q12150 YPL251WYPL251W 303 nt8.33□□□□□ -1.08
CSF1Q12150 NIF3YGL221C 867 nt8.32□□□□□ -1.08
CSF1Q12150 PCP1YGR101W 1041 nt8.32□□□□□ -1.08
CSF1Q12150 LYS20YDL182W 1287 nt8.32□□□□□ -1.08
CSF1Q12150 NAS2YIL007C 663 nt8.31□□□□□ -1.08
CSF1Q12150 PAU21YOR394W 495 nt8.31□□□□□ -1.08
CSF1Q12150 PAU22YPL282C 495 nt8.31□□□□□ -1.08
CSF1Q12150 DAK2YFL053W 1776 nt8.31□□□□□ -1.08
CSF1Q12150 OYE2YHR179W 1203 nt8.31□□□□□ -1.08
CSF1Q12150 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt8.3□□□□□ -1.08
CSF1Q12150 PHB2YGR231C 933 nt8.29□□□□□ -1.08
CSF1Q12150 HOG1YLR113W 1308 nt8.29□□□□□ -1.08
CSF1Q12150 TRT2tT(CGU)K 72 nt8.28□□□□□ -1.08
CSF1Q12150 MOB1YIL106W 945 nt8.28□□□□□ -1.08
CSF1Q12150 BRR1YPR057W 1026 nt8.27□□□□□ -1.09
CSF1Q12150 HXT1YHR094C 1713 nt8.26□□□□□ -1.09
CSF1Q12150 GRH1YDR517W 1119 nt8.26□□□□□ -1.09
CSF1Q12150 FCY1YPR062W 477 nt8.26□□□□□ -1.09
CSF1Q12150 RSC8YFR037C 1674 nt8.26□□□□□ -1.09
CSF1Q12150 ADH3YMR083W 1128 nt8.25□□□□□ -1.09
CSF1Q12150 DLD2YDL178W 1593 nt8.24□□□□□ -1.09
CSF1Q12150 FLX1YIL134W 936 nt8.24□□□□□ -1.09
CSF1Q12150 YPS3YLR121C 1527 nt8.23□□□□□ -1.09
CSF1Q12150 SPS100YHR139C 981 nt8.23□□□□□ -1.09
CSF1Q12150 TMA23YMR269W 636 nt8.23□□□□□ -1.09
CSF1Q12150 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt8.23□□□□□ -1.09
CSF1Q12150 FLR1YBR008C 1647 nt8.23□□□□□ -1.09
CSF1Q12150 IMO32YGR031W 1029 nt8.22□□□□□ -1.09
CSF1Q12150 FUB1YCR076C 753 nt8.22□□□□□ -1.09
CSF1Q12150 RCR1YBR005W 642 nt8.21□□□□□ -1.09
CSF1Q12150 OYE3YPL171C 1203 nt8.21□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 62.5 ms