Protein–RNA interactions for Protein: Q12010

YPQ1, Probable vacuolar amino acid transporter YPQ1, yeastyeast

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPQ1Q12010 RDN37-1RDN37-1 5354 nt9.43□□□□□ -0.9
YPQ1Q12010 RDN37-2RDN37-2 5354 nt9.43□□□□□ -0.9
YPQ1Q12010 GAL3YDR009W 1563 nt9.43□□□□□ -0.9
YPQ1Q12010 YJL118WYJL118W 660 nt9.43□□□□□ -0.9
YPQ1Q12010 YJL064WYJL064W 396 nt9.42□□□□□ -0.9
YPQ1Q12010 SSN3YPL042C 1668 nt9.42□□□□□ -0.9
YPQ1Q12010 THI72YOR192C 1800 nt9.4□□□□□ -0.9
YPQ1Q12010 HIF1YLL022C 1158 nt9.4□□□□□ -0.9
YPQ1Q12010 GND2YGR256W 1479 nt9.4□□□□□ -0.91
YPQ1Q12010 SAM3YPL274W 1764 nt9.4□□□□□ -0.91
YPQ1Q12010 BNI5YNL166C 1347 nt9.38□□□□□ -0.91
YPQ1Q12010 RPT5YOR117W 1305 nt9.38□□□□□ -0.91
YPQ1Q12010 TAF13YML098W 504 nt9.38□□□□□ -0.91
YPQ1Q12010 TRT2tT(CGU)K 72 nt9.37□□□□□ -0.91
YPQ1Q12010 NUC1YJL208C 990 nt9.37□□□□□ -0.91
YPQ1Q12010 PHO23YNL097C 993 nt9.37□□□□□ -0.91
YPQ1Q12010 SNZ1YMR096W 894 nt9.36□□□□□ -0.91
YPQ1Q12010 PAU19YMR325W 375 nt9.36□□□□□ -0.91
YPQ1Q12010 BOR1YNL275W 1731 nt9.36□□□□□ -0.91
YPQ1Q12010 SHY1YGR112W 1170 nt9.35□□□□□ -0.91
YPQ1Q12010 RIB7YBR153W 735 nt9.35□□□□□ -0.91
YPQ1Q12010 UFO1YML088W 2007 nt9.34□□□□□ -0.91
YPQ1Q12010 MSC1YML128C 1542 nt9.33□□□□□ -0.92
YPQ1Q12010 YMR262WYMR262W 942 nt9.33□□□□□ -0.92
YPQ1Q12010 SLG1YOR008C 1137 nt9.3□□□□□ -0.92
YPQ1Q12010 SEC61YLR378C 1443 nt9.3□□□□□ -0.92
YPQ1Q12010 TPS1YBR126C 1488 nt9.28□□□□□ -0.92
YPQ1Q12010 SAM2YDR502C 1155 nt9.28□□□□□ -0.92
YPQ1Q12010 YPR126CYPR126C 309 nt9.27□□□□□ -0.93
YPQ1Q12010 OXA1YER154W 1209 nt9.26□□□□□ -0.93
YPQ1Q12010 TIM44YIL022W 1296 nt9.26□□□□□ -0.93
YPQ1Q12010 MHF1YOL086W-A 273 nt9.26□□□□□ -0.93
YPQ1Q12010 OYE3YPL171C 1203 nt9.26□□□□□ -0.93
YPQ1Q12010 POT1YIL160C 1254 nt9.25□□□□□ -0.93
YPQ1Q12010 URA6YKL024C 615 nt9.25□□□□□ -0.93
YPQ1Q12010 UME6YDR207C 2511 nt9.24□□□□□ -0.93
YPQ1Q12010 FUB1YCR076C 753 nt9.24□□□□□ -0.93
YPQ1Q12010 PAR32YDL173W 888 nt9.24□□□□□ -0.93
YPQ1Q12010 OYE2YHR179W 1203 nt9.24□□□□□ -0.93
YPQ1Q12010 RAS2YNL098C 969 nt9.24□□□□□ -0.93
YPQ1Q12010 TUB4YLR212C 1422 nt9.23□□□□□ -0.93
YPQ1Q12010 CTI6YPL181W 1521 nt9.23□□□□□ -0.93
YPQ1Q12010 YER188WYER188W 720 nt9.23□□□□□ -0.93
YPQ1Q12010 GSF2YML048W 1212 nt9.23□□□□□ -0.93
YPQ1Q12010 BIO5YNR056C 1686 nt9.23□□□□□ -0.93
YPQ1Q12010 DAK2YFL053W 1776 nt9.22□□□□□ -0.93
YPQ1Q12010 TIP1YBR067C 633 nt9.22□□□□□ -0.93
YPQ1Q12010 APS2YJR058C 444 nt9.21□□□□□ -0.94
YPQ1Q12010 EAF3YPR023C 1206 nt9.21□□□□□ -0.94
YPQ1Q12010 PET8YNL003C 855 nt9.2□□□□□ -0.94
YPQ1Q12010 IML3YBR107C 738 nt9.19□□□□□ -0.94
YPQ1Q12010 FLR1YBR008C 1647 nt9.17□□□□□ -0.94
YPQ1Q12010 DLD2YDL178W 1593 nt9.17□□□□□ -0.94
YPQ1Q12010 ZRT3YKL175W 1512 nt9.17□□□□□ -0.94
YPQ1Q12010 YJR114WYJR114W 393 nt9.17□□□□□ -0.94
YPQ1Q12010 NIF3YGL221C 867 nt9.16□□□□□ -0.94
YPQ1Q12010 TMA23YMR269W 636 nt9.15□□□□□ -0.94
YPQ1Q12010 YNL024CYNL024C 741 nt9.14□□□□□ -0.95
YPQ1Q12010 DDI1YER143W 1287 nt9.12□□□□□ -0.95
YPQ1Q12010 RIB1YBL033C 1038 nt9.11□□□□□ -0.95
YPQ1Q12010 OSH7YHR001W 1314 nt9.1□□□□□ -0.95
YPQ1Q12010 YPS3YLR121C 1527 nt9.1□□□□□ -0.95
YPQ1Q12010 RSC8YFR037C 1674 nt9.1□□□□□ -0.95
YPQ1Q12010 FMS1YMR020W 1527 nt9.09□□□□□ -0.95
YPQ1Q12010 SOL2YCR073W-A 948 nt9.08□□□□□ -0.96
YPQ1Q12010 LSM5YER146W 282 nt9.08□□□□□ -0.96
YPQ1Q12010 IGD1YFR017C 588 nt9.08□□□□□ -0.96
YPQ1Q12010 YJL067WYJL067W 351 nt9.08□□□□□ -0.96
YPQ1Q12010 ERG6YML008C 1152 nt9.08□□□□□ -0.96
YPQ1Q12010 HEM13YDR044W 987 nt9.07□□□□□ -0.96
YPQ1Q12010 IMO32YGR031W 1029 nt9.07□□□□□ -0.96
YPQ1Q12010 YIA6YIL006W 1122 nt9.07□□□□□ -0.96
YPQ1Q12010 SOD2YHR008C 702 nt9.05□□□□□ -0.96
YPQ1Q12010 SPS100YHR139C 981 nt9.04□□□□□ -0.96
YPQ1Q12010 SPP2YOR148C 558 nt9.04□□□□□ -0.96
YPQ1Q12010 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt9.03□□□□□ -0.96
YPQ1Q12010 TAT2YOL020W 1779 nt9.02□□□□□ -0.97
YPQ1Q12010 ALG12YNR030W 1656 nt9.02□□□□□ -0.97
YPQ1Q12010 YCP4YCR004C 744 nt9.01□□□□□ -0.97
YPQ1Q12010 YDR455CYDR455C 309 nt9.01□□□□□ -0.97
YPQ1Q12010 CDD1YLR245C 429 nt9.01□□□□□ -0.97
YPQ1Q12010 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt8.99□□□□□ -0.97
YPQ1Q12010 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt8.99□□□□□ -0.97
YPQ1Q12010 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt8.99□□□□□ -0.97
YPQ1Q12010 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt8.99□□□□□ -0.97
YPQ1Q12010 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt8.99□□□□□ -0.97
YPQ1Q12010 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt8.99□□□□□ -0.97
YPQ1Q12010 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt8.99□□□□□ -0.97
YPQ1Q12010 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt8.99□□□□□ -0.97
YPQ1Q12010 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt8.99□□□□□ -0.97
YPQ1Q12010 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt8.99□□□□□ -0.97
YPQ1Q12010 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt8.99□□□□□ -0.97
YPQ1Q12010 NAS2YIL007C 663 nt8.99□□□□□ -0.97
YPQ1Q12010 SAM50YNL026W 1455 nt8.99□□□□□ -0.97
YPQ1Q12010 CWC15YDR163W 528 nt8.98□□□□□ -0.97
YPQ1Q12010 IPL1YPL209C 1104 nt8.98□□□□□ -0.97
YPQ1Q12010 ACH1YBL015W 1581 nt8.97□□□□□ -0.97
YPQ1Q12010 PBP1YGR178C 2169 nt8.96□□□□□ -0.97
YPQ1Q12010 YCR025CYCR025C 411 nt8.96□□□□□ -0.98
YPQ1Q12010 KRE1YNL322C 942 nt8.96□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.2 ms