Protein–RNA interactions for Protein: Q05580

HEL2, E3 ubiquitin-protein ligase HEL2, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HEL2Q05580 LOT5YKL183W 921 nt9.48□□□□□ -0.89
HEL2Q05580 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt9.47□□□□□ -0.89
HEL2Q05580 YAR028WYAR028W 705 nt9.46□□□□□ -0.9
HEL2Q05580 ZRT3YKL175W 1512 nt9.46□□□□□ -0.9
HEL2Q05580 YER190C-AYER190C-A 576 nt9.44□□□□□ -0.9
HEL2Q05580 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt9.44□□□□□ -0.9
HEL2Q05580 YML133W-AYML133W-A 576 nt9.44□□□□□ -0.9
HEL2Q05580 LIP1YMR298W 453 nt9.44□□□□□ -0.9
HEL2Q05580 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt9.44□□□□□ -0.9
HEL2Q05580 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt9.44□□□□□ -0.9
HEL2Q05580 AKR2YOR034C 2250 nt9.42□□□□□ -0.9
HEL2Q05580 APT2YDR441C 546 nt9.42□□□□□ -0.9
HEL2Q05580 INA1YLR413W 2028 nt9.41□□□□□ -0.9
HEL2Q05580 SED1YDR077W 1017 nt9.41□□□□□ -0.9
HEL2Q05580 PUP1YOR157C 786 nt9.41□□□□□ -0.9
HEL2Q05580 DBP1YPL119C 1854 nt9.4□□□□□ -0.9
HEL2Q05580 MTG2YHR168W 1557 nt9.4□□□□□ -0.9
HEL2Q05580 RIM8YGL045W 1629 nt9.38□□□□□ -0.91
HEL2Q05580 SEN2YLR105C 1134 nt9.38□□□□□ -0.91
HEL2Q05580 ZTA1YBR046C 1005 nt9.38□□□□□ -0.91
HEL2Q05580 ALP1YNL270C 1722 nt9.38□□□□□ -0.91
HEL2Q05580 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt9.37□□□□□ -0.91
HEL2Q05580 SHY1YGR112W 1170 nt9.37□□□□□ -0.91
HEL2Q05580 SMM1YNR015W 1155 nt9.37□□□□□ -0.91
HEL2Q05580 TOA2YKL058W 369 nt9.36□□□□□ -0.91
HEL2Q05580 YBL086CYBL086C 1401 nt9.35□□□□□ -0.91
HEL2Q05580 YJL067WYJL067W 351 nt9.34□□□□□ -0.91
HEL2Q05580 NAP1YKR048C 1254 nt9.34□□□□□ -0.91
HEL2Q05580 RIB2YOL066C 1776 nt9.34□□□□□ -0.91
HEL2Q05580 GNP1YDR508C 1992 nt9.33□□□□□ -0.92
HEL2Q05580 PGC1YPL206C 966 nt9.32□□□□□ -0.92
HEL2Q05580 BRR1YPR057W 1026 nt9.32□□□□□ -0.92
HEL2Q05580 ACO2YJL200C 2370 nt9.32□□□□□ -0.92
HEL2Q05580 FCY21YER060W 1587 nt9.32□□□□□ -0.92
HEL2Q05580 LSB3YFR024C-A 1380 nt9.3□□□□□ -0.92
HEL2Q05580 RPC82YPR190C 1965 nt9.3□□□□□ -0.92
HEL2Q05580 SPT20YOL148C 1815 nt9.29□□□□□ -0.92
HEL2Q05580 YBR232CYBR232C 360 nt9.29□□□□□ -0.92
HEL2Q05580 GND2YGR256W 1479 nt9.28□□□□□ -0.92
HEL2Q05580 MEP3YPR138C 1470 nt9.27□□□□□ -0.93
HEL2Q05580 HXT12YIL170W 1374 nt9.26□□□□□ -0.93
HEL2Q05580 YMR103CYMR103C 363 nt9.26□□□□□ -0.93
HEL2Q05580 NSG2YNL156C 900 nt9.26□□□□□ -0.93
HEL2Q05580 YPL251WYPL251W 303 nt9.26□□□□□ -0.93
HEL2Q05580 YLR173WYLR173W 1827 nt9.26□□□□□ -0.93
HEL2Q05580 PAU5YFL020C 369 nt9.25□□□□□ -0.93
HEL2Q05580 LEU9YOR108W 1815 nt9.25□□□□□ -0.93
HEL2Q05580 CWC15YDR163W 528 nt9.24□□□□□ -0.93
HEL2Q05580 URA6YKL024C 615 nt9.24□□□□□ -0.93
HEL2Q05580 SAM2YDR502C 1155 nt9.23□□□□□ -0.93
HEL2Q05580 YJL064WYJL064W 396 nt9.22□□□□□ -0.93
HEL2Q05580 OYE3YPL171C 1203 nt9.22□□□□□ -0.93
HEL2Q05580 PRY1YJL079C 900 nt9.21□□□□□ -0.94
HEL2Q05580 PET8YNL003C 855 nt9.21□□□□□ -0.94
HEL2Q05580 YGL114WYGL114W 2178 nt9.2□□□□□ -0.94
HEL2Q05580 STP3YLR375W 1032 nt9.2□□□□□ -0.94
HEL2Q05580 UFO1YML088W 2007 nt9.19□□□□□ -0.94
HEL2Q05580 TRT2tT(CGU)K 72 nt9.19□□□□□ -0.94
HEL2Q05580 TOM71YHR117W 1920 nt9.19□□□□□ -0.94
HEL2Q05580 VRG4YGL225W 1014 nt9.18□□□□□ -0.94
HEL2Q05580 PAU19YMR325W 375 nt9.17□□□□□ -0.94
HEL2Q05580 YJL055WYJL055W 738 nt9.16□□□□□ -0.94
HEL2Q05580 TPN1YGL186C 1740 nt9.16□□□□□ -0.94
HEL2Q05580 CCT5YJR064W 1689 nt9.16□□□□□ -0.94
HEL2Q05580 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt9.14□□□□□ -0.95
HEL2Q05580 YJR114WYJR114W 393 nt9.14□□□□□ -0.95
HEL2Q05580 YNL024CYNL024C 741 nt9.14□□□□□ -0.95
HEL2Q05580 SLG1YOR008C 1137 nt9.13□□□□□ -0.95
HEL2Q05580 YDR306CYDR306C 1437 nt9.13□□□□□ -0.95
HEL2Q05580 THI6YPL214C 1623 nt9.12□□□□□ -0.95
HEL2Q05580 SPP2YOR148C 558 nt9.11□□□□□ -0.95
HEL2Q05580 YOR325WYOR325W 474 nt9.11□□□□□ -0.95
HEL2Q05580 MUP1YGR055W 1725 nt9.11□□□□□ -0.95
HEL2Q05580 TIM44YIL022W 1296 nt9.1□□□□□ -0.95
HEL2Q05580 SNU66YOR308C 1764 nt9.09□□□□□ -0.95
HEL2Q05580 SEC61YLR378C 1443 nt9.09□□□□□ -0.95
HEL2Q05580 ILV3YJR016C 1758 nt9.09□□□□□ -0.95
HEL2Q05580 MTO1YGL236C 2010 nt9.09□□□□□ -0.95
HEL2Q05580 RSC8YFR037C 1674 nt9.08□□□□□ -0.96
HEL2Q05580 RTG2YGL252C 1767 nt9.07□□□□□ -0.96
HEL2Q05580 FMS1YMR020W 1527 nt9.07□□□□□ -0.96
HEL2Q05580 BNI5YNL166C 1347 nt9.05□□□□□ -0.96
HEL2Q05580 SFL1YOR140W 2301 nt9.05□□□□□ -0.96
HEL2Q05580 FLR1YBR008C 1647 nt9.05□□□□□ -0.96
HEL2Q05580 VPS62YGR141W 1404 nt9.05□□□□□ -0.96
HEL2Q05580 CSM1YCR086W 573 nt9.04□□□□□ -0.96
HEL2Q05580 ADE2YOR128C 1716 nt9.04□□□□□ -0.96
HEL2Q05580 DLD2YDL178W 1593 nt9.03□□□□□ -0.96
HEL2Q05580 NUC1YJL208C 990 nt9.03□□□□□ -0.96
HEL2Q05580 GCD11YER025W 1584 nt9.03□□□□□ -0.96
HEL2Q05580 CCT2YIL142W 1584 nt9.03□□□□□ -0.96
HEL2Q05580 YPS3YLR121C 1527 nt9.02□□□□□ -0.97
HEL2Q05580 GAL3YDR009W 1563 nt9.01□□□□□ -0.97
HEL2Q05580 DUR3YHL016C 2208 nt9□□□□□ -0.97
HEL2Q05580 YER188WYER188W 720 nt9□□□□□ -0.97
HEL2Q05580 TAF13YML098W 504 nt9□□□□□ -0.97
HEL2Q05580 RAS2YNL098C 969 nt9□□□□□ -0.97
HEL2Q05580 BET2YPR176C 978 nt9□□□□□ -0.97
HEL2Q05580 RIB1YBL033C 1038 nt8.99□□□□□ -0.97
HEL2Q05580 TIP1YBR067C 633 nt8.99□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.6 ms