Protein–RNA interactions for Protein: Q04006

UPS3, Protein UPS3, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UPS3Q04006 ODC1YPL134C 933 nt7.34□□□□□ -1.23
UPS3Q04006 LPD1YFL018C 1500 nt7.33□□□□□ -1.24
UPS3Q04006 UTH1YKR042W 1098 nt7.33□□□□□ -1.24
UPS3Q04006 ALP1YNL270C 1722 nt7.32□□□□□ -1.24
UPS3Q04006 LSB6YJL100W 1824 nt7.32□□□□□ -1.24
UPS3Q04006 TOA2YKL058W 369 nt7.32□□□□□ -1.24
UPS3Q04006 PET8YNL003C 855 nt7.32□□□□□ -1.24
UPS3Q04006 DAK2YFL053W 1776 nt7.31□□□□□ -1.24
UPS3Q04006 YER190C-AYER190C-A 576 nt7.31□□□□□ -1.24
UPS3Q04006 UFD1YGR048W 1086 nt7.31□□□□□ -1.24
UPS3Q04006 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt7.31□□□□□ -1.24
UPS3Q04006 YML133W-AYML133W-A 576 nt7.31□□□□□ -1.24
UPS3Q04006 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt7.31□□□□□ -1.24
UPS3Q04006 SFL1YOR140W 2301 nt7.31□□□□□ -1.24
UPS3Q04006 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt7.31□□□□□ -1.24
UPS3Q04006 MTG2YHR168W 1557 nt7.3□□□□□ -1.24
UPS3Q04006 LEU9YOR108W 1815 nt7.3□□□□□ -1.24
UPS3Q04006 RPL4BYDR012W 1089 nt7.3□□□□□ -1.24
UPS3Q04006 THI74YDR438W 1113 nt7.3□□□□□ -1.24
UPS3Q04006 COQ2YNR041C 1119 nt7.3□□□□□ -1.24
UPS3Q04006 RPL4AYBR031W 1089 nt7.3□□□□□ -1.24
UPS3Q04006 AKR2YOR034C 2250 nt7.3□□□□□ -1.24
UPS3Q04006 FRA1YLL029W 2250 nt7.29□□□□□ -1.24
UPS3Q04006 OYE3YPL171C 1203 nt7.29□□□□□ -1.24
UPS3Q04006 BRR1YPR057W 1026 nt7.29□□□□□ -1.24
UPS3Q04006 HEM14YER014W 1620 nt7.27□□□□□ -1.25
UPS3Q04006 YRF1-2YER190W 5046 nt7.27□□□□□ -1.25
UPS3Q04006 YDR094WYDR094W 336 nt7.27□□□□□ -1.25
UPS3Q04006 SAM2YDR502C 1155 nt7.27□□□□□ -1.25
UPS3Q04006 HXT10YFL011W 1641 nt7.27□□□□□ -1.25
UPS3Q04006 FIT1YDR534C 1587 nt7.26□□□□□ -1.25
UPS3Q04006 UFO1YML088W 2007 nt7.26□□□□□ -1.25
UPS3Q04006 NBA1YOL070C 1506 nt7.26□□□□□ -1.25
UPS3Q04006 TRT2tT(CGU)K 72 nt7.25□□□□□ -1.25
UPS3Q04006 NAT4YMR069W 858 nt7.25□□□□□ -1.25
UPS3Q04006 SSL2YIL143C 2532 nt7.25□□□□□ -1.25
UPS3Q04006 LSB5YCL034W 1065 nt7.24□□□□□ -1.25
UPS3Q04006 VPS62YGR141W 1404 nt7.24□□□□□ -1.25
UPS3Q04006 GND2YGR256W 1479 nt7.23□□□□□ -1.25
UPS3Q04006 AIM45YPR004C 1035 nt7.22□□□□□ -1.25
UPS3Q04006 XYL2YLR070C 1071 nt7.21□□□□□ -1.26
UPS3Q04006 YPL251WYPL251W 303 nt7.21□□□□□ -1.26
UPS3Q04006 QDR2YIL121W 1629 nt7.2□□□□□ -1.26
UPS3Q04006 MSF1YPR047W 1410 nt7.2□□□□□ -1.26
UPS3Q04006 YDL086WYDL086W 822 nt7.2□□□□□ -1.26
UPS3Q04006 MDM35YKL053C-A 261 nt7.2□□□□□ -1.26
UPS3Q04006 PAU16YKL224C 372 nt7.19□□□□□ -1.26
UPS3Q04006 SPP2YOR148C 558 nt7.19□□□□□ -1.26
UPS3Q04006 ZTA1YBR046C 1005 nt7.19□□□□□ -1.26
UPS3Q04006 YGL034CYGL034C 366 nt7.18□□□□□ -1.26
UPS3Q04006 RPS14BYJL191W 417 nt7.18□□□□□ -1.26
UPS3Q04006 YMR103CYMR103C 363 nt7.17□□□□□ -1.26
UPS3Q04006 DIG1YPL049C 1359 nt7.17□□□□□ -1.26
UPS3Q04006 SEC61YLR378C 1443 nt7.17□□□□□ -1.26
UPS3Q04006 OXA1YER154W 1209 nt7.15□□□□□ -1.26
UPS3Q04006 TSC10YBR265W 963 nt7.15□□□□□ -1.26
UPS3Q04006 FMS1YMR020W 1527 nt7.14□□□□□ -1.27
UPS3Q04006 PHO23YNL097C 993 nt7.14□□□□□ -1.27
UPS3Q04006 MIM1YOL026C 342 nt7.14□□□□□ -1.27
UPS3Q04006 AGP3YFL055W 1677 nt7.13□□□□□ -1.27
UPS3Q04006 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt7.13□□□□□ -1.27
UPS3Q04006 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt7.13□□□□□ -1.27
UPS3Q04006 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt7.13□□□□□ -1.27
UPS3Q04006 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt7.13□□□□□ -1.27
UPS3Q04006 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt7.13□□□□□ -1.27
UPS3Q04006 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt7.13□□□□□ -1.27
UPS3Q04006 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt7.13□□□□□ -1.27
UPS3Q04006 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt7.13□□□□□ -1.27
UPS3Q04006 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt7.13□□□□□ -1.27
UPS3Q04006 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt7.13□□□□□ -1.27
UPS3Q04006 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt7.13□□□□□ -1.27
UPS3Q04006 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt7.13□□□□□ -1.27
UPS3Q04006 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt7.13□□□□□ -1.27
UPS3Q04006 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt7.13□□□□□ -1.27
UPS3Q04006 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt7.13□□□□□ -1.27
UPS3Q04006 DUR3YHL016C 2208 nt7.13□□□□□ -1.27
UPS3Q04006 MET30YIL046W 1923 nt7.13□□□□□ -1.27
UPS3Q04006 GID8YMR135C 1368 nt7.12□□□□□ -1.27
UPS3Q04006 NSG2YNL156C 900 nt7.12□□□□□ -1.27
UPS3Q04006 YPS3YLR121C 1527 nt7.11□□□□□ -1.27
UPS3Q04006 HBS1YKR084C 1836 nt7.11□□□□□ -1.27
UPS3Q04006 MRS6YOR370C 1812 nt7.11□□□□□ -1.27
UPS3Q04006 APT2YDR441C 546 nt7.11□□□□□ -1.27
UPS3Q04006 SBA1YKL117W 651 nt7.11□□□□□ -1.27
UPS3Q04006 YNL190WYNL190W 615 nt7.11□□□□□ -1.27
UPS3Q04006 THI6YPL214C 1623 nt7.1□□□□□ -1.27
UPS3Q04006 ACH1YBL015W 1581 nt7.1□□□□□ -1.27
UPS3Q04006 DUS3YLR401C 2007 nt7.1□□□□□ -1.27
UPS3Q04006 DLD2YDL178W 1593 nt7.09□□□□□ -1.27
UPS3Q04006 LAS17YOR181W 1902 nt7.09□□□□□ -1.27
UPS3Q04006 YKL133CYKL133C 1392 nt7.08□□□□□ -1.28
UPS3Q04006 YER188WYER188W 720 nt7.07□□□□□ -1.28
UPS3Q04006 LSR1LSR1 1175 nt7.07□□□□□ -1.28
UPS3Q04006 SDH5YOL071W 489 nt7.07□□□□□ -1.28
UPS3Q04006 FLR1YBR008C 1647 nt7.07□□□□□ -1.28
UPS3Q04006 ADE5,7YGL234W 2409 nt7.07□□□□□ -1.28
UPS3Q04006 RTG2YGL252C 1767 nt7.06□□□□□ -1.28
UPS3Q04006 CWP2YKL096W-A 279 nt7.05□□□□□ -1.28
UPS3Q04006 YLR279WYLR279W 390 nt7.05□□□□□ -1.28
UPS3Q04006 OSH7YHR001W 1314 nt7.04□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 73.3 ms