Protein–RNA interactions for Protein: Q02785

PDR12, ATP-dependent permease PDR12, yeastyeast

Predictions only

Length 1,511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PDR12Q02785 YGR259CYGR259C 441 nt13.76□□□□□ -0.21
PDR12Q02785 APS2YJR058C 444 nt13.76□□□□□ -0.21
PDR12Q02785 TUB4YLR212C 1422 nt13.74□□□□□ -0.21
PDR12Q02785 YIA6YIL006W 1122 nt13.74□□□□□ -0.21
PDR12Q02785 YKR005CYKR005C 1578 nt13.71□□□□□ -0.21
PDR12Q02785 TOA2YKL058W 369 nt13.7□□□□□ -0.22
PDR12Q02785 POP2YNR052C 1302 nt13.69□□□□□ -0.22
PDR12Q02785 SSN3YPL042C 1668 nt13.69□□□□□ -0.22
PDR12Q02785 QDR2YIL121W 1629 nt13.68□□□□□ -0.22
PDR12Q02785 YBL086CYBL086C 1401 nt13.67□□□□□ -0.22
PDR12Q02785 SAM3YPL274W 1764 nt13.67□□□□□ -0.22
PDR12Q02785 GSF2YML048W 1212 nt13.66□□□□□ -0.22
PDR12Q02785 RIB7YBR153W 735 nt13.65□□□□□ -0.22
PDR12Q02785 BNI5YNL166C 1347 nt13.65□□□□□ -0.22
PDR12Q02785 RPT5YOR117W 1305 nt13.64□□□□□ -0.23
PDR12Q02785 IRC24YIR036C 792 nt13.64□□□□□ -0.23
PDR12Q02785 BRR1YPR057W 1026 nt13.64□□□□□ -0.23
PDR12Q02785 POT1YIL160C 1254 nt13.63□□□□□ -0.23
PDR12Q02785 YER152W-AYER152W-A 567 nt13.62□□□□□ -0.23
PDR12Q02785 GND2YGR256W 1479 nt13.62□□□□□ -0.23
PDR12Q02785 MHF1YOL086W-A 273 nt13.59□□□□□ -0.23
PDR12Q02785 HXT1YHR094C 1713 nt13.58□□□□□ -0.24
PDR12Q02785 CTI6YPL181W 1521 nt13.58□□□□□ -0.24
PDR12Q02785 YPR126CYPR126C 309 nt13.57□□□□□ -0.24
PDR12Q02785 ACO2YJL200C 2370 nt13.56□□□□□ -0.24
PDR12Q02785 TPS1YBR126C 1488 nt13.55□□□□□ -0.24
PDR12Q02785 SAM2YDR502C 1155 nt13.54□□□□□ -0.24
PDR12Q02785 SAM50YNL026W 1455 nt13.54□□□□□ -0.24
PDR12Q02785 YCP4YCR004C 744 nt13.54□□□□□ -0.24
PDR12Q02785 YCR025CYCR025C 411 nt13.54□□□□□ -0.24
PDR12Q02785 HIF1YLL022C 1158 nt13.54□□□□□ -0.24
PDR12Q02785 KRE1YNL322C 942 nt13.51□□□□□ -0.25
PDR12Q02785 TRT2tT(CGU)K 72 nt13.49□□□□□ -0.25
PDR12Q02785 OYE2YHR179W 1203 nt13.47□□□□□ -0.25
PDR12Q02785 PHO23YNL097C 993 nt13.47□□□□□ -0.25
PDR12Q02785 DBP1YPL119C 1854 nt13.47□□□□□ -0.25
PDR12Q02785 BUD20YLR074C 501 nt13.45□□□□□ -0.26
PDR12Q02785 NIF3YGL221C 867 nt13.44□□□□□ -0.26
PDR12Q02785 BMT6YLR063W 1098 nt13.44□□□□□ -0.26
PDR12Q02785 LEU9YOR108W 1815 nt13.43□□□□□ -0.26
PDR12Q02785 DDI1YER143W 1287 nt13.43□□□□□ -0.26
PDR12Q02785 IGD1YFR017C 588 nt13.43□□□□□ -0.26
PDR12Q02785 RAS2YNL098C 969 nt13.41□□□□□ -0.26
PDR12Q02785 DAK2YFL053W 1776 nt13.4□□□□□ -0.26
PDR12Q02785 MSC1YML128C 1542 nt13.38□□□□□ -0.27
PDR12Q02785 LYS20YDL182W 1287 nt13.38□□□□□ -0.27
PDR12Q02785 PRP4YPR178W 1398 nt13.36□□□□□ -0.27
PDR12Q02785 CDD1YLR245C 429 nt13.35□□□□□ -0.27
PDR12Q02785 YNL024CYNL024C 741 nt13.35□□□□□ -0.27
PDR12Q02785 IML3YBR107C 738 nt13.35□□□□□ -0.27
PDR12Q02785 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt13.34□□□□□ -0.27
PDR12Q02785 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt13.34□□□□□ -0.27
PDR12Q02785 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt13.34□□□□□ -0.27
PDR12Q02785 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt13.34□□□□□ -0.27
PDR12Q02785 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt13.34□□□□□ -0.27
PDR12Q02785 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt13.34□□□□□ -0.27
PDR12Q02785 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt13.34□□□□□ -0.27
PDR12Q02785 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt13.34□□□□□ -0.27
PDR12Q02785 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt13.34□□□□□ -0.27
PDR12Q02785 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt13.34□□□□□ -0.27
PDR12Q02785 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt13.34□□□□□ -0.27
PDR12Q02785 NAS2YIL007C 663 nt13.34□□□□□ -0.27
PDR12Q02785 YER188WYER188W 720 nt13.33□□□□□ -0.28
PDR12Q02785 UFO1YML088W 2007 nt13.31□□□□□ -0.28
PDR12Q02785 LSM5YER146W 282 nt13.3□□□□□ -0.28
PDR12Q02785 SPE2YOL052C 1191 nt13.3□□□□□ -0.28
PDR12Q02785 IPL1YPL209C 1104 nt13.3□□□□□ -0.28
PDR12Q02785 EAF3YPR023C 1206 nt13.3□□□□□ -0.28
PDR12Q02785 DPS1YLL018C 1674 nt13.29□□□□□ -0.28
PDR12Q02785 OYE3YPL171C 1203 nt13.29□□□□□ -0.28
PDR12Q02785 SEC61YLR378C 1443 nt13.29□□□□□ -0.28
PDR12Q02785 FUB1YCR076C 753 nt13.29□□□□□ -0.28
PDR12Q02785 SHY1YGR112W 1170 nt13.29□□□□□ -0.28
PDR12Q02785 PAC11YDR488C 1602 nt13.27□□□□□ -0.29
PDR12Q02785 TMA23YMR269W 636 nt13.26□□□□□ -0.29
PDR12Q02785 FLX1YIL134W 936 nt13.24□□□□□ -0.29
PDR12Q02785 SNF1YDR477W 1902 nt13.22□□□□□ -0.29
PDR12Q02785 TGA1tA(UGC)A 73 nt13.21□□□□□ -0.29
PDR12Q02785 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt13.21□□□□□ -0.29
PDR12Q02785 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt13.21□□□□□ -0.29
PDR12Q02785 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt13.21□□□□□ -0.29
PDR12Q02785 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt13.21□□□□□ -0.29
PDR12Q02785 SWM1YDR260C 513 nt13.21□□□□□ -0.29
PDR12Q02785 SPS100YHR139C 981 nt13.19□□□□□ -0.3
PDR12Q02785 FCY1YPR062W 477 nt13.19□□□□□ -0.3
PDR12Q02785 ADE8YDR408C 645 nt13.18□□□□□ -0.3
PDR12Q02785 FLR1YBR008C 1647 nt13.17□□□□□ -0.3
PDR12Q02785 OSH7YHR001W 1314 nt13.15□□□□□ -0.3
PDR12Q02785 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt13.14□□□□□ -0.31
PDR12Q02785 ADH3YMR083W 1128 nt13.14□□□□□ -0.31
PDR12Q02785 YMR007WYMR007W 381 nt13.13□□□□□ -0.31
PDR12Q02785 ABZ2YMR289W 1125 nt13.13□□□□□ -0.31
PDR12Q02785 RSC8YFR037C 1674 nt13.12□□□□□ -0.31
PDR12Q02785 PCP1YGR101W 1041 nt13.12□□□□□ -0.31
PDR12Q02785 DLD2YDL178W 1593 nt13.11□□□□□ -0.31
PDR12Q02785 SOL2YCR073W-A 948 nt13.1□□□□□ -0.31
PDR12Q02785 MOB1YIL106W 945 nt13.1□□□□□ -0.31
PDR12Q02785 PET8YNL003C 855 nt13.08□□□□□ -0.31
PDR12Q02785 IMO32YGR031W 1029 nt13.08□□□□□ -0.32
PDR12Q02785 PHB2YGR231C 933 nt13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 8.1 ms