Protein–RNA interactions for Protein: P53978

HEF3, Elongation factor 3B, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HEF3P53978 FLR1YBR008C 1647 nt11.59□□□□□ -0.55
HEF3P53978 SAM3YPL274W 1764 nt11.56□□□□□ -0.56
HEF3P53978 HXT12YIL170W 1374 nt11.56□□□□□ -0.56
HEF3P53978 FUN14YAL008W 597 nt11.55□□□□□ -0.56
HEF3P53978 PET8YNL003C 855 nt11.55□□□□□ -0.56
HEF3P53978 STE4YOR212W 1272 nt11.53□□□□□ -0.56
HEF3P53978 PHO23YNL097C 993 nt11.52□□□□□ -0.57
HEF3P53978 MSC1YML128C 1542 nt11.51□□□□□ -0.57
HEF3P53978 FMS1YMR020W 1527 nt11.51□□□□□ -0.57
HEF3P53978 DLD2YDL178W 1593 nt11.51□□□□□ -0.57
HEF3P53978 YJL118WYJL118W 660 nt11.51□□□□□ -0.57
HEF3P53978 NUC1YJL208C 990 nt11.51□□□□□ -0.57
HEF3P53978 YLR349WYLR349W 507 nt11.51□□□□□ -0.57
HEF3P53978 LSB5YCL034W 1065 nt11.51□□□□□ -0.57
HEF3P53978 RSC8YFR037C 1674 nt11.5□□□□□ -0.57
HEF3P53978 FUB1YCR076C 753 nt11.5□□□□□ -0.57
HEF3P53978 SEC61YLR378C 1443 nt11.5□□□□□ -0.57
HEF3P53978 RPC82YPR190C 1965 nt11.49□□□□□ -0.57
HEF3P53978 SPP2YOR148C 558 nt11.49□□□□□ -0.57
HEF3P53978 CWC15YDR163W 528 nt11.48□□□□□ -0.57
HEF3P53978 GPN2YOR262W 1044 nt11.48□□□□□ -0.57
HEF3P53978 YER188WYER188W 720 nt11.47□□□□□ -0.57
HEF3P53978 GAL3YDR009W 1563 nt11.46□□□□□ -0.57
HEF3P53978 YPS3YLR121C 1527 nt11.46□□□□□ -0.57
HEF3P53978 RPT5YOR117W 1305 nt11.46□□□□□ -0.57
HEF3P53978 RDN25-1RDN25-1 3396 nt11.46□□□□□ -0.58
HEF3P53978 RDN25-2RDN25-2 3396 nt11.46□□□□□ -0.58
HEF3P53978 RAS2YNL098C 969 nt11.45□□□□□ -0.58
HEF3P53978 INA1YLR413W 2028 nt11.45□□□□□ -0.58
HEF3P53978 TPS1YBR126C 1488 nt11.44□□□□□ -0.58
HEF3P53978 YEL008WYEL008W 381 nt11.43□□□□□ -0.58
HEF3P53978 HEM13YDR044W 987 nt11.42□□□□□ -0.58
HEF3P53978 OXA1YER154W 1209 nt11.42□□□□□ -0.58
HEF3P53978 ACH1YBL015W 1581 nt11.41□□□□□ -0.58
HEF3P53978 ADH7YCR105W 1086 nt11.4□□□□□ -0.58
HEF3P53978 SNZ1YMR096W 894 nt11.38□□□□□ -0.59
HEF3P53978 YOR325WYOR325W 474 nt11.38□□□□□ -0.59
HEF3P53978 TAT2YOL020W 1779 nt11.37□□□□□ -0.59
HEF3P53978 PAU15YIR041W 375 nt11.37□□□□□ -0.59
HEF3P53978 EAF3YPR023C 1206 nt11.37□□□□□ -0.59
HEF3P53978 OYE2YHR179W 1203 nt11.36□□□□□ -0.59
HEF3P53978 OSH7YHR001W 1314 nt11.35□□□□□ -0.59
HEF3P53978 DDI1YER143W 1287 nt11.35□□□□□ -0.59
HEF3P53978 SOL2YCR073W-A 948 nt11.34□□□□□ -0.59
HEF3P53978 YDR455CYDR455C 309 nt11.32□□□□□ -0.6
HEF3P53978 LSM5YER146W 282 nt11.32□□□□□ -0.6
HEF3P53978 CCT5YJR064W 1689 nt11.31□□□□□ -0.6
HEF3P53978 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt11.31□□□□□ -0.6
HEF3P53978 CPD1YGR247W 720 nt11.3□□□□□ -0.6
HEF3P53978 RIB7YBR153W 735 nt11.3□□□□□ -0.6
HEF3P53978 SPT20YOL148C 1815 nt11.28□□□□□ -0.6
HEF3P53978 TMA23YMR269W 636 nt11.26□□□□□ -0.61
HEF3P53978 CMP2YML057W 1815 nt11.25□□□□□ -0.61
HEF3P53978 THI72YOR192C 1800 nt11.25□□□□□ -0.61
HEF3P53978 YNL024CYNL024C 741 nt11.24□□□□□ -0.61
HEF3P53978 VPS62YGR141W 1404 nt11.24□□□□□ -0.61
HEF3P53978 CCT2YIL142W 1584 nt11.24□□□□□ -0.61
HEF3P53978 RDN37-1RDN37-1 5354 nt11.19□□□□□ -0.62
HEF3P53978 RDN37-2RDN37-2 5354 nt11.19□□□□□ -0.62
HEF3P53978 ILV3YJR016C 1758 nt11.19□□□□□ -0.62
HEF3P53978 YPR126CYPR126C 309 nt11.19□□□□□ -0.62
HEF3P53978 DAK2YFL053W 1776 nt11.18□□□□□ -0.62
HEF3P53978 LSB6YJL100W 1824 nt11.16□□□□□ -0.62
HEF3P53978 YDL086WYDL086W 822 nt11.16□□□□□ -0.62
HEF3P53978 AIM1YAL046C 357 nt11.16□□□□□ -0.62
HEF3P53978 BET2YPR176C 978 nt11.16□□□□□ -0.62
HEF3P53978 MUP1YGR055W 1725 nt11.15□□□□□ -0.62
HEF3P53978 CTI6YPL181W 1521 nt11.15□□□□□ -0.62
HEF3P53978 ERG13YML126C 1476 nt11.15□□□□□ -0.62
HEF3P53978 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt11.15□□□□□ -0.62
HEF3P53978 IMO32YGR031W 1029 nt11.15□□□□□ -0.62
HEF3P53978 ASP3-1YLR155C 1089 nt11.15□□□□□ -0.62
HEF3P53978 ASP3-2YLR157C 1089 nt11.15□□□□□ -0.62
HEF3P53978 ASP3-3YLR158C 1089 nt11.15□□□□□ -0.62
HEF3P53978 ASP3-4YLR160C 1089 nt11.15□□□□□ -0.62
HEF3P53978 OPI10YOL032W 741 nt11.14□□□□□ -0.63
HEF3P53978 PAU5YFL020C 369 nt11.13□□□□□ -0.63
HEF3P53978 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt11.13□□□□□ -0.63
HEF3P53978 YMR262WYMR262W 942 nt11.11□□□□□ -0.63
HEF3P53978 ESS1YJR017C 513 nt11.1□□□□□ -0.63
HEF3P53978 PGC1YPL206C 966 nt11.09□□□□□ -0.63
HEF3P53978 ARO8YGL202W 1503 nt11.09□□□□□ -0.63
HEF3P53978 HOL1YNR055C 1761 nt11.08□□□□□ -0.64
HEF3P53978 TAF13YML098W 504 nt11.08□□□□□ -0.64
HEF3P53978 ADE8YDR408C 645 nt11.07□□□□□ -0.64
HEF3P53978 RPM1RPM1 483 nt11.06□□□□□ -0.64
HEF3P53978 QDR2YIL121W 1629 nt11.06□□□□□ -0.64
HEF3P53978 APS2YJR058C 444 nt11.05□□□□□ -0.64
HEF3P53978 IML3YBR107C 738 nt11.04□□□□□ -0.64
HEF3P53978 SAC7YDR389W 1965 nt11.03□□□□□ -0.64
HEF3P53978 MHF1YOL086W-A 273 nt11.03□□□□□ -0.64
HEF3P53978 SPS100YHR139C 981 nt11.02□□□□□ -0.65
HEF3P53978 COQ8YGL119W 1506 nt11.01□□□□□ -0.65
HEF3P53978 POT1YIL160C 1254 nt11.01□□□□□ -0.65
HEF3P53978 RRT8YOL048C 1029 nt11.01□□□□□ -0.65
HEF3P53978 KES1YPL145C 1305 nt11□□□□□ -0.65
HEF3P53978 DIG1YPL049C 1359 nt11□□□□□ -0.65
HEF3P53978 OPI3YJR073C 621 nt10.99□□□□□ -0.65
HEF3P53978 YLR046CYLR046C 813 nt10.98□□□□□ -0.65
HEF3P53978 GID8YMR135C 1368 nt10.98□□□□□ -0.65
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