Protein–RNA interactions for Protein: P47082

AVT1, Vacuolar amino acid transporter 1, yeastyeast

Predictions only

Length 602 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVT1P47082 RPM1RPM1 483 nt10.04□□□□□ -0.8
AVT1P47082 SAM3YPL274W 1764 nt10.03□□□□□ -0.8
AVT1P47082 BNI5YNL166C 1347 nt10.02□□□□□ -0.81
AVT1P47082 PBP1YGR178C 2169 nt10.01□□□□□ -0.81
AVT1P47082 YJL118WYJL118W 660 nt10□□□□□ -0.81
AVT1P47082 PHO23YNL097C 993 nt10□□□□□ -0.81
AVT1P47082 URA6YKL024C 615 nt9.99□□□□□ -0.81
AVT1P47082 GAL3YDR009W 1563 nt9.99□□□□□ -0.81
AVT1P47082 MSC1YML128C 1542 nt9.97□□□□□ -0.81
AVT1P47082 CCT5YJR064W 1689 nt9.97□□□□□ -0.81
AVT1P47082 ESS1YJR017C 513 nt9.97□□□□□ -0.81
AVT1P47082 OYE3YPL171C 1203 nt9.97□□□□□ -0.81
AVT1P47082 LSB5YCL034W 1065 nt9.97□□□□□ -0.81
AVT1P47082 NME1NME1 340 nt9.96□□□□□ -0.82
AVT1P47082 ZRT3YKL175W 1512 nt9.96□□□□□ -0.82
AVT1P47082 RPT5YOR117W 1305 nt9.94□□□□□ -0.82
AVT1P47082 NUC1YJL208C 990 nt9.93□□□□□ -0.82
AVT1P47082 SEC61YLR378C 1443 nt9.92□□□□□ -0.82
AVT1P47082 OXA1YER154W 1209 nt9.92□□□□□ -0.82
AVT1P47082 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt9.9□□□□□ -0.82
AVT1P47082 YJL067WYJL067W 351 nt9.9□□□□□ -0.82
AVT1P47082 SNZ1YMR096W 894 nt9.9□□□□□ -0.82
AVT1P47082 FLR1YBR008C 1647 nt9.89□□□□□ -0.83
AVT1P47082 FUB1YCR076C 753 nt9.89□□□□□ -0.83
AVT1P47082 SAM2YDR502C 1155 nt9.89□□□□□ -0.83
AVT1P47082 PET8YNL003C 855 nt9.88□□□□□ -0.83
AVT1P47082 CYT2YKL087C 675 nt9.87□□□□□ -0.83
AVT1P47082 PGC1YPL206C 966 nt9.87□□□□□ -0.83
AVT1P47082 TPS1YBR126C 1488 nt9.86□□□□□ -0.83
AVT1P47082 DLD2YDL178W 1593 nt9.86□□□□□ -0.83
AVT1P47082 YER188WYER188W 720 nt9.86□□□□□ -0.83
AVT1P47082 RIB7YBR153W 735 nt9.86□□□□□ -0.83
AVT1P47082 NAR1YNL240C 1476 nt9.85□□□□□ -0.83
AVT1P47082 RDN25-1RDN25-1 3396 nt9.84□□□□□ -0.83
AVT1P47082 RDN25-2RDN25-2 3396 nt9.84□□□□□ -0.83
AVT1P47082 THI72YOR192C 1800 nt9.84□□□□□ -0.83
AVT1P47082 PAU5YFL020C 369 nt9.83□□□□□ -0.84
AVT1P47082 RAS2YNL098C 969 nt9.83□□□□□ -0.84
AVT1P47082 FMS1YMR020W 1527 nt9.82□□□□□ -0.84
AVT1P47082 OYE2YHR179W 1203 nt9.82□□□□□ -0.84
AVT1P47082 EAF3YPR023C 1206 nt9.82□□□□□ -0.84
AVT1P47082 YPS3YLR121C 1527 nt9.82□□□□□ -0.84
AVT1P47082 RSC8YFR037C 1674 nt9.8□□□□□ -0.84
AVT1P47082 YPR126CYPR126C 309 nt9.8□□□□□ -0.84
AVT1P47082 YBR232CYBR232C 360 nt9.8□□□□□ -0.84
AVT1P47082 HEM13YDR044W 987 nt9.78□□□□□ -0.84
AVT1P47082 SEN2YLR105C 1134 nt9.77□□□□□ -0.85
AVT1P47082 DAK2YFL053W 1776 nt9.77□□□□□ -0.85
AVT1P47082 TAF13YML098W 504 nt9.76□□□□□ -0.85
AVT1P47082 YAT1YAR035W 2064 nt9.76□□□□□ -0.85
AVT1P47082 ACH1YBL015W 1581 nt9.75□□□□□ -0.85
AVT1P47082 STP3YLR375W 1032 nt9.75□□□□□ -0.85
AVT1P47082 SPP2YOR148C 558 nt9.75□□□□□ -0.85
AVT1P47082 YMR262WYMR262W 942 nt9.74□□□□□ -0.85
AVT1P47082 TMA23YMR269W 636 nt9.74□□□□□ -0.85
AVT1P47082 CTI6YPL181W 1521 nt9.73□□□□□ -0.85
AVT1P47082 OSH7YHR001W 1314 nt9.73□□□□□ -0.85
AVT1P47082 TAT2YOL020W 1779 nt9.73□□□□□ -0.85
AVT1P47082 DDI1YER143W 1287 nt9.72□□□□□ -0.85
AVT1P47082 MHF1YOL086W-A 273 nt9.72□□□□□ -0.85
AVT1P47082 PUP1YOR157C 786 nt9.71□□□□□ -0.86
AVT1P47082 SOL2YCR073W-A 948 nt9.7□□□□□ -0.86
AVT1P47082 CWC15YDR163W 528 nt9.7□□□□□ -0.86
AVT1P47082 CSM2YIL132C 642 nt9.7□□□□□ -0.86
AVT1P47082 MCH5YOR306C 1566 nt9.7□□□□□ -0.86
AVT1P47082 UME6YDR207C 2511 nt9.68□□□□□ -0.86
AVT1P47082 YDR455CYDR455C 309 nt9.68□□□□□ -0.86
AVT1P47082 POT1YIL160C 1254 nt9.67□□□□□ -0.86
AVT1P47082 YJL064WYJL064W 396 nt9.67□□□□□ -0.86
AVT1P47082 APS2YJR058C 444 nt9.67□□□□□ -0.86
AVT1P47082 LSM5YER146W 282 nt9.66□□□□□ -0.86
AVT1P47082 IMO32YGR031W 1029 nt9.66□□□□□ -0.86
AVT1P47082 NAP1YKR048C 1254 nt9.66□□□□□ -0.86
AVT1P47082 IML3YBR107C 738 nt9.66□□□□□ -0.86
AVT1P47082 NIF3YGL221C 867 nt9.64□□□□□ -0.87
AVT1P47082 VAR1Q0140 1197 nt9.64□□□□□ -0.87
AVT1P47082 RPC82YPR190C 1965 nt9.64□□□□□ -0.87
AVT1P47082 GSF2YML048W 1212 nt9.63□□□□□ -0.87
AVT1P47082 YNL024CYNL024C 741 nt9.63□□□□□ -0.87
AVT1P47082 TUB4YLR212C 1422 nt9.63□□□□□ -0.87
AVT1P47082 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt9.62□□□□□ -0.87
AVT1P47082 PAU19YMR325W 375 nt9.62□□□□□ -0.87
AVT1P47082 INA1YLR413W 2028 nt9.6□□□□□ -0.87
AVT1P47082 VPS62YGR141W 1404 nt9.58□□□□□ -0.88
AVT1P47082 PAR32YDL173W 888 nt9.58□□□□□ -0.88
AVT1P47082 SPS100YHR139C 981 nt9.57□□□□□ -0.88
AVT1P47082 RRT8YOL048C 1029 nt9.57□□□□□ -0.88
AVT1P47082 PAU21YOR394W 495 nt9.57□□□□□ -0.88
AVT1P47082 PAU22YPL282C 495 nt9.57□□□□□ -0.88
AVT1P47082 ERG13YML126C 1476 nt9.56□□□□□ -0.88
AVT1P47082 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt9.56□□□□□ -0.88
AVT1P47082 ASP3-1YLR155C 1089 nt9.56□□□□□ -0.88
AVT1P47082 ASP3-2YLR157C 1089 nt9.56□□□□□ -0.88
AVT1P47082 ASP3-3YLR158C 1089 nt9.56□□□□□ -0.88
AVT1P47082 ASP3-4YLR160C 1089 nt9.56□□□□□ -0.88
AVT1P47082 YOR325WYOR325W 474 nt9.55□□□□□ -0.88
AVT1P47082 CDD1YLR245C 429 nt9.54□□□□□ -0.88
AVT1P47082 YDL086WYDL086W 822 nt9.53□□□□□ -0.88
AVT1P47082 ADE8YDR408C 645 nt9.52□□□□□ -0.89
AVT1P47082 SLG1YOR008C 1137 nt9.51□□□□□ -0.89
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