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Protein–RNA interactions for Protein: P47050
RTT101, Cullin-8, yeast
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842 aa
.
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
RTT101
P47050
SHY1
YGR112W
1170 nt
9.5
□□□□□ -0.89
RTT101
P47050
SPT20
YOL148C
1815 nt
9.49
□□□□□ -0.89
RTT101
P47050
GND2
YGR256W
1479 nt
9.49
□□□□□ -0.89
RTT101
P47050
PAU15
YIR041W
375 nt
9.49
□□□□□ -0.89
RTT101
P47050
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YOR262W
1044 nt
9.48
□□□□□ -0.89
RTT101
P47050
RPC82
YPR190C
1965 nt
9.48
□□□□□ -0.89
RTT101
P47050
YJL055W
YJL055W
738 nt
9.47
□□□□□ -0.89
RTT101
P47050
TRT2
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72 nt
9.46
□□□□□ -0.9
RTT101
P47050
SSN3
YPL042C
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RTT101
P47050
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YLR413W
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RTT101
P47050
LSB5
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P47050
ZRT3
YKL175W
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RTT101
P47050
CSM1
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RTT101
P47050
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YGR247W
720 nt
9.44
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RTT101
P47050
SAM2
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RTT101
P47050
NUC1
YJL208C
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RTT101
P47050
URA6
YKL024C
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□□□□□ -0.9
RTT101
P47050
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YML088W
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□□□□□ -0.9
RTT101
P47050
BNI5
YNL166C
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RTT101
P47050
OYE3
YPL171C
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□□□□□ -0.9
RTT101
P47050
SEC61
YLR378C
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RTT101
P47050
PHO23
YNL097C
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RTT101
P47050
RPT5
YOR117W
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□□□□□ -0.91
RTT101
P47050
YJL118W
YJL118W
660 nt
9.38
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RTT101
P47050
HEL2
YDR266C
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9.38
□□□□□ -0.91
RTT101
P47050
PET8
YNL003C
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9.37
□□□□□ -0.91
RTT101
P47050
MSC1
YML128C
1542 nt
9.36
□□□□□ -0.91
RTT101
P47050
OXA1
YER154W
1209 nt
9.35
□□□□□ -0.91
RTT101
P47050
YJL067W
YJL067W
351 nt
9.34
□□□□□ -0.91
RTT101
P47050
RIB7
YBR153W
735 nt
9.34
□□□□□ -0.91
RTT101
P47050
tS(GCU)L
tS(GCU)L
80 nt
9.33
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RTT101
P47050
CCT5
YJR064W
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9.32
□□□□□ -0.92
RTT101
P47050
YER188W
YER188W
720 nt
9.31
□□□□□ -0.92
RTT101
P47050
RAS2
YNL098C
969 nt
9.31
□□□□□ -0.92
RTT101
P47050
GAL3
YDR009W
1563 nt
9.31
□□□□□ -0.92
RTT101
P47050
SAM3
YPL274W
1764 nt
9.3
□□□□□ -0.92
RTT101
P47050
ESS1
YJR017C
513 nt
9.29
□□□□□ -0.92
RTT101
P47050
FUB1
YCR076C
753 nt
9.28
□□□□□ -0.92
RTT101
P47050
RIM8
YGL045W
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□□□□□ -0.92
RTT101
P47050
OYE2
YHR179W
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RTT101
P47050
THI72
YOR192C
1800 nt
9.26
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RTT101
P47050
MUP1
YGR055W
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□□□□□ -0.93
RTT101
P47050
DLD2
YDL178W
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RTT101
P47050
TPS1
YBR126C
1488 nt
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□□□□□ -0.93
RTT101
P47050
TAF13
YML098W
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RTT101
P47050
FLR1
YBR008C
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RTT101
P47050
RSC8
YFR037C
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9.23
□□□□□ -0.93
RTT101
P47050
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YGL114W
2178 nt
9.23
□□□□□ -0.93
RTT101
P47050
CWC15
YDR163W
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9.22
□□□□□ -0.93
RTT101
P47050
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YHR001W
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9.21
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RTT101
P47050
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9.21
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RTT101
P47050
FMS1
YMR020W
1527 nt
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RTT101
P47050
HOL1
YNR055C
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RTT101
P47050
PAU5
YFL020C
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RTT101
P47050
EAF3
YPR023C
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RTT101
P47050
SPP2
YOR148C
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RTT101
P47050
SNZ1
YMR096W
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9.18
□□□□□ -0.94
RTT101
P47050
PGC1
YPL206C
966 nt
9.16
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RTT101
P47050
STP3
YLR375W
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RTT101
P47050
SOL2
YCR073W-A
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RTT101
P47050
SEN2
YLR105C
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9.14
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RTT101
P47050
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YPR126C
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RTT101
P47050
DAK2
YFL053W
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RTT101
P47050
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YER146W
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RTT101
P47050
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YMR262W
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RTT101
P47050
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YNL024C
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P47050
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P47050
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P47050
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P47050
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P47050
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YIL100C-A
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YOR325W
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YBR232C
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P47050
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P47050
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RTT101
P47050
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RTT101
P47050
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RTT101
P47050
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YDL086W
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P47050
TAT2
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P47050
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YDR455C
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P47050
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YLR212C
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P47050
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P47050
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YJL064W
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□□□□□ -0.97
RTT101
P47050
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9
□□□□□ -0.97
RTT101
P47050
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9
□□□□□ -0.97
RTT101
P47050
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RTT101
P47050
ERG13
YML126C
1476 nt
8.98
□□□□□ -0.97
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