Protein–RNA interactions for Protein: P40105

YRF1-2, Y' element ATP-dependent helicase protein 1 copy 2, yeastyeast

Predictions only

Length 1,681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-2P40105 YPL251WYPL251W 303 nt12.13□□□□□ -0.47
YRF1-2P40105 YCP4YCR004C 744 nt12.1□□□□□ -0.47
YRF1-2P40105 LSB5YCL034W 1065 nt12.1□□□□□ -0.47
YRF1-2P40105 YMR262WYMR262W 942 nt12.09□□□□□ -0.47
YRF1-2P40105 LIP1YMR298W 453 nt12.06□□□□□ -0.48
YRF1-2P40105 SNZ1YMR096W 894 nt12.05□□□□□ -0.48
YRF1-2P40105 YBL086CYBL086C 1401 nt12.05□□□□□ -0.48
YRF1-2P40105 GAL3YDR009W 1563 nt12.04□□□□□ -0.48
YRF1-2P40105 APS2YJR058C 444 nt12.03□□□□□ -0.48
YRF1-2P40105 MHF1YOL086W-A 273 nt12□□□□□ -0.49
YRF1-2P40105 TUB4YLR212C 1422 nt12□□□□□ -0.49
YRF1-2P40105 KRE1YNL322C 942 nt12□□□□□ -0.49
YRF1-2P40105 DPS1YLL018C 1674 nt11.99□□□□□ -0.49
YRF1-2P40105 PRP4YPR178W 1398 nt11.99□□□□□ -0.49
YRF1-2P40105 CSM1YCR086W 573 nt11.98□□□□□ -0.49
YRF1-2P40105 NUC1YJL208C 990 nt11.98□□□□□ -0.49
YRF1-2P40105 YCR025CYCR025C 411 nt11.95□□□□□ -0.5
YRF1-2P40105 YMR103CYMR103C 363 nt11.95□□□□□ -0.5
YRF1-2P40105 SAM3YPL274W 1764 nt11.95□□□□□ -0.5
YRF1-2P40105 HXT1YHR094C 1713 nt11.94□□□□□ -0.5
YRF1-2P40105 ACO2YJL200C 2370 nt11.94□□□□□ -0.5
YRF1-2P40105 TOA2YKL058W 369 nt11.94□□□□□ -0.5
YRF1-2P40105 BOR1YNL275W 1731 nt11.93□□□□□ -0.5
YRF1-2P40105 BUD20YLR074C 501 nt11.92□□□□□ -0.5
YRF1-2P40105 CDD1YLR245C 429 nt11.92□□□□□ -0.5
YRF1-2P40105 DBP1YPL119C 1854 nt11.91□□□□□ -0.5
YRF1-2P40105 SSN3YPL042C 1668 nt11.91□□□□□ -0.5
YRF1-2P40105 RIB7YBR153W 735 nt11.91□□□□□ -0.5
YRF1-2P40105 SNF1YDR477W 1902 nt11.9□□□□□ -0.5
YRF1-2P40105 BNI5YNL166C 1347 nt11.9□□□□□ -0.5
YRF1-2P40105 IRC24YIR036C 792 nt11.9□□□□□ -0.5
YRF1-2P40105 YPR126CYPR126C 309 nt11.9□□□□□ -0.5
YRF1-2P40105 GND2YGR256W 1479 nt11.89□□□□□ -0.51
YRF1-2P40105 POT1YIL160C 1254 nt11.87□□□□□ -0.51
YRF1-2P40105 BRR1YPR057W 1026 nt11.86□□□□□ -0.51
YRF1-2P40105 TRT2tT(CGU)K 72 nt11.85□□□□□ -0.51
YRF1-2P40105 HIF1YLL022C 1158 nt11.83□□□□□ -0.52
YRF1-2P40105 SAM50YNL026W 1455 nt11.8□□□□□ -0.52
YRF1-2P40105 CTI6YPL181W 1521 nt11.8□□□□□ -0.52
YRF1-2P40105 SAM2YDR502C 1155 nt11.8□□□□□ -0.52
YRF1-2P40105 PHO23YNL097C 993 nt11.8□□□□□ -0.52
YRF1-2P40105 RPT5YOR117W 1305 nt11.79□□□□□ -0.52
YRF1-2P40105 LEU9YOR108W 1815 nt11.78□□□□□ -0.52
YRF1-2P40105 MFG1YDL233W 1377 nt11.77□□□□□ -0.52
YRF1-2P40105 HOG1YLR113W 1308 nt11.77□□□□□ -0.53
YRF1-2P40105 UFO1YML088W 2007 nt11.76□□□□□ -0.53
YRF1-2P40105 LYS20YDL182W 1287 nt11.75□□□□□ -0.53
YRF1-2P40105 TPS1YBR126C 1488 nt11.75□□□□□ -0.53
YRF1-2P40105 RPL12BYDR418W 498 nt11.74□□□□□ -0.53
YRF1-2P40105 SHY1YGR112W 1170 nt11.73□□□□□ -0.53
YRF1-2P40105 SWM1YDR260C 513 nt11.71□□□□□ -0.53
YRF1-2P40105 OYE2YHR179W 1203 nt11.71□□□□□ -0.54
YRF1-2P40105 OYE3YPL171C 1203 nt11.71□□□□□ -0.54
YRF1-2P40105 DDI1YER143W 1287 nt11.7□□□□□ -0.54
YRF1-2P40105 NAS2YIL007C 663 nt11.7□□□□□ -0.54
YRF1-2P40105 BIO5YNR056C 1686 nt11.69□□□□□ -0.54
YRF1-2P40105 IGD1YFR017C 588 nt11.69□□□□□ -0.54
YRF1-2P40105 FLX1YIL134W 936 nt11.68□□□□□ -0.54
YRF1-2P40105 YMR007WYMR007W 381 nt11.68□□□□□ -0.54
YRF1-2P40105 DAK2YFL053W 1776 nt11.68□□□□□ -0.54
YRF1-2P40105 MSC1YML128C 1542 nt11.68□□□□□ -0.54
YRF1-2P40105 NIF3YGL221C 867 nt11.66□□□□□ -0.54
YRF1-2P40105 YOR343CYOR343C 327 nt11.65□□□□□ -0.54
YRF1-2P40105 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt11.64□□□□□ -0.55
YRF1-2P40105 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt11.64□□□□□ -0.55
YRF1-2P40105 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt11.64□□□□□ -0.55
YRF1-2P40105 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt11.64□□□□□ -0.55
YRF1-2P40105 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt11.64□□□□□ -0.55
YRF1-2P40105 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt11.64□□□□□ -0.55
YRF1-2P40105 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt11.64□□□□□ -0.55
YRF1-2P40105 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt11.64□□□□□ -0.55
YRF1-2P40105 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt11.64□□□□□ -0.55
YRF1-2P40105 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt11.64□□□□□ -0.55
YRF1-2P40105 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt11.64□□□□□ -0.55
YRF1-2P40105 SEC61YLR378C 1443 nt11.63□□□□□ -0.55
YRF1-2P40105 GRH1YDR517W 1119 nt11.63□□□□□ -0.55
YRF1-2P40105 YER188WYER188W 720 nt11.62□□□□□ -0.55
YRF1-2P40105 RAS2YNL098C 969 nt11.61□□□□□ -0.55
YRF1-2P40105 FLR1YBR008C 1647 nt11.6□□□□□ -0.55
YRF1-2P40105 FUB1YCR076C 753 nt11.6□□□□□ -0.55
YRF1-2P40105 PAU21YOR394W 495 nt11.6□□□□□ -0.55
YRF1-2P40105 IPL1YPL209C 1104 nt11.6□□□□□ -0.55
YRF1-2P40105 PAU22YPL282C 495 nt11.6□□□□□ -0.55
YRF1-2P40105 RCR1YBR005W 642 nt11.59□□□□□ -0.55
YRF1-2P40105 NVJ2YPR091C 2313 nt11.58□□□□□ -0.56
YRF1-2P40105 EAF3YPR023C 1206 nt11.58□□□□□ -0.56
YRF1-2P40105 RSC8YFR037C 1674 nt11.58□□□□□ -0.56
YRF1-2P40105 URA6YKL024C 615 nt11.57□□□□□ -0.56
YRF1-2P40105 YMR206WYMR206W 942 nt11.56□□□□□ -0.56
YRF1-2P40105 FCY1YPR062W 477 nt11.56□□□□□ -0.56
YRF1-2P40105 YOR268CYOR268C 399 nt11.55□□□□□ -0.56
YRF1-2P40105 TGA1tA(UGC)A 73 nt11.55□□□□□ -0.56
YRF1-2P40105 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt11.55□□□□□ -0.56
YRF1-2P40105 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt11.55□□□□□ -0.56
YRF1-2P40105 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt11.55□□□□□ -0.56
YRF1-2P40105 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt11.55□□□□□ -0.56
YRF1-2P40105 YNL024CYNL024C 741 nt11.55□□□□□ -0.56
YRF1-2P40105 IML3YBR107C 738 nt11.54□□□□□ -0.56
YRF1-2P40105 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt11.53□□□□□ -0.56
YRF1-2P40105 TMA23YMR269W 636 nt11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 41.9 ms