Protein–RNA interactions for Protein: P36012

CSE4, Histone H3-like centromeric protein CSE4, yeastyeast

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSE4P36012 CSM1YCR086W 573 nt12.16□□□□□ -0.46
CSE4P36012 STP3YLR375W 1032 nt12.16□□□□□ -0.46
CSE4P36012 DBP1YPL119C 1854 nt12.15□□□□□ -0.46
CSE4P36012 ALG12YNR030W 1656 nt12.14□□□□□ -0.47
CSE4P36012 YBL086CYBL086C 1401 nt12.12□□□□□ -0.47
CSE4P36012 YJL064WYJL064W 396 nt12.12□□□□□ -0.47
CSE4P36012 MEP3YPR138C 1470 nt12.12□□□□□ -0.47
CSE4P36012 LEU9YOR108W 1815 nt12.1□□□□□ -0.47
CSE4P36012 YMR103CYMR103C 363 nt12.1□□□□□ -0.47
CSE4P36012 BRR1YPR057W 1026 nt12.1□□□□□ -0.47
CSE4P36012 GAL3YDR009W 1563 nt12.07□□□□□ -0.48
CSE4P36012 HXT1YHR094C 1713 nt12.07□□□□□ -0.48
CSE4P36012 YJL118WYJL118W 660 nt12.07□□□□□ -0.48
CSE4P36012 PAU19YMR325W 375 nt12.06□□□□□ -0.48
CSE4P36012 LSB5YCL034W 1065 nt12.05□□□□□ -0.48
CSE4P36012 THI72YOR192C 1800 nt12.04□□□□□ -0.48
CSE4P36012 HIF1YLL022C 1158 nt12.04□□□□□ -0.48
CSE4P36012 TOA2YKL058W 369 nt12.03□□□□□ -0.48
CSE4P36012 REG2YBR050C 1017 nt12.03□□□□□ -0.48
CSE4P36012 SAM3YPL274W 1764 nt12.02□□□□□ -0.49
CSE4P36012 TAF13YML098W 504 nt12.01□□□□□ -0.49
CSE4P36012 SSN3YPL042C 1668 nt12□□□□□ -0.49
CSE4P36012 RPT5YOR117W 1305 nt12□□□□□ -0.49
CSE4P36012 SNZ1YMR096W 894 nt11.99□□□□□ -0.49
CSE4P36012 PHO23YNL097C 993 nt11.98□□□□□ -0.49
CSE4P36012 BNI5YNL166C 1347 nt11.97□□□□□ -0.49
CSE4P36012 SLG1YOR008C 1137 nt11.97□□□□□ -0.49
CSE4P36012 GND2YGR256W 1479 nt11.96□□□□□ -0.49
CSE4P36012 RIB7YBR153W 735 nt11.96□□□□□ -0.49
CSE4P36012 PBP1YGR178C 2169 nt11.96□□□□□ -0.5
CSE4P36012 NUC1YJL208C 990 nt11.95□□□□□ -0.5
CSE4P36012 YMR262WYMR262W 942 nt11.95□□□□□ -0.5
CSE4P36012 TRT2tT(CGU)K 72 nt11.94□□□□□ -0.5
CSE4P36012 TIM44YIL022W 1296 nt11.94□□□□□ -0.5
CSE4P36012 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt11.93□□□□□ -0.5
CSE4P36012 MSC1YML128C 1542 nt11.92□□□□□ -0.5
CSE4P36012 UFO1YML088W 2007 nt11.92□□□□□ -0.5
CSE4P36012 SHY1YGR112W 1170 nt11.91□□□□□ -0.5
CSE4P36012 PAM17YKR065C 594 nt11.9□□□□□ -0.5
CSE4P36012 MHF1YOL086W-A 273 nt11.88□□□□□ -0.51
CSE4P36012 YPR126CYPR126C 309 nt11.88□□□□□ -0.51
CSE4P36012 PAR32YDL173W 888 nt11.87□□□□□ -0.51
CSE4P36012 SEC61YLR378C 1443 nt11.86□□□□□ -0.51
CSE4P36012 YJR114WYJR114W 393 nt11.86□□□□□ -0.51
CSE4P36012 TIP1YBR067C 633 nt11.86□□□□□ -0.51
CSE4P36012 TPS1YBR126C 1488 nt11.85□□□□□ -0.51
CSE4P36012 POT1YIL160C 1254 nt11.85□□□□□ -0.51
CSE4P36012 TUB4YLR212C 1422 nt11.85□□□□□ -0.51
CSE4P36012 OXA1YER154W 1209 nt11.84□□□□□ -0.51
CSE4P36012 GSF2YML048W 1212 nt11.84□□□□□ -0.51
CSE4P36012 CTI6YPL181W 1521 nt11.81□□□□□ -0.52
CSE4P36012 FUB1YCR076C 753 nt11.81□□□□□ -0.52
CSE4P36012 URA6YKL024C 615 nt11.81□□□□□ -0.52
CSE4P36012 DAK2YFL053W 1776 nt11.81□□□□□ -0.52
CSE4P36012 NAR1YNL240C 1476 nt11.81□□□□□ -0.52
CSE4P36012 OYE2YHR179W 1203 nt11.8□□□□□ -0.52
CSE4P36012 APS2YJR058C 444 nt11.8□□□□□ -0.52
CSE4P36012 OYE3YPL171C 1203 nt11.8□□□□□ -0.52
CSE4P36012 SAM2YDR502C 1155 nt11.79□□□□□ -0.52
CSE4P36012 RAS2YNL098C 969 nt11.78□□□□□ -0.52
CSE4P36012 YER188WYER188W 720 nt11.77□□□□□ -0.53
CSE4P36012 NIF3YGL221C 867 nt11.77□□□□□ -0.53
CSE4P36012 CYT2YKL087C 675 nt11.77□□□□□ -0.53
CSE4P36012 EAF3YPR023C 1206 nt11.77□□□□□ -0.53
CSE4P36012 IML3YBR107C 738 nt11.76□□□□□ -0.53
CSE4P36012 UME6YDR207C 2511 nt11.76□□□□□ -0.53
CSE4P36012 RIB1YBL033C 1038 nt11.75□□□□□ -0.53
CSE4P36012 ARA2YMR041C 1008 nt11.74□□□□□ -0.53
CSE4P36012 MCH5YOR306C 1566 nt11.73□□□□□ -0.53
CSE4P36012 ERG6YML008C 1152 nt11.71□□□□□ -0.53
CSE4P36012 PET8YNL003C 855 nt11.71□□□□□ -0.53
CSE4P36012 TMA23YMR269W 636 nt11.7□□□□□ -0.54
CSE4P36012 YNL024CYNL024C 741 nt11.7□□□□□ -0.54
CSE4P36012 FLR1YBR008C 1647 nt11.69□□□□□ -0.54
CSE4P36012 DLD2YDL178W 1593 nt11.69□□□□□ -0.54
CSE4P36012 ZRT3YKL175W 1512 nt11.69□□□□□ -0.54
CSE4P36012 YIA6YIL006W 1122 nt11.68□□□□□ -0.54
CSE4P36012 YJR154WYJR154W 1041 nt11.68□□□□□ -0.54
CSE4P36012 YLR122CYLR122C 378 nt11.67□□□□□ -0.54
CSE4P36012 RDN25-1RDN25-1 3396 nt11.66□□□□□ -0.54
CSE4P36012 RDN25-2RDN25-2 3396 nt11.66□□□□□ -0.54
CSE4P36012 SOD2YHR008C 702 nt11.65□□□□□ -0.54
CSE4P36012 YJL067WYJL067W 351 nt11.65□□□□□ -0.54
CSE4P36012 YAT1YAR035W 2064 nt11.64□□□□□ -0.55
CSE4P36012 IGD1YFR017C 588 nt11.64□□□□□ -0.55
CSE4P36012 DDI1YER143W 1287 nt11.63□□□□□ -0.55
CSE4P36012 YCP4YCR004C 744 nt11.6□□□□□ -0.55
CSE4P36012 IMO32YGR031W 1029 nt11.6□□□□□ -0.55
CSE4P36012 YPS3YLR121C 1527 nt11.6□□□□□ -0.55
CSE4P36012 OSH7YHR001W 1314 nt11.6□□□□□ -0.55
CSE4P36012 CDD1YLR245C 429 nt11.59□□□□□ -0.55
CSE4P36012 FMS1YMR020W 1527 nt11.59□□□□□ -0.55
CSE4P36012 HEM13YDR044W 987 nt11.58□□□□□ -0.56
CSE4P36012 RSC8YFR037C 1674 nt11.58□□□□□ -0.56
CSE4P36012 SOL2YCR073W-A 948 nt11.57□□□□□ -0.56
CSE4P36012 SPS100YHR139C 981 nt11.57□□□□□ -0.56
CSE4P36012 LSM5YER146W 282 nt11.56□□□□□ -0.56
CSE4P36012 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt11.55□□□□□ -0.56
CSE4P36012 Q0010Q0010 387 nt11.55□□□□□ -0.56
CSE4P36012 SAM50YNL026W 1455 nt11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 37.3 ms