Protein–RNA interactions for Protein: P34228

SEF1, Putative transcription factor SEF1, yeastyeast

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Length 1,148 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEF1P34228 SPT20YOL148C 1815 nt8.61□□□□□ -1.03
SEF1P34228 YGL114WYGL114W 2178 nt8.59□□□□□ -1.03
SEF1P34228 RIB2YOL066C 1776 nt8.59□□□□□ -1.03
SEF1P34228 FCY21YER060W 1587 nt8.59□□□□□ -1.03
SEF1P34228 LSB3YFR024C-A 1380 nt8.59□□□□□ -1.03
SEF1P34228 NME1NME1 340 nt8.58□□□□□ -1.04
SEF1P34228 YBR232CYBR232C 360 nt8.58□□□□□ -1.04
SEF1P34228 DBP1YPL119C 1854 nt8.57□□□□□ -1.04
SEF1P34228 HIF1YLL022C 1158 nt8.57□□□□□ -1.04
SEF1P34228 PAU5YFL020C 369 nt8.55□□□□□ -1.04
SEF1P34228 LIP1YMR298W 453 nt8.55□□□□□ -1.04
SEF1P34228 MAS1YLR163C 1389 nt8.55□□□□□ -1.04
SEF1P34228 YER190C-AYER190C-A 576 nt8.54□□□□□ -1.04
SEF1P34228 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt8.54□□□□□ -1.04
SEF1P34228 YML133W-AYML133W-A 576 nt8.54□□□□□ -1.04
SEF1P34228 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt8.54□□□□□ -1.04
SEF1P34228 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt8.54□□□□□ -1.04
SEF1P34228 HXT1YHR094C 1713 nt8.53□□□□□ -1.04
SEF1P34228 ESBP6YNL125C 2022 nt8.53□□□□□ -1.04
SEF1P34228 HXT12YIL170W 1374 nt8.52□□□□□ -1.05
SEF1P34228 YJL064WYJL064W 396 nt8.52□□□□□ -1.05
SEF1P34228 ACO2YJL200C 2370 nt8.52□□□□□ -1.05
SEF1P34228 PRY1YJL079C 900 nt8.51□□□□□ -1.05
SEF1P34228 URA8YJR103W 1737 nt8.51□□□□□ -1.05
SEF1P34228 STP3YLR375W 1032 nt8.5□□□□□ -1.05
SEF1P34228 YBL086CYBL086C 1401 nt8.5□□□□□ -1.05
SEF1P34228 MCM5YLR274W 2328 nt8.49□□□□□ -1.05
SEF1P34228 PAU19YMR325W 375 nt8.49□□□□□ -1.05
SEF1P34228 LEU9YOR108W 1815 nt8.48□□□□□ -1.05
SEF1P34228 YJR114WYJR114W 393 nt8.48□□□□□ -1.05
SEF1P34228 YPL251WYPL251W 303 nt8.48□□□□□ -1.05
SEF1P34228 RPC82YPR190C 1965 nt8.48□□□□□ -1.05
SEF1P34228 VRG4YGL225W 1014 nt8.46□□□□□ -1.06
SEF1P34228 TIM44YIL022W 1296 nt8.45□□□□□ -1.06
SEF1P34228 YJL055WYJL055W 738 nt8.44□□□□□ -1.06
SEF1P34228 SLG1YOR008C 1137 nt8.44□□□□□ -1.06
SEF1P34228 BRR1YPR057W 1026 nt8.44□□□□□ -1.06
SEF1P34228 CCT5YJR064W 1689 nt8.43□□□□□ -1.06
SEF1P34228 SHY1YGR112W 1170 nt8.42□□□□□ -1.06
SEF1P34228 ZRT3YKL175W 1512 nt8.42□□□□□ -1.06
SEF1P34228 ILV2YMR108W 2064 nt8.42□□□□□ -1.06
SEF1P34228 RFC1YOR217W 2586 nt8.41□□□□□ -1.06
SEF1P34228 MEP3YPR138C 1470 nt8.4□□□□□ -1.06
SEF1P34228 TOA2YKL058W 369 nt8.4□□□□□ -1.06
SEF1P34228 MUP1YGR055W 1725 nt8.4□□□□□ -1.07
SEF1P34228 UFO1YML088W 2007 nt8.39□□□□□ -1.07
SEF1P34228 GTB1YDR221W 2109 nt8.38□□□□□ -1.07
SEF1P34228 INA1YLR413W 2028 nt8.38□□□□□ -1.07
SEF1P34228 CSM1YCR086W 573 nt8.38□□□□□ -1.07
SEF1P34228 YMR103CYMR103C 363 nt8.38□□□□□ -1.07
SEF1P34228 HEM14YER014W 1620 nt8.37□□□□□ -1.07
SEF1P34228 TRT2tT(CGU)K 72 nt8.37□□□□□ -1.07
SEF1P34228 URA6YKL024C 615 nt8.37□□□□□ -1.07
SEF1P34228 DTR1YBR180W 1719 nt8.34□□□□□ -1.07
SEF1P34228 GND2YGR256W 1479 nt8.34□□□□□ -1.07
SEF1P34228 RIB1YBL033C 1038 nt8.34□□□□□ -1.07
SEF1P34228 Q0010Q0010 387 nt8.33□□□□□ -1.08
SEF1P34228 THI72YOR192C 1800 nt8.33□□□□□ -1.08
SEF1P34228 TAF13YML098W 504 nt8.32□□□□□ -1.08
SEF1P34228 PHO23YNL097C 993 nt8.32□□□□□ -1.08
SEF1P34228 TIP1YBR067C 633 nt8.32□□□□□ -1.08
SEF1P34228 GAL3YDR009W 1563 nt8.31□□□□□ -1.08
SEF1P34228 YJL118WYJL118W 660 nt8.31□□□□□ -1.08
SEF1P34228 ERG6YML008C 1152 nt8.31□□□□□ -1.08
SEF1P34228 OYE3YPL171C 1203 nt8.31□□□□□ -1.08
SEF1P34228 GAL2YLR081W 1725 nt8.31□□□□□ -1.08
SEF1P34228 OXA1YER154W 1209 nt8.3□□□□□ -1.08
SEF1P34228 SEC61YLR378C 1443 nt8.29□□□□□ -1.08
SEF1P34228 YJL067WYJL067W 351 nt8.29□□□□□ -1.08
SEF1P34228 SAM3YPL274W 1764 nt8.29□□□□□ -1.08
SEF1P34228 YMR262WYMR262W 942 nt8.28□□□□□ -1.08
SEF1P34228 PET8YNL003C 855 nt8.28□□□□□ -1.08
SEF1P34228 LSB5YCL034W 1065 nt8.28□□□□□ -1.08
SEF1P34228 MSC1YML128C 1542 nt8.28□□□□□ -1.08
SEF1P34228 YDR306CYDR306C 1437 nt8.28□□□□□ -1.08
SEF1P34228 BNI5YNL166C 1347 nt8.28□□□□□ -1.08
SEF1P34228 PAR32YDL173W 888 nt8.27□□□□□ -1.09
SEF1P34228 SAM2YDR502C 1155 nt8.27□□□□□ -1.09
SEF1P34228 RSC4YKR008W 1878 nt8.26□□□□□ -1.09
SEF1P34228 SOD2YHR008C 702 nt8.26□□□□□ -1.09
SEF1P34228 YIA6YIL006W 1122 nt8.26□□□□□ -1.09
SEF1P34228 NUC1YJL208C 990 nt8.26□□□□□ -1.09
SEF1P34228 SNZ1YMR096W 894 nt8.25□□□□□ -1.09
SEF1P34228 RPT5YOR117W 1305 nt8.25□□□□□ -1.09
SEF1P34228 HOL1YNR055C 1761 nt8.25□□□□□ -1.09
SEF1P34228 TUB4YLR212C 1422 nt8.22□□□□□ -1.09
SEF1P34228 YJR154WYJR154W 1041 nt8.22□□□□□ -1.09
SEF1P34228 YHL008CYHL008C 1884 nt8.21□□□□□ -1.09
SEF1P34228 YER188WYER188W 720 nt8.21□□□□□ -1.1
SEF1P34228 RIB7YBR153W 735 nt8.21□□□□□ -1.1
SEF1P34228 HXK1YFR053C 1458 nt8.2□□□□□ -1.1
SEF1P34228 GSF2YML048W 1212 nt8.2□□□□□ -1.1
SEF1P34228 YMR209CYMR209C 1374 nt8.2□□□□□ -1.1
SEF1P34228 TOK1YJL093C 2076 nt8.19□□□□□ -1.1
SEF1P34228 FUB1YCR076C 753 nt8.19□□□□□ -1.1
SEF1P34228 DLD2YDL178W 1593 nt8.18□□□□□ -1.1
SEF1P34228 POT1YIL160C 1254 nt8.18□□□□□ -1.1
SEF1P34228 APS2YJR058C 444 nt8.18□□□□□ -1.1
SEF1P34228 MHF1YOL086W-A 273 nt8.18□□□□□ -1.1
SEF1P34228 YPR126CYPR126C 309 nt8.18□□□□□ -1.1
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