Protein–RNA interactions for Protein: P25044

PTP1, Tyrosine-protein phosphatase 1, yeastyeast

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PTP1P25044 HMG2YLR450W 3138 nt8.92□□□□□ -0.98
PTP1P25044 ALD4YOR374W 1560 nt8.91□□□□□ -0.98
PTP1P25044 PRY1YJL079C 900 nt8.91□□□□□ -0.98
PTP1P25044 PUP1YOR157C 786 nt8.91□□□□□ -0.98
PTP1P25044 UGA4YDL210W 1716 nt8.91□□□□□ -0.98
PTP1P25044 FRE6YLL051C 2139 nt8.9□□□□□ -0.99
PTP1P25044 DBP1YPL119C 1854 nt8.89□□□□□ -0.99
PTP1P25044 HXT1YHR094C 1713 nt8.89□□□□□ -0.99
PTP1P25044 HXT12YIL170W 1374 nt8.88□□□□□ -0.99
PTP1P25044 RIB2YOL066C 1776 nt8.88□□□□□ -0.99
PTP1P25044 URA8YJR103W 1737 nt8.88□□□□□ -0.99
PTP1P25044 SNF1YDR477W 1902 nt8.87□□□□□ -0.99
PTP1P25044 ILV2YMR108W 2064 nt8.86□□□□□ -0.99
PTP1P25044 VRG4YGL225W 1014 nt8.86□□□□□ -0.99
PTP1P25044 YBL086CYBL086C 1401 nt8.84□□□□□ -0.99
PTP1P25044 YPL251WYPL251W 303 nt8.84□□□□□ -0.99
PTP1P25044 LEU9YOR108W 1815 nt8.83□□□□□ -1
PTP1P25044 TIM44YIL022W 1296 nt8.83□□□□□ -1
PTP1P25044 BRR1YPR057W 1026 nt8.83□□□□□ -1
PTP1P25044 MEP3YPR138C 1470 nt8.83□□□□□ -1
PTP1P25044 TOA2YKL058W 369 nt8.82□□□□□ -1
PTP1P25044 HIF1YLL022C 1158 nt8.82□□□□□ -1
PTP1P25044 DTR1YBR180W 1719 nt8.81□□□□□ -1
PTP1P25044 YJR114WYJR114W 393 nt8.8□□□□□ -1
PTP1P25044 BSP1YPR171W 1731 nt8.8□□□□□ -1
PTP1P25044 YGL114WYGL114W 2178 nt8.78□□□□□ -1
PTP1P25044 YMR103CYMR103C 363 nt8.78□□□□□ -1
PTP1P25044 LSB5YCL034W 1065 nt8.78□□□□□ -1
PTP1P25044 GTB1YDR221W 2109 nt8.77□□□□□ -1.01
PTP1P25044 YJL055WYJL055W 738 nt8.77□□□□□ -1.01
PTP1P25044 NUC1YJL208C 990 nt8.76□□□□□ -1.01
PTP1P25044 ACO2YJL200C 2370 nt8.76□□□□□ -1.01
PTP1P25044 CSM1YCR086W 573 nt8.75□□□□□ -1.01
PTP1P25044 TRT2tT(CGU)K 72 nt8.75□□□□□ -1.01
PTP1P25044 RIB1YBL033C 1038 nt8.75□□□□□ -1.01
PTP1P25044 GAL2YLR081W 1725 nt8.74□□□□□ -1.01
PTP1P25044 SHY1YGR112W 1170 nt8.73□□□□□ -1.01
PTP1P25044 SPT20YOL148C 1815 nt8.73□□□□□ -1.01
PTP1P25044 GND2YGR256W 1479 nt8.72□□□□□ -1.01
PTP1P25044 SAM2YDR502C 1155 nt8.72□□□□□ -1.01
PTP1P25044 CCT5YJR064W 1689 nt8.72□□□□□ -1.01
PTP1P25044 PHO23YNL097C 993 nt8.71□□□□□ -1.02
PTP1P25044 RIB7YBR153W 735 nt8.71□□□□□ -1.02
PTP1P25044 RPT5YOR117W 1305 nt8.71□□□□□ -1.02
PTP1P25044 YJL118WYJL118W 660 nt8.7□□□□□ -1.02
PTP1P25044 ZRT3YKL175W 1512 nt8.7□□□□□ -1.02
PTP1P25044 URA6YKL024C 615 nt8.69□□□□□ -1.02
PTP1P25044 STP3YLR375W 1032 nt8.69□□□□□ -1.02
PTP1P25044 UFO1YML088W 2007 nt8.69□□□□□ -1.02
PTP1P25044 SEC61YLR378C 1443 nt8.69□□□□□ -1.02
PTP1P25044 YBR232CYBR232C 360 nt8.68□□□□□ -1.02
PTP1P25044 BNI5YNL166C 1347 nt8.68□□□□□ -1.02
PTP1P25044 OXA1YER154W 1209 nt8.67□□□□□ -1.02
PTP1P25044 MSC1YML128C 1542 nt8.67□□□□□ -1.02
PTP1P25044 PAU5YFL020C 369 nt8.66□□□□□ -1.02
PTP1P25044 YJL064WYJL064W 396 nt8.66□□□□□ -1.02
PTP1P25044 TAF13YML098W 504 nt8.66□□□□□ -1.02
PTP1P25044 PAU19YMR325W 375 nt8.66□□□□□ -1.02
PTP1P25044 OYE3YPL171C 1203 nt8.66□□□□□ -1.02
PTP1P25044 GAL3YDR009W 1563 nt8.65□□□□□ -1.02
PTP1P25044 THI72YOR192C 1800 nt8.65□□□□□ -1.02
PTP1P25044 PET8YNL003C 855 nt8.64□□□□□ -1.03
PTP1P25044 PGC1YPL206C 966 nt8.63□□□□□ -1.03
PTP1P25044 RFC1YOR217W 2586 nt8.63□□□□□ -1.03
PTP1P25044 SAM3YPL274W 1764 nt8.61□□□□□ -1.03
PTP1P25044 YER188WYER188W 720 nt8.61□□□□□ -1.03
PTP1P25044 SOD2YHR008C 702 nt8.61□□□□□ -1.03
PTP1P25044 YIA6YIL006W 1122 nt8.61□□□□□ -1.03
PTP1P25044 SLG1YOR008C 1137 nt8.6□□□□□ -1.03
PTP1P25044 OYE2YHR179W 1203 nt8.59□□□□□ -1.03
PTP1P25044 ERG6YML008C 1152 nt8.59□□□□□ -1.03
PTP1P25044 RAS2YNL098C 969 nt8.59□□□□□ -1.03
PTP1P25044 MUP1YGR055W 1725 nt8.59□□□□□ -1.03
PTP1P25044 TOK1YJL093C 2076 nt8.58□□□□□ -1.04
PTP1P25044 QDR2YIL121W 1629 nt8.58□□□□□ -1.04
PTP1P25044 FUB1YCR076C 753 nt8.56□□□□□ -1.04
PTP1P25044 TPS1YBR126C 1488 nt8.55□□□□□ -1.04
PTP1P25044 MHF1YOL086W-A 273 nt8.53□□□□□ -1.04
PTP1P25044 DLD2YDL178W 1593 nt8.52□□□□□ -1.04
PTP1P25044 SNZ1YMR096W 894 nt8.52□□□□□ -1.05
PTP1P25044 YPR126CYPR126C 309 nt8.52□□□□□ -1.05
PTP1P25044 RSC8YFR037C 1674 nt8.51□□□□□ -1.05
PTP1P25044 POT1YIL160C 1254 nt8.51□□□□□ -1.05
PTP1P25044 YJL067WYJL067W 351 nt8.51□□□□□ -1.05
PTP1P25044 GSF2YML048W 1212 nt8.51□□□□□ -1.05
PTP1P25044 YMR262WYMR262W 942 nt8.51□□□□□ -1.05
PTP1P25044 EAF3YPR023C 1206 nt8.51□□□□□ -1.05
PTP1P25044 IML3YBR107C 738 nt8.51□□□□□ -1.05
PTP1P25044 OSH7YHR001W 1314 nt8.51□□□□□ -1.05
PTP1P25044 DAK2YFL053W 1776 nt8.5□□□□□ -1.05
PTP1P25044 PAR32YDL173W 888 nt8.49□□□□□ -1.05
PTP1P25044 YNL024CYNL024C 741 nt8.49□□□□□ -1.05
PTP1P25044 FLR1YBR008C 1647 nt8.48□□□□□ -1.05
PTP1P25044 YPS3YLR121C 1527 nt8.48□□□□□ -1.05
PTP1P25044 CTI6YPL181W 1521 nt8.48□□□□□ -1.05
PTP1P25044 RPC82YPR190C 1965 nt8.48□□□□□ -1.05
PTP1P25044 CWC15YDR163W 528 nt8.47□□□□□ -1.05
PTP1P25044 TIP1YBR067C 633 nt8.47□□□□□ -1.05
PTP1P25044 HEM14YER014W 1620 nt8.47□□□□□ -1.05
PTP1P25044 POP2YNR052C 1302 nt8.46□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 10.9 ms