Protein–RNA interactions for Protein: P0CX23

RPL20A, 60S ribosomal protein L20-A, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPL20AP0CX23 STE4YOR212W 1272 nt8.48□□□□□ -1.05
RPL20AP0CX23 SSN3YPL042C 1668 nt8.48□□□□□ -1.05
RPL20AP0CX23 OYE3YPL171C 1203 nt8.47□□□□□ -1.05
RPL20AP0CX23 RAD51YER095W 1203 nt8.46□□□□□ -1.06
RPL20AP0CX23 RDN25-1RDN25-1 3396 nt8.45□□□□□ -1.06
RPL20AP0CX23 RDN25-2RDN25-2 3396 nt8.45□□□□□ -1.06
RPL20AP0CX23 YJL055WYJL055W 738 nt8.45□□□□□ -1.06
RPL20AP0CX23 YLR349WYLR349W 507 nt8.45□□□□□ -1.06
RPL20AP0CX23 PHO23YNL097C 993 nt8.44□□□□□ -1.06
RPL20AP0CX23 BNI5YNL166C 1347 nt8.44□□□□□ -1.06
RPL20AP0CX23 SEC61YLR378C 1443 nt8.44□□□□□ -1.06
RPL20AP0CX23 SAM2YDR502C 1155 nt8.43□□□□□ -1.06
RPL20AP0CX23 YEL008WYEL008W 381 nt8.43□□□□□ -1.06
RPL20AP0CX23 PET8YNL003C 855 nt8.43□□□□□ -1.06
RPL20AP0CX23 LSB5YCL034W 1065 nt8.43□□□□□ -1.06
RPL20AP0CX23 OXA1YER154W 1209 nt8.42□□□□□ -1.06
RPL20AP0CX23 MSC1YML128C 1542 nt8.42□□□□□ -1.06
RPL20AP0CX23 NUC1YJL208C 990 nt8.41□□□□□ -1.06
RPL20AP0CX23 INA1YLR413W 2028 nt8.4□□□□□ -1.06
RPL20AP0CX23 RPC82YPR190C 1965 nt8.4□□□□□ -1.06
RPL20AP0CX23 RPT5YOR117W 1305 nt8.39□□□□□ -1.07
RPL20AP0CX23 YJL118WYJL118W 660 nt8.39□□□□□ -1.07
RPL20AP0CX23 SAM3YPL274W 1764 nt8.38□□□□□ -1.07
RPL20AP0CX23 YER188WYER188W 720 nt8.36□□□□□ -1.07
RPL20AP0CX23 FLR1YBR008C 1647 nt8.36□□□□□ -1.07
RPL20AP0CX23 FUB1YCR076C 753 nt8.35□□□□□ -1.07
RPL20AP0CX23 ADH7YCR105W 1086 nt8.35□□□□□ -1.07
RPL20AP0CX23 DLD2YDL178W 1593 nt8.35□□□□□ -1.07
RPL20AP0CX23 GAL3YDR009W 1563 nt8.35□□□□□ -1.07
RPL20AP0CX23 GPN2YOR262W 1044 nt8.34□□□□□ -1.07
RPL20AP0CX23 RIB7YBR153W 735 nt8.33□□□□□ -1.08
RPL20AP0CX23 FMS1YMR020W 1527 nt8.33□□□□□ -1.08
RPL20AP0CX23 CPD1YGR247W 720 nt8.32□□□□□ -1.08
RPL20AP0CX23 PAU15YIR041W 375 nt8.32□□□□□ -1.08
RPL20AP0CX23 RAS2YNL098C 969 nt8.32□□□□□ -1.08
RPL20AP0CX23 RSC8YFR037C 1674 nt8.32□□□□□ -1.08
RPL20AP0CX23 CCT5YJR064W 1689 nt8.32□□□□□ -1.08
RPL20AP0CX23 YPS3YLR121C 1527 nt8.31□□□□□ -1.08
RPL20AP0CX23 CWC15YDR163W 528 nt8.31□□□□□ -1.08
RPL20AP0CX23 SPT20YOL148C 1815 nt8.31□□□□□ -1.08
RPL20AP0CX23 CMP2YML057W 1815 nt8.29□□□□□ -1.08
RPL20AP0CX23 OYE2YHR179W 1203 nt8.29□□□□□ -1.08
RPL20AP0CX23 SPP2YOR148C 558 nt8.29□□□□□ -1.08
RPL20AP0CX23 TPS1YBR126C 1488 nt8.29□□□□□ -1.08
RPL20AP0CX23 ACH1YBL015W 1581 nt8.28□□□□□ -1.08
RPL20AP0CX23 EAF3YPR023C 1206 nt8.27□□□□□ -1.09
RPL20AP0CX23 OSH7YHR001W 1314 nt8.27□□□□□ -1.09
RPL20AP0CX23 HEM13YDR044W 987 nt8.25□□□□□ -1.09
RPL20AP0CX23 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt8.25□□□□□ -1.09
RPL20AP0CX23 YOR325WYOR325W 474 nt8.24□□□□□ -1.09
RPL20AP0CX23 ILV3YJR016C 1758 nt8.23□□□□□ -1.09
RPL20AP0CX23 SNZ1YMR096W 894 nt8.23□□□□□ -1.09
RPL20AP0CX23 SOL2YCR073W-A 948 nt8.21□□□□□ -1.1
RPL20AP0CX23 THI72YOR192C 1800 nt8.21□□□□□ -1.1
RPL20AP0CX23 VPS62YGR141W 1404 nt8.2□□□□□ -1.1
RPL20AP0CX23 TMA23YMR269W 636 nt8.2□□□□□ -1.1
RPL20AP0CX23 YPR126CYPR126C 309 nt8.2□□□□□ -1.1
RPL20AP0CX23 ESS1YJR017C 513 nt8.19□□□□□ -1.1
RPL20AP0CX23 DAK2YFL053W 1776 nt8.19□□□□□ -1.1
RPL20AP0CX23 CCT2YIL142W 1584 nt8.18□□□□□ -1.1
RPL20AP0CX23 TAT2YOL020W 1779 nt8.18□□□□□ -1.1
RPL20AP0CX23 TAF13YML098W 504 nt8.18□□□□□ -1.1
RPL20AP0CX23 OPI10YOL032W 741 nt8.18□□□□□ -1.1
RPL20AP0CX23 DDI1YER143W 1287 nt8.17□□□□□ -1.1
RPL20AP0CX23 LSM5YER146W 282 nt8.17□□□□□ -1.1
RPL20AP0CX23 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt8.17□□□□□ -1.1
RPL20AP0CX23 YDL086WYDL086W 822 nt8.16□□□□□ -1.1
RPL20AP0CX23 YNL024CYNL024C 741 nt8.16□□□□□ -1.1
RPL20AP0CX23 YDR455CYDR455C 309 nt8.14□□□□□ -1.11
RPL20AP0CX23 IMO32YGR031W 1029 nt8.14□□□□□ -1.11
RPL20AP0CX23 MHF1YOL086W-A 273 nt8.14□□□□□ -1.11
RPL20AP0CX23 IML3YBR107C 738 nt8.14□□□□□ -1.11
RPL20AP0CX23 CTI6YPL181W 1521 nt8.13□□□□□ -1.11
RPL20AP0CX23 MUP1YGR055W 1725 nt8.13□□□□□ -1.11
RPL20AP0CX23 PAU5YFL020C 369 nt8.13□□□□□ -1.11
RPL20AP0CX23 LSB6YJL100W 1824 nt8.13□□□□□ -1.11
RPL20AP0CX23 BSP1YPR171W 1731 nt8.12□□□□□ -1.11
RPL20AP0CX23 ASP3-1YLR155C 1089 nt8.12□□□□□ -1.11
RPL20AP0CX23 ASP3-2YLR157C 1089 nt8.12□□□□□ -1.11
RPL20AP0CX23 ASP3-3YLR158C 1089 nt8.12□□□□□ -1.11
RPL20AP0CX23 ASP3-4YLR160C 1089 nt8.12□□□□□ -1.11
RPL20AP0CX23 PGC1YPL206C 966 nt8.12□□□□□ -1.11
RPL20AP0CX23 HOL1YNR055C 1761 nt8.11□□□□□ -1.11
RPL20AP0CX23 POT1YIL160C 1254 nt8.1□□□□□ -1.11
RPL20AP0CX23 YMR262WYMR262W 942 nt8.1□□□□□ -1.11
RPL20AP0CX23 STP3YLR375W 1032 nt8.09□□□□□ -1.11
RPL20AP0CX23 RRT8YOL048C 1029 nt8.09□□□□□ -1.11
RPL20AP0CX23 ERG13YML126C 1476 nt8.07□□□□□ -1.12
RPL20AP0CX23 YBR232CYBR232C 360 nt8.07□□□□□ -1.12
RPL20AP0CX23 ARO8YGL202W 1503 nt8.07□□□□□ -1.12
RPL20AP0CX23 HSL7YBR133C 2484 nt8.07□□□□□ -1.12
RPL20AP0CX23 COQ8YGL119W 1506 nt8.05□□□□□ -1.12
RPL20AP0CX23 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt8.05□□□□□ -1.12
RPL20AP0CX23 SPS100YHR139C 981 nt8.05□□□□□ -1.12
RPL20AP0CX23 AIM1YAL046C 357 nt8.05□□□□□ -1.12
RPL20AP0CX23 GSF2YML048W 1212 nt8.05□□□□□ -1.12
RPL20AP0CX23 BET2YPR176C 978 nt8.05□□□□□ -1.12
RPL20AP0CX23 ADE8YDR408C 645 nt8.04□□□□□ -1.12
RPL20AP0CX23 DIG1YPL049C 1359 nt8.03□□□□□ -1.12
RPL20AP0CX23 SEN2YLR105C 1134 nt8.03□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.3 ms