Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D5

ARFGEF2, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF2Q9Y6D5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARFGEF2Q9Y6D5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARFGEF2Q9Y6D5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARFGEF2Q9Y6D5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARFGEF2Q9Y6D5 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARFGEF2Q9Y6D5 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARFGEF2Q9Y6D5 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ARFGEF2Q9Y6D5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARFGEF2Q9Y6D5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARFGEF2Q9Y6D5 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARFGEF2Q9Y6D5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARFGEF2Q9Y6D5 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARFGEF2Q9Y6D5 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARFGEF2Q9Y6D5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARFGEF2Q9Y6D5 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARFGEF2Q9Y6D5 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARFGEF2Q9Y6D5 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARFGEF2Q9Y6D5 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ARFGEF2Q9Y6D5 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARFGEF2Q9Y6D5 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARFGEF2Q9Y6D5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARFGEF2Q9Y6D5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARFGEF2Q9Y6D5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARFGEF2Q9Y6D5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARFGEF2Q9Y6D5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARFGEF2Q9Y6D5 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARFGEF2Q9Y6D5 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARFGEF2Q9Y6D5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ARFGEF2Q9Y6D5 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARFGEF2Q9Y6D5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARFGEF2Q9Y6D5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARFGEF2Q9Y6D5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARFGEF2Q9Y6D5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARFGEF2Q9Y6D5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARFGEF2Q9Y6D5 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ARFGEF2Q9Y6D5 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ARFGEF2Q9Y6D5 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARFGEF2Q9Y6D5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARFGEF2Q9Y6D5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARFGEF2Q9Y6D5 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ARFGEF2Q9Y6D5 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARFGEF2Q9Y6D5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
ARFGEF2Q9Y6D5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
ARFGEF2Q9Y6D5 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARFGEF2Q9Y6D5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARFGEF2Q9Y6D5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARFGEF2Q9Y6D5 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARFGEF2Q9Y6D5 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARFGEF2Q9Y6D5 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARFGEF2Q9Y6D5 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARFGEF2Q9Y6D5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARFGEF2Q9Y6D5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARFGEF2Q9Y6D5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARFGEF2Q9Y6D5 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARFGEF2Q9Y6D5 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARFGEF2Q9Y6D5 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARFGEF2Q9Y6D5 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARFGEF2Q9Y6D5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARFGEF2Q9Y6D5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARFGEF2Q9Y6D5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARFGEF2Q9Y6D5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARFGEF2Q9Y6D5 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARFGEF2Q9Y6D5 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARFGEF2Q9Y6D5 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ARFGEF2Q9Y6D5 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARFGEF2Q9Y6D5 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARFGEF2Q9Y6D5 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARFGEF2Q9Y6D5 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ARFGEF2Q9Y6D5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARFGEF2Q9Y6D5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARFGEF2Q9Y6D5 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARFGEF2Q9Y6D5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARFGEF2Q9Y6D5 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARFGEF2Q9Y6D5 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARFGEF2Q9Y6D5 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARFGEF2Q9Y6D5 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARFGEF2Q9Y6D5 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARFGEF2Q9Y6D5 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARFGEF2Q9Y6D5 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARFGEF2Q9Y6D5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARFGEF2Q9Y6D5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARFGEF2Q9Y6D5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARFGEF2Q9Y6D5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARFGEF2Q9Y6D5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARFGEF2Q9Y6D5 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARFGEF2Q9Y6D5 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARFGEF2Q9Y6D5 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARFGEF2Q9Y6D5 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARFGEF2Q9Y6D5 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARFGEF2Q9Y6D5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARFGEF2Q9Y6D5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARFGEF2Q9Y6D5 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms