Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ME3Q16798 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ME3Q16798 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ME3Q16798 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ME3Q16798 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ME3Q16798 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ME3Q16798 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ME3Q16798 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ME3Q16798 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ME3Q16798 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ME3Q16798 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ME3Q16798 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ME3Q16798 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ME3Q16798 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ME3Q16798 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ME3Q16798 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ME3Q16798 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ME3Q16798 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ME3Q16798 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ME3Q16798 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ME3Q16798 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ME3Q16798 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ME3Q16798 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ME3Q16798 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ME3Q16798 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ME3Q16798 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ME3Q16798 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ME3Q16798 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ME3Q16798 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ME3Q16798 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ME3Q16798 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ME3Q16798 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ME3Q16798 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ME3Q16798 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ME3Q16798 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ME3Q16798 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ME3Q16798 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ME3Q16798 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ME3Q16798 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ME3Q16798 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ME3Q16798 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ME3Q16798 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ME3Q16798 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ME3Q16798 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ME3Q16798 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ME3Q16798 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ME3Q16798 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ME3Q16798 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ME3Q16798 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ME3Q16798 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ME3Q16798 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ME3Q16798 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ME3Q16798 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ME3Q16798 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ME3Q16798 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ME3Q16798 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ME3Q16798 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ME3Q16798 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ME3Q16798 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ME3Q16798 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ME3Q16798 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ME3Q16798 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ME3Q16798 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ME3Q16798 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ME3Q16798 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ME3Q16798 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ME3Q16798 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ME3Q16798 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ME3Q16798 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ME3Q16798 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ME3Q16798 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ME3Q16798 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ME3Q16798 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ME3Q16798 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ME3Q16798 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ME3Q16798 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ME3Q16798 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ME3Q16798 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ME3Q16798 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ME3Q16798 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ME3Q16798 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ME3Q16798 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ME3Q16798 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ME3Q16798 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ME3Q16798 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ME3Q16798 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ME3Q16798 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ME3Q16798 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ME3Q16798 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ME3Q16798 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ME3Q16798 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ME3Q16798 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ME3Q16798 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ME3Q16798 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ME3Q16798 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ME3Q16798 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ME3Q16798 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ME3Q16798 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ME3Q16798 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ME3Q16798 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
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