Protein–RNA interactions for Protein: Q14112

NID2, Nidogen-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NID2Q14112 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NID2Q14112 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NID2Q14112 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NID2Q14112 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NID2Q14112 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NID2Q14112 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NID2Q14112 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NID2Q14112 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NID2Q14112 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NID2Q14112 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NID2Q14112 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NID2Q14112 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NID2Q14112 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NID2Q14112 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NID2Q14112 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NID2Q14112 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NID2Q14112 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NID2Q14112 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NID2Q14112 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NID2Q14112 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NID2Q14112 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NID2Q14112 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NID2Q14112 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NID2Q14112 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NID2Q14112 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NID2Q14112 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NID2Q14112 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NID2Q14112 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NID2Q14112 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NID2Q14112 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NID2Q14112 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NID2Q14112 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NID2Q14112 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NID2Q14112 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NID2Q14112 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NID2Q14112 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NID2Q14112 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NID2Q14112 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NID2Q14112 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NID2Q14112 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NID2Q14112 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NID2Q14112 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NID2Q14112 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NID2Q14112 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NID2Q14112 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NID2Q14112 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NID2Q14112 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NID2Q14112 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NID2Q14112 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NID2Q14112 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NID2Q14112 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NID2Q14112 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NID2Q14112 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NID2Q14112 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NID2Q14112 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NID2Q14112 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NID2Q14112 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NID2Q14112 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NID2Q14112 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NID2Q14112 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NID2Q14112 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NID2Q14112 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NID2Q14112 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NID2Q14112 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NID2Q14112 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NID2Q14112 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NID2Q14112 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NID2Q14112 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NID2Q14112 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NID2Q14112 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NID2Q14112 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NID2Q14112 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NID2Q14112 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NID2Q14112 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NID2Q14112 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NID2Q14112 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NID2Q14112 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NID2Q14112 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NID2Q14112 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NID2Q14112 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NID2Q14112 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NID2Q14112 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NID2Q14112 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NID2Q14112 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NID2Q14112 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NID2Q14112 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NID2Q14112 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NID2Q14112 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NID2Q14112 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NID2Q14112 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NID2Q14112 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NID2Q14112 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NID2Q14112 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NID2Q14112 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NID2Q14112 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NID2Q14112 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NID2Q14112 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NID2Q14112 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NID2Q14112 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NID2Q14112 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
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