Protein–RNA interactions for Protein: Q12217

TY1A-BR, Transposon Ty1-BR Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-BRQ12217 MNN1YER001W 2289 nt5.4□□□□□ -1.55
TY1A-BRQ12217 RNH70YGR276C 1662 nt5.4□□□□□ -1.55
TY1A-BRQ12217 NIC96YFR002W 2520 nt5.39□□□□□ -1.55
TY1A-BRQ12217 OPI6YDL096C 327 nt5.39□□□□□ -1.55
TY1A-BRQ12217 GRX4YER174C 735 nt5.39□□□□□ -1.55
TY1A-BRQ12217 AGX1YFL030W 1158 nt5.39□□□□□ -1.55
TY1A-BRQ12217 YHL026CYHL026C 948 nt5.39□□□□□ -1.55
TY1A-BRQ12217 YAL056C-AYAL056C-A 351 nt5.39□□□□□ -1.55
TY1A-BRQ12217 YKE2YLR200W 345 nt5.39□□□□□ -1.55
TY1A-BRQ12217 IST1YNL265C 897 nt5.39□□□□□ -1.55
TY1A-BRQ12217 SPE3YPR069C 882 nt5.39□□□□□ -1.55
TY1A-BRQ12217 NDC80YIL144W 2076 nt5.39□□□□□ -1.55
TY1A-BRQ12217 GSY2YLR258W 2118 nt5.39□□□□□ -1.55
TY1A-BRQ12217 ATG21YPL100W 1491 nt5.39□□□□□ -1.55
TY1A-BRQ12217 DBF2YGR092W 1719 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1A-BRQ12217 MDM36YPR083W 1740 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1A-BRQ12217 NOP6YDL213C 678 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1A-BRQ12217 SUR2YDR297W 1050 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1A-BRQ12217 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1A-BRQ12217 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1A-BRQ12217 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1A-BRQ12217 SUP51tL(UAA)J 84 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1A-BRQ12217 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1A-BRQ12217 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1A-BRQ12217 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1A-BRQ12217 BIO2YGR286C 1128 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1A-BRQ12217 YLR358CYLR358C 564 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1A-BRQ12217 TAF9YMR236W 474 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1A-BRQ12217 HUB1YNR032C-A 222 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1A-BRQ12217 INO4YOL108C 456 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1A-BRQ12217 VPS52YDR484W 1926 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1A-BRQ12217 TRP5YGL026C 2124 nt5.38□□□□□ -1.55
TY1A-BRQ12217 CWC21YDR482C 408 nt5.37□□□□□ -1.55
TY1A-BRQ12217 HMF1YER057C 390 nt5.37□□□□□ -1.55
TY1A-BRQ12217 YGL102CYGL102C 429 nt5.37□□□□□ -1.55
TY1A-BRQ12217 YGR164WYGR164W 336 nt5.37□□□□□ -1.55
TY1A-BRQ12217 YLR458WYLR458W 381 nt5.37□□□□□ -1.55
TY1A-BRQ12217 TMC1YOR052C 453 nt5.37□□□□□ -1.55
TY1A-BRQ12217 GUD1YDL238C 1470 nt5.37□□□□□ -1.55
TY1A-BRQ12217 BRF1YGR246C 1791 nt5.37□□□□□ -1.55
TY1A-BRQ12217 GSM1YJL103C 1857 nt5.37□□□□□ -1.55
TY1A-BRQ12217 SCY1YGL083W 2415 nt5.36□□□□□ -1.55
TY1A-BRQ12217 YFL015CYFL015C 495 nt5.36□□□□□ -1.55
TY1A-BRQ12217 YGL088WYGL088W 366 nt5.36□□□□□ -1.55
TY1A-BRQ12217 RPS2YGL123W 765 nt5.36□□□□□ -1.55
TY1A-BRQ12217 YIA6YIL006W 1122 nt5.36□□□□□ -1.55
TY1A-BRQ12217 YPL039WYPL039W 951 nt5.36□□□□□ -1.55
TY1A-BRQ12217 PEX30YLR324W 1572 nt5.36□□□□□ -1.55
TY1A-BRQ12217 YKU70YMR284W 1809 nt5.36□□□□□ -1.55
TY1A-BRQ12217 GPB2YAL056W 2643 nt5.36□□□□□ -1.55
TY1A-BRQ12217 SYO1YDL063C 1863 nt5.35□□□□□ -1.55
TY1A-BRQ12217 GPI10YGL142C 1851 nt5.35□□□□□ -1.55
TY1A-BRQ12217 SCW11YGL028C 1629 nt5.35□□□□□ -1.55
TY1A-BRQ12217 BNA4YBL098W 1383 nt5.35□□□□□ -1.55
TY1A-BRQ12217 MFA1YDR461W 111 nt5.35□□□□□ -1.55
TY1A-BRQ12217 RPL30YGL030W 318 nt5.35□□□□□ -1.55
TY1A-BRQ12217 SPG1YGR236C 288 nt5.35□□□□□ -1.55
TY1A-BRQ12217 RPE1YJL121C 717 nt5.35□□□□□ -1.55
TY1A-BRQ12217 CNB1YKL190W 528 nt5.35□□□□□ -1.55
TY1A-BRQ12217 HHF2YNL030W 312 nt5.35□□□□□ -1.55
TY1A-BRQ12217 HTZ1YOL012C 405 nt5.35□□□□□ -1.55
TY1A-BRQ12217 RPC40YPR110C 1008 nt5.35□□□□□ -1.55
TY1A-BRQ12217 NTE1YML059C 5040 nt5.35□□□□□ -1.55
TY1A-BRQ12217 TUL1YKL034W 2277 nt5.35□□□□□ -1.55
TY1A-BRQ12217 CRZ1YNL027W 2037 nt5.35□□□□□ -1.55
TY1A-BRQ12217 HRQ1YDR291W 3234 nt5.35□□□□□ -1.55
TY1A-BRQ12217 SSZ1YHR064C 1617 nt5.34□□□□□ -1.55
TY1A-BRQ12217 RNR3YIL066C 2610 nt5.34□□□□□ -1.55
TY1A-BRQ12217 IMD4YML056C 1575 nt5.34□□□□□ -1.55
TY1A-BRQ12217 GUA1YMR217W 1578 nt5.34□□□□□ -1.55
TY1A-BRQ12217 YIR007WYIR007W 2295 nt5.34□□□□□ -1.55
TY1A-BRQ12217 SUM1YDR310C 3189 nt5.34□□□□□ -1.55
TY1A-BRQ12217 YER076W-AYER076W-A 348 nt5.34□□□□□ -1.55
TY1A-BRQ12217 TRR2YHR106W 1029 nt5.34□□□□□ -1.55
TY1A-BRQ12217 YIL012WYIL012W 342 nt5.34□□□□□ -1.55
TY1A-BRQ12217 YJR146WYJR146W 354 nt5.34□□□□□ -1.55
TY1A-BRQ12217 YKL223WYKL223W 333 nt5.34□□□□□ -1.55
TY1A-BRQ12217 RDN58-1RDN58-1 158 nt5.34□□□□□ -1.55
TY1A-BRQ12217 RDN58-2RDN58-2 158 nt5.34□□□□□ -1.55
TY1A-BRQ12217 YPL229WYPL229W 621 nt5.34□□□□□ -1.55
TY1A-BRQ12217 VPS45YGL095C 1734 nt5.34□□□□□ -1.56
TY1A-BRQ12217 AMD2YDR242W 1650 nt5.34□□□□□ -1.56
TY1A-BRQ12217 YRR1YOR162C 2433 nt5.33□□□□□ -1.56
TY1A-BRQ12217 SNA4YDL123W 423 nt5.33□□□□□ -1.56
TY1A-BRQ12217 VMA3YEL027W 483 nt5.33□□□□□ -1.56
TY1A-BRQ12217 YIL032CYIL032C 357 nt5.33□□□□□ -1.56
TY1A-BRQ12217 GPP1YIL053W 753 nt5.33□□□□□ -1.56
TY1A-BRQ12217 RPL40AYIL148W 387 nt5.33□□□□□ -1.56
TY1A-BRQ12217 RIB1YBL033C 1038 nt5.33□□□□□ -1.56
TY1A-BRQ12217 DIB1YPR082C 432 nt5.33□□□□□ -1.56
TY1A-BRQ12217 REI1YBR267W 1182 nt5.33□□□□□ -1.56
TY1A-BRQ12217 DPB3YBR278W 606 nt5.33□□□□□ -1.56
TY1A-BRQ12217 MID1YNL291C 1647 nt5.33□□□□□ -1.56
TY1A-BRQ12217 FRE1YLR214W 2061 nt5.32□□□□□ -1.56
TY1A-BRQ12217 HDA2YDR295C 2025 nt5.32□□□□□ -1.56
TY1A-BRQ12217 CSN9YDR179C 489 nt5.32□□□□□ -1.56
TY1A-BRQ12217 YLR076CYLR076C 423 nt5.32□□□□□ -1.56
TY1A-BRQ12217 YLR428CYLR428C 345 nt5.32□□□□□ -1.56
TY1A-BRQ12217 ILV6YCL009C 930 nt5.32□□□□□ -1.56
TY1A-BRQ12217 SUL2YLR092W 2682 nt5.32□□□□□ -1.56
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