Protein–RNA interactions for Protein: Q07807

PUF3, mRNA-binding protein PUF3, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF3Q07807 AYT1YLL063C 1425 nt4.66□□□□□ -1.66
PUF3Q07807 YCR050CYCR050C 309 nt4.66□□□□□ -1.66
PUF3Q07807 YCR090CYCR090C 549 nt4.66□□□□□ -1.66
PUF3Q07807 MRPL11YDL202W 750 nt4.66□□□□□ -1.66 RIP-Chip
PUF3Q07807 API2YDR525W 330 nt4.66□□□□□ -1.66
PUF3Q07807 RPL34AYER056C-A 366 nt4.66□□□□□ -1.66
PUF3Q07807 SEC53YFL045C 765 nt4.66□□□□□ -1.66
PUF3Q07807 CSE4YKL049C 690 nt4.66□□□□□ -1.66
PUF3Q07807 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt4.66□□□□□ -1.66
PUF3Q07807 YLL044WYLL044W 447 nt4.66□□□□□ -1.66
PUF3Q07807 ERG2YMR202W 669 nt4.66□□□□□ -1.66
PUF3Q07807 YOR203WYOR203W 354 nt4.66□□□□□ -1.66
PUF3Q07807 SSA2YLL024C 1920 nt4.66□□□□□ -1.66
PUF3Q07807 MET4YNL103W 2019 nt4.65□□□□□ -1.66
PUF3Q07807 LAS21YJL062W 2493 nt4.65□□□□□ -1.66
PUF3Q07807 YHL048C-AYHL048C-A 135 nt4.65□□□□□ -1.67
PUF3Q07807 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt4.65□□□□□ -1.67
PUF3Q07807 YIL165CYIL165C 360 nt4.65□□□□□ -1.67
PUF3Q07807 REE1YJL217W 597 nt4.65□□□□□ -1.67
PUF3Q07807 YKL070WYKL070W 510 nt4.65□□□□□ -1.67
PUF3Q07807 AFB1YLR040C 675 nt4.65□□□□□ -1.67
PUF3Q07807 FBP1YLR377C 1047 nt4.65□□□□□ -1.67
PUF3Q07807 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt4.65□□□□□ -1.67
PUF3Q07807 IRC16YPR038W 360 nt4.65□□□□□ -1.67
PUF3Q07807 YCL021W-AYCL021W-A 378 nt4.65□□□□□ -1.67
PUF3Q07807 CYM1YDR430C 2970 nt4.65□□□□□ -1.67 RIP-Chip
PUF3Q07807 APC1YNL172W 5247 nt4.64□□□□□ -1.67
PUF3Q07807 KAP114YGL241W 3015 nt4.64□□□□□ -1.67
PUF3Q07807 ARP5YNL059C 2268 nt4.64□□□□□ -1.67
PUF3Q07807 IKS1YJL057C 2004 nt4.64□□□□□ -1.67
PUF3Q07807 MRM2YGL136C 963 nt4.64□□□□□ -1.67
PUF3Q07807 BLI1YKL061W 342 nt4.64□□□□□ -1.67
PUF3Q07807 YAR075WYAR075W 474 nt4.64□□□□□ -1.67
PUF3Q07807 YOR034C-AYOR034C-A 243 nt4.64□□□□□ -1.67
PUF3Q07807 MRPL51YPR100W 423 nt4.64□□□□□ -1.67 RIP-Chip
PUF3Q07807 POF1YCL047C 777 nt4.64□□□□□ -1.67
PUF3Q07807 IMD2YHR216W 1572 nt4.64□□□□□ -1.67
PUF3Q07807 MTL1YGR023W 1656 nt4.64□□□□□ -1.67
PUF3Q07807 PEP5YMR231W 3090 nt4.64□□□□□ -1.67
PUF3Q07807 TRM44YPL030W 1704 nt4.63□□□□□ -1.67
PUF3Q07807 VHC1YBR235W 3363 nt4.63□□□□□ -1.67
PUF3Q07807 HOT1YMR172W 2160 nt4.63□□□□□ -1.67 RIP-Chip
PUF3Q07807 CUE3YGL110C 1875 nt4.63□□□□□ -1.67
PUF3Q07807 LPP1YDR503C 825 nt4.63□□□□□ -1.67
PUF3Q07807 SPO73YER046W 432 nt4.63□□□□□ -1.67
PUF3Q07807 SPR6YER115C 576 nt4.63□□□□□ -1.67
PUF3Q07807 BNA6YFR047C 888 nt4.63□□□□□ -1.67
PUF3Q07807 YHI9YHR029C 885 nt4.63□□□□□ -1.67
PUF3Q07807 YIL054WYIL054W 318 nt4.63□□□□□ -1.67
PUF3Q07807 YOR277CYOR277C 309 nt4.63□□□□□ -1.67
PUF3Q07807 YBR012W-AYBR012W-A 1323 nt4.63□□□□□ -1.67
PUF3Q07807 YOR142W-AYOR142W-A 1323 nt4.63□□□□□ -1.67
PUF3Q07807 YPR158W-AYPR158W-A 1323 nt4.63□□□□□ -1.67
PUF3Q07807 GSM1YJL103C 1857 nt4.62□□□□□ -1.67
PUF3Q07807 CDC14YFR028C 1656 nt4.62□□□□□ -1.67
PUF3Q07807 MIH1YMR036C 1665 nt4.62□□□□□ -1.67
PUF3Q07807 YDR274CYDR274C 372 nt4.62□□□□□ -1.67
PUF3Q07807 YEL053W-AYEL053W-A 348 nt4.62□□□□□ -1.67
PUF3Q07807 YER137W-AYER137W-A 306 nt4.62□□□□□ -1.67
PUF3Q07807 ERV1YGR029W 570 nt4.62□□□□□ -1.67
PUF3Q07807 RSM25YIL093C 795 nt4.62□□□□□ -1.67 RIP-Chip
PUF3Q07807 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt4.62□□□□□ -1.67
PUF3Q07807 YNR042WYNR042W 429 nt4.62□□□□□ -1.67
PUF3Q07807 REI1YBR267W 1182 nt4.62□□□□□ -1.67
PUF3Q07807 MNN4YKL201C 3537 nt4.62□□□□□ -1.67
PUF3Q07807 YMR221CYMR221C 1515 nt4.62□□□□□ -1.67
PUF3Q07807 HOM3YER052C 1584 nt4.61□□□□□ -1.67
PUF3Q07807 YDR261C-DYDR261C-D 4815 nt4.61□□□□□ -1.67
PUF3Q07807 RMT2YDR465C 1239 nt4.61□□□□□ -1.67
PUF3Q07807 MPC3YGR243W 441 nt4.61□□□□□ -1.67
PUF3Q07807 YPT53YNL093W 663 nt4.61□□□□□ -1.67
PUF3Q07807 PUF2YPR042C 3228 nt4.61□□□□□ -1.67
PUF3Q07807 MCM2YBL023C 2607 nt4.61□□□□□ -1.67
PUF3Q07807 KIN3YAR018C 1308 nt4.61□□□□□ -1.67
PUF3Q07807 SSF2YDR312W 1362 nt4.61□□□□□ -1.67 RIP-Chip
PUF3Q07807 DHR2YKL078W 2208 nt4.61□□□□□ -1.67
PUF3Q07807 MSM1YGR171C 1728 nt4.6□□□□□ -1.67 RIP-Chip
PUF3Q07807 MDM30YLR368W 1797 nt4.6□□□□□ -1.67
PUF3Q07807 PFK1YGR240C 2964 nt4.6□□□□□ -1.67
PUF3Q07807 CDC9YDL164C 2268 nt4.6□□□□□ -1.67
PUF3Q07807 RPS11AYDR025W 471 nt4.6□□□□□ -1.67
PUF3Q07807 YOS1YER074W-A 258 nt4.6□□□□□ -1.67
PUF3Q07807 DPH1YIL103W 1278 nt4.6□□□□□ -1.67
PUF3Q07807 YVC1YOR087W 2028 nt4.6□□□□□ -1.67
PUF3Q07807 AGA1YNR044W 2178 nt4.6□□□□□ -1.67
PUF3Q07807 YCR075W-AYCR075W-A 228 nt4.59□□□□□ -1.67
PUF3Q07807 ARX1YDR101C 1782 nt4.59□□□□□ -1.67
PUF3Q07807 YDR115WYDR115W 318 nt4.59□□□□□ -1.67 RIP-Chip
PUF3Q07807 HPR1YDR138W 2259 nt4.59□□□□□ -1.67
PUF3Q07807 POL4YCR014C 1749 nt4.58□□□□□ -1.68
PUF3Q07807 IZH3YLR023C 1632 nt4.58□□□□□ -1.68
PUF3Q07807 VMA10YHR039C-A 345 nt4.58□□□□□ -1.68
PUF3Q07807 tX(XXX)DtX(XXX)D 100 nt4.58□□□□□ -1.68
PUF3Q07807 YKL065W-AYKL065W-A 222 nt4.58□□□□□ -1.68
PUF3Q07807 MRPL20YKR085C 588 nt4.58□□□□□ -1.68 RIP-Chip
PUF3Q07807 YLR434CYLR434C 384 nt4.58□□□□□ -1.68
PUF3Q07807 RPS1BYML063W 768 nt4.58□□□□□ -1.68
PUF3Q07807 EOS1YNL080C 1101 nt4.58□□□□□ -1.68
PUF3Q07807 YNL184CYNL184C 327 nt4.58□□□□□ -1.68 RIP-Chip
PUF3Q07807 YGK3YOL128C 1128 nt4.58□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 21 ms