Protein–RNA interactions for Protein: P39959

YER130C, Zinc finger protein YER130C, yeastyeast

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YER130CP39959 YBL039W-BYBL039W-B 180 nt3.36□□□□□ -1.87
YER130CP39959 YOR283WYOR283W 693 nt3.36□□□□□ -1.87
YER130CP39959 JID1YPR061C 906 nt3.36□□□□□ -1.87
YER130CP39959 YBR090CYBR090C 369 nt3.36□□□□□ -1.87
YER130CP39959 SEC6YIL068C 2418 nt3.36□□□□□ -1.87
YER130CP39959 CPA2YJR109C 3357 nt3.36□□□□□ -1.87
YER130CP39959 MSM1YGR171C 1728 nt3.36□□□□□ -1.87
YER130CP39959 FLO9YAL063C 3969 nt3.36□□□□□ -1.87
YER130CP39959 PKP2YGL059W 1476 nt3.35□□□□□ -1.87
YER130CP39959 SUC2YIL162W 1599 nt3.35□□□□□ -1.87
YER130CP39959 UBP14YBR058C 2346 nt3.35□□□□□ -1.87
YER130CP39959 PIG2YIL045W 1617 nt3.35□□□□□ -1.87
YER130CP39959 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt3.35□□□□□ -1.87
YER130CP39959 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt3.35□□□□□ -1.87
YER130CP39959 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt3.35□□□□□ -1.87
YER130CP39959 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt3.35□□□□□ -1.87
YER130CP39959 SNO3YFL060C 669 nt3.35□□□□□ -1.87
YER130CP39959 CGR1YGL029W 363 nt3.35□□□□□ -1.87
YER130CP39959 YHR180WYHR180W 492 nt3.35□□□□□ -1.87
YER130CP39959 APQ13YJL075C 417 nt3.35□□□□□ -1.87
YER130CP39959 YKR051WYKR051W 1257 nt3.35□□□□□ -1.87
YER130CP39959 RPN13YLR421C 471 nt3.35□□□□□ -1.87
YER130CP39959 SEC14YMR079W 915 nt3.35□□□□□ -1.87
YER130CP39959 YMR087WYMR087W 855 nt3.35□□□□□ -1.87
YER130CP39959 SNO2YNL334C 669 nt3.35□□□□□ -1.87
YER130CP39959 MIX23YBL107C 591 nt3.35□□□□□ -1.87
YER130CP39959 YPL107WYPL107W 747 nt3.35□□□□□ -1.87
YER130CP39959 KAR4YCL055W 1008 nt3.35□□□□□ -1.87
YER130CP39959 PMR1YGL167C 2853 nt3.35□□□□□ -1.87
YER130CP39959 CAF130YGR134W 3369 nt3.35□□□□□ -1.87
YER130CP39959 AGE1YDR524C 1449 nt3.35□□□□□ -1.87
YER130CP39959 ZDS2YML109W 2829 nt3.34□□□□□ -1.87
YER130CP39959 ALG8YOR067C 1734 nt3.34□□□□□ -1.87
YER130CP39959 BYE1YKL005C 1785 nt3.34□□□□□ -1.87
YER130CP39959 RIM1YCR028C-A 408 nt3.34□□□□□ -1.87
YER130CP39959 UBC13YDR092W 462 nt3.34□□□□□ -1.87
YER130CP39959 FRQ1YDR373W 573 nt3.34□□□□□ -1.87
YER130CP39959 PRE1YER012W 597 nt3.34□□□□□ -1.87
YER130CP39959 MRPL9YGR220C 810 nt3.34□□□□□ -1.87
YER130CP39959 SWD2YKL018W 990 nt3.34□□□□□ -1.87
YER130CP39959 SDS22YKL193C 1017 nt3.34□□□□□ -1.87
YER130CP39959 YPL135C-AYPL135C-A 174 nt3.34□□□□□ -1.87
YER130CP39959 YLR177WYLR177W 1887 nt3.34□□□□□ -1.87
YER130CP39959 FAR1YJL157C 2493 nt3.34□□□□□ -1.88
YER130CP39959 SLY41YOR307C 1362 nt3.34□□□□□ -1.88
YER130CP39959 SYT1YPR095C 3681 nt3.34□□□□□ -1.88
YER130CP39959 NOP56YLR197W 1515 nt3.34□□□□□ -1.88
YER130CP39959 SRP1YNL189W 1629 nt3.33□□□□□ -1.88
YER130CP39959 RRP42YDL111C 798 nt3.33□□□□□ -1.88
YER130CP39959 YDR431WYDR431W 312 nt3.33□□□□□ -1.88
YER130CP39959 YEL032C-AYEL032C-A 162 nt3.33□□□□□ -1.88
YER130CP39959 RGI2YIL057C 495 nt3.33□□□□□ -1.88
YER130CP39959 YJL133C-AYJL133C-A 225 nt3.33□□□□□ -1.88
YER130CP39959 ERP1YAR002C-A 660 nt3.33□□□□□ -1.88
YER130CP39959 YLR456WYLR456W 615 nt3.33□□□□□ -1.88
YER130CP39959 RLP7YNL002C 969 nt3.33□□□□□ -1.88
YER130CP39959 ATP11YNL315C 957 nt3.33□□□□□ -1.88
YER130CP39959 ATG13YPR185W 2217 nt3.33□□□□□ -1.88
YER130CP39959 STP1YDR463W 1560 nt3.33□□□□□ -1.88
YER130CP39959 MIP6YHR015W 1980 nt3.32□□□□□ -1.88
YER130CP39959 LOC1YFR001W 615 nt3.32□□□□□ -1.88
YER130CP39959 YHR097CYHR097C 1101 nt3.32□□□□□ -1.88
YER130CP39959 PPX1YHR201C 1194 nt3.32□□□□□ -1.88
YER130CP39959 YHR214C-DYHR214C-D 294 nt3.32□□□□□ -1.88
YER130CP39959 PHD1YKL043W 1101 nt3.32□□□□□ -1.88
YER130CP39959 YLR050CYLR050C 486 nt3.32□□□□□ -1.88
YER130CP39959 YAR069CYAR069C 294 nt3.32□□□□□ -1.88
YER130CP39959 ERG2YMR202W 669 nt3.32□□□□□ -1.88
YER130CP39959 IZH2YOL002C 954 nt3.32□□□□□ -1.88
YER130CP39959 BRX1YOL077C 876 nt3.32□□□□□ -1.88
YER130CP39959 YBR071WYBR071W 636 nt3.32□□□□□ -1.88
YER130CP39959 ERG11YHR007C 1593 nt3.32□□□□□ -1.88
YER130CP39959 HDA2YDR295C 2025 nt3.32□□□□□ -1.88
YER130CP39959 STE6YKL209C 3873 nt3.32□□□□□ -1.88
YER130CP39959 EBS1YDR206W 2655 nt3.31□□□□□ -1.88
YER130CP39959 YDR089WYDR089W 2610 nt3.31□□□□□ -1.88
YER130CP39959 YML096WYML096W 1578 nt3.31□□□□□ -1.88
YER130CP39959 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt3.31□□□□□ -1.88
YER130CP39959 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt3.31□□□□□ -1.88
YER130CP39959 YLR446WYLR446W 1302 nt3.31□□□□□ -1.88
YER130CP39959 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt3.31□□□□□ -1.88
YER130CP39959 YCL020WYCL020W 1317 nt3.31□□□□□ -1.88
YER130CP39959 ERP3YDL018C 678 nt3.31□□□□□ -1.88
YER130CP39959 INP1YMR204C 1263 nt3.31□□□□□ -1.88
YER130CP39959 RXT2YBR095C 1293 nt3.31□□□□□ -1.88
YER130CP39959 FRE4YNR060W 2160 nt3.31□□□□□ -1.88
YER130CP39959 PWP2YCR057C 2772 nt3.3□□□□□ -1.88
YER130CP39959 SLF1YDR515W 1344 nt3.3□□□□□ -1.88
YER130CP39959 YBL005W-AYBL005W-A 1323 nt3.3□□□□□ -1.88
YER130CP39959 ESA1YOR244W 1338 nt3.3□□□□□ -1.88
YER130CP39959 CRD1YDL142C 852 nt3.3□□□□□ -1.88
YER130CP39959 PAU10YDR542W 363 nt3.3□□□□□ -1.88
YER130CP39959 COBQ0105 1158 nt3.3□□□□□ -1.88
YER130CP39959 PAU11YGL261C 363 nt3.3□□□□□ -1.88
YER130CP39959 YGR107WYGR107W 450 nt3.3□□□□□ -1.88
YER130CP39959 YHL005CYHL005C 393 nt3.3□□□□□ -1.88
YER130CP39959 PAU13YHL046C 363 nt3.3□□□□□ -1.88
YER130CP39959 QCR10YHR001W-A 234 nt3.3□□□□□ -1.88
YER130CP39959 ATG27YJL178C 816 nt3.3□□□□□ -1.88
YER130CP39959 NNF1YJR112W 606 nt3.3□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 7.5 ms