Protein–RNA interactions for Protein: P38316

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, yeast

Predictions only

Length 186 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG12	P38316	SPP381	YBR152W	876 nt		2.69	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	PTP3	YER075C	2787 nt		2.68	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	APC11	YDL008W	498 nt		2.68	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	tR(UCU)Q1	tR(UCU)Q1	73 nt		2.68	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	YKL091C	YKL091C	933 nt		2.68	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	YKL156C-A	YKL156C-A	117 nt		2.68	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	YKL162C	YKL162C	1209 nt		2.68	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	SEC65	YML105C	822 nt		2.68	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	YNL171C	YNL171C	369 nt		2.68	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	RPN3	YER021W	1572 nt		2.68	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	RRM3	YHR031C	2172 nt		2.68	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	MPS1	YDL028C	2295 nt		2.68	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	YAT2	YER024W	2772 nt		2.68	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	ESL2	YKR096W	3588 nt		2.68	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	SLN1	YIL147C	3663 nt		2.67	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	21S_rRNA	21S_rRNA	3296 nt		2.67	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	GYL1	YMR192W	2163 nt		2.67	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	IRC3	YDR332W	2070 nt		2.67	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	YCG1	YDR325W	3108 nt		2.67	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	MOT1	YPL082C	5604 nt		2.67	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	MTL1	YGR023W	1656 nt		2.67	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	IPI3	YNL182C	1668 nt		2.67	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	YGR053C	YGR053C	852 nt		2.67	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	LST7	YGR057C	729 nt		2.67	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	YLR400W	YLR400W	474 nt		2.67	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	YOL038C-A	YOL038C-A	96 nt		2.67	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	SEC26	YDR238C	2922 nt		2.67	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	IKI3	YLR384C	4050 nt		2.67	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	MNT3	YIL014W	1893 nt		2.67	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	TOM70	YNL121C	1854 nt		2.67	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	CDC5	YMR001C	2118 nt		2.66	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	PSP1	YDR505C	2526 nt		2.66	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	CWH41	YGL027C	2502 nt		2.66	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	NAB3	YPL190C	2409 nt		2.66	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	YDL050C	YDL050C	372 nt		2.66	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	YER138W-A	YER138W-A	105 nt		2.66	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	YGR168C	YGR168C	1131 nt		2.66	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	RGI2	YIL057C	495 nt		2.66	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	YJR056C	YJR056C	711 nt		2.66	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	EMC6	YLL014W	327 nt		2.66	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	BET5	YML077W	480 nt		2.66	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	YBL107W-A	YBL107W-A	105 nt		2.66	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	RTT10	YPL183C	3042 nt		2.66	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	CBP2	YHL038C	1893 nt		2.66	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	AYT1	YLL063C	1425 nt		2.66	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	YJL132W	YJL132W	2253 nt		2.66	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	YDR186C	YDR186C	2634 nt		2.65	□□□□□ -1.98
ATG12	P38316	YCR016W	YCR016W	873 nt		2.65	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	THO1	YER063W	657 nt		2.65	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	YHR032W-A	YHR032W-A	180 nt		2.65	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	PEX18	YHR160C	852 nt		2.65	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	CTL1	YMR180C	963 nt		2.65	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	YNL109W	YNL109W	546 nt		2.65	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	RSM19	YNR037C	276 nt		2.65	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	YBR085C-A	YBR085C-A	258 nt		2.65	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	MAK21	YDR060W	3078 nt		2.65	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	DUF1	YOL087C	3351 nt		2.65	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	SPP382	YLR424W	2127 nt		2.65	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	EXO84	YBR102C	2262 nt		2.65	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	YDR124W	YDR124W	975 nt		2.64	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	MST27	YGL051W	705 nt		2.64	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	PRP18	YGR006W	756 nt		2.64	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	YHR213W	YHR213W	597 nt		2.64	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	YJR071W	YJR071W	369 nt		2.64	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	ENV10	YLR065C	546 nt		2.64	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	YAR062W	YAR062W	597 nt		2.64	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	AAR2	YBL074C	1068 nt		2.64	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	YOL118C	YOL118C	309 nt		2.64	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	PFY1	YOR122C	381 nt		2.64	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	TFB6	YOR352W	1032 nt		2.64	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	RIX1	YHR197W	2292 nt		2.64	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	SOK1	YDR006C	2706 nt		2.63	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	TPO5	YKL174C	1857 nt		2.63	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	CAF120	YNL278W	3183 nt		2.63	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	YFR010W-A	YFR010W-A	189 nt		2.63	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	MMF1	YIL051C	438 nt		2.63	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	RPS21B	YJL136C	264 nt		2.63	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	HOT13	YKL084W	351 nt		2.63	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	YLL037W	YLL037W	381 nt		2.63	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	TMA10	YLR327C	261 nt		2.63	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	YLR347W-A	YLR347W-A	141 nt		2.63	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	ATG16	YMR159C	453 nt		2.63	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	SSN8	YNL025C	972 nt		2.63	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	YDR034C-D	YDR034C-D	5313 nt		2.63	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	ENP2	YGR145W	2124 nt		2.63	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	VAC14	YLR386W	2643 nt		2.63	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	GIS4	YML006C	2325 nt		2.63	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	TIF4631	YGR162W	2859 nt		2.63	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	EAP1	YKL204W	1899 nt		2.62	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	ROM1	YGR070W	3468 nt		2.62	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	SRO77	YBL106C	3033 nt		2.62	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	MAK5	YBR142W	2322 nt		2.62	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	MIX14	YDR031W	366 nt		2.62	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	TDA10	YGR205W	873 nt		2.62	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	MTG1	YMR097C	1104 nt		2.62	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	RPB8	YOR224C	441 nt		2.62	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	SSP2	YOR242C	1116 nt		2.62	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	YOR283W	YOR283W	693 nt		2.62	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	KAP104	YBR017C	2757 nt		2.62	□□□□□ -1.99
ATG12	P38316	RRP14	YKL082C	1305 nt		2.62	□□□□□ -1.99

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