Protein–RNA interactions for Protein: O94966

USP19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19O94966 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP19O94966 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP19O94966 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP19O94966 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP19O94966 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP19O94966 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP19O94966 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP19O94966 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP19O94966 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP19O94966 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP19O94966 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP19O94966 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP19O94966 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
USP19O94966 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
USP19O94966 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP19O94966 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP19O94966 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
USP19O94966 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP19O94966 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP19O94966 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP19O94966 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP19O94966 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP19O94966 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP19O94966 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP19O94966 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP19O94966 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP19O94966 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
USP19O94966 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP19O94966 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP19O94966 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.16
USP19O94966 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP19O94966 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP19O94966 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP19O94966 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP19O94966 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP19O94966 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP19O94966 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP19O94966 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP19O94966 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP19O94966 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP19O94966 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP19O94966 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP19O94966 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP19O94966 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP19O94966 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP19O94966 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP19O94966 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP19O94966 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP19O94966 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP19O94966 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP19O94966 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP19O94966 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP19O94966 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP19O94966 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP19O94966 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP19O94966 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP19O94966 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP19O94966 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP19O94966 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP19O94966 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP19O94966 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP19O94966 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP19O94966 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP19O94966 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP19O94966 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP19O94966 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP19O94966 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP19O94966 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP19O94966 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP19O94966 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP19O94966 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP19O94966 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
USP19O94966 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP19O94966 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP19O94966 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP19O94966 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP19O94966 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP19O94966 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP19O94966 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP19O94966 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP19O94966 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
USP19O94966 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP19O94966 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP19O94966 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
USP19O94966 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP19O94966 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP19O94966 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP19O94966 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP19O94966 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP19O94966 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP19O94966 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP19O94966 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP19O94966 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP19O94966 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP19O94966 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP19O94966 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP19O94966 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP19O94966 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP19O94966 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP19O94966 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms