Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X3

NOP58, Nucleolar protein 58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP58Q9Y2X3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NOP58Q9Y2X3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NOP58Q9Y2X3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NOP58Q9Y2X3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NOP58Q9Y2X3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NOP58Q9Y2X3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NOP58Q9Y2X3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NOP58Q9Y2X3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NOP58Q9Y2X3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NOP58Q9Y2X3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NOP58Q9Y2X3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NOP58Q9Y2X3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NOP58Q9Y2X3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NOP58Q9Y2X3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NOP58Q9Y2X3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NOP58Q9Y2X3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NOP58Q9Y2X3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NOP58Q9Y2X3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NOP58Q9Y2X3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NOP58Q9Y2X3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NOP58Q9Y2X3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NOP58Q9Y2X3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NOP58Q9Y2X3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NOP58Q9Y2X3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NOP58Q9Y2X3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NOP58Q9Y2X3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NOP58Q9Y2X3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NOP58Q9Y2X3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NOP58Q9Y2X3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NOP58Q9Y2X3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NOP58Q9Y2X3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NOP58Q9Y2X3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
NOP58Q9Y2X3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NOP58Q9Y2X3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NOP58Q9Y2X3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NOP58Q9Y2X3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
NOP58Q9Y2X3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NOP58Q9Y2X3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NOP58Q9Y2X3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NOP58Q9Y2X3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NOP58Q9Y2X3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NOP58Q9Y2X3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NOP58Q9Y2X3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NOP58Q9Y2X3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NOP58Q9Y2X3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NOP58Q9Y2X3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NOP58Q9Y2X3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NOP58Q9Y2X3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NOP58Q9Y2X3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NOP58Q9Y2X3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NOP58Q9Y2X3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NOP58Q9Y2X3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NOP58Q9Y2X3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NOP58Q9Y2X3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NOP58Q9Y2X3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NOP58Q9Y2X3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NOP58Q9Y2X3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NOP58Q9Y2X3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NOP58Q9Y2X3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NOP58Q9Y2X3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NOP58Q9Y2X3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NOP58Q9Y2X3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NOP58Q9Y2X3 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NOP58Q9Y2X3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NOP58Q9Y2X3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NOP58Q9Y2X3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NOP58Q9Y2X3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NOP58Q9Y2X3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NOP58Q9Y2X3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NOP58Q9Y2X3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NOP58Q9Y2X3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NOP58Q9Y2X3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NOP58Q9Y2X3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NOP58Q9Y2X3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NOP58Q9Y2X3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NOP58Q9Y2X3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NOP58Q9Y2X3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NOP58Q9Y2X3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NOP58Q9Y2X3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NOP58Q9Y2X3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NOP58Q9Y2X3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NOP58Q9Y2X3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NOP58Q9Y2X3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NOP58Q9Y2X3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NOP58Q9Y2X3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NOP58Q9Y2X3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NOP58Q9Y2X3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NOP58Q9Y2X3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NOP58Q9Y2X3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NOP58Q9Y2X3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NOP58Q9Y2X3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NOP58Q9Y2X3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NOP58Q9Y2X3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NOP58Q9Y2X3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NOP58Q9Y2X3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NOP58Q9Y2X3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NOP58Q9Y2X3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NOP58Q9Y2X3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NOP58Q9Y2X3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NOP58Q9Y2X3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms