Protein–RNA interactions for Protein: P59089

LINC00205, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00205, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00205P59089 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00205P59089 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00205P59089 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms