Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y210

TRPC6, Short transient receptor potential channel 6, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC6Q9Y210 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRPC6Q9Y210 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRPC6Q9Y210 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRPC6Q9Y210 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRPC6Q9Y210 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRPC6Q9Y210 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRPC6Q9Y210 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRPC6Q9Y210 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRPC6Q9Y210 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRPC6Q9Y210 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TRPC6Q9Y210 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRPC6Q9Y210 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRPC6Q9Y210 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TRPC6Q9Y210 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRPC6Q9Y210 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRPC6Q9Y210 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRPC6Q9Y210 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRPC6Q9Y210 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRPC6Q9Y210 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRPC6Q9Y210 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRPC6Q9Y210 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRPC6Q9Y210 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRPC6Q9Y210 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRPC6Q9Y210 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRPC6Q9Y210 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TRPC6Q9Y210 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRPC6Q9Y210 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRPC6Q9Y210 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRPC6Q9Y210 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRPC6Q9Y210 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRPC6Q9Y210 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRPC6Q9Y210 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRPC6Q9Y210 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRPC6Q9Y210 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TRPC6Q9Y210 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRPC6Q9Y210 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRPC6Q9Y210 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRPC6Q9Y210 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRPC6Q9Y210 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRPC6Q9Y210 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRPC6Q9Y210 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRPC6Q9Y210 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRPC6Q9Y210 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRPC6Q9Y210 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRPC6Q9Y210 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRPC6Q9Y210 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRPC6Q9Y210 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRPC6Q9Y210 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRPC6Q9Y210 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRPC6Q9Y210 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRPC6Q9Y210 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRPC6Q9Y210 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRPC6Q9Y210 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRPC6Q9Y210 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRPC6Q9Y210 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TRPC6Q9Y210 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRPC6Q9Y210 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRPC6Q9Y210 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TRPC6Q9Y210 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRPC6Q9Y210 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRPC6Q9Y210 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRPC6Q9Y210 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRPC6Q9Y210 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRPC6Q9Y210 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRPC6Q9Y210 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRPC6Q9Y210 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRPC6Q9Y210 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRPC6Q9Y210 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRPC6Q9Y210 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRPC6Q9Y210 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRPC6Q9Y210 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRPC6Q9Y210 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRPC6Q9Y210 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRPC6Q9Y210 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRPC6Q9Y210 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRPC6Q9Y210 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRPC6Q9Y210 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TRPC6Q9Y210 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TRPC6Q9Y210 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TRPC6Q9Y210 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRPC6Q9Y210 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRPC6Q9Y210 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRPC6Q9Y210 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TRPC6Q9Y210 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRPC6Q9Y210 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TRPC6Q9Y210 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRPC6Q9Y210 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRPC6Q9Y210 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRPC6Q9Y210 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRPC6Q9Y210 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRPC6Q9Y210 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRPC6Q9Y210 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRPC6Q9Y210 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRPC6Q9Y210 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRPC6Q9Y210 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TRPC6Q9Y210 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRPC6Q9Y210 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRPC6Q9Y210 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRPC6Q9Y210 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRPC6Q9Y210 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms