Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHCHD3Q9NX63 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHCHD3Q9NX63 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHCHD3Q9NX63 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHCHD3Q9NX63 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHCHD3Q9NX63 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHCHD3Q9NX63 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHCHD3Q9NX63 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHCHD3Q9NX63 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHCHD3Q9NX63 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHCHD3Q9NX63 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CHCHD3Q9NX63 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHCHD3Q9NX63 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHCHD3Q9NX63 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHCHD3Q9NX63 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHCHD3Q9NX63 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHCHD3Q9NX63 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHCHD3Q9NX63 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHCHD3Q9NX63 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHCHD3Q9NX63 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHCHD3Q9NX63 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHCHD3Q9NX63 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHCHD3Q9NX63 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHCHD3Q9NX63 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHCHD3Q9NX63 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHCHD3Q9NX63 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHCHD3Q9NX63 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHCHD3Q9NX63 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHCHD3Q9NX63 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHCHD3Q9NX63 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHCHD3Q9NX63 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHCHD3Q9NX63 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHCHD3Q9NX63 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHCHD3Q9NX63 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHCHD3Q9NX63 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHCHD3Q9NX63 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHCHD3Q9NX63 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CHCHD3Q9NX63 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CHCHD3Q9NX63 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHCHD3Q9NX63 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHCHD3Q9NX63 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHCHD3Q9NX63 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHCHD3Q9NX63 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHCHD3Q9NX63 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHCHD3Q9NX63 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHCHD3Q9NX63 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHCHD3Q9NX63 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHCHD3Q9NX63 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHCHD3Q9NX63 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHCHD3Q9NX63 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHCHD3Q9NX63 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHCHD3Q9NX63 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHCHD3Q9NX63 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHCHD3Q9NX63 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHCHD3Q9NX63 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHCHD3Q9NX63 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHCHD3Q9NX63 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHCHD3Q9NX63 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CHCHD3Q9NX63 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CHCHD3Q9NX63 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CHCHD3Q9NX63 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CHCHD3Q9NX63 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CHCHD3Q9NX63 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CHCHD3Q9NX63 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CHCHD3Q9NX63 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CHCHD3Q9NX63 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHCHD3Q9NX63 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHCHD3Q9NX63 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHCHD3Q9NX63 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHCHD3Q9NX63 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHCHD3Q9NX63 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHCHD3Q9NX63 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHCHD3Q9NX63 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHCHD3Q9NX63 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHCHD3Q9NX63 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHCHD3Q9NX63 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHCHD3Q9NX63 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHCHD3Q9NX63 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHCHD3Q9NX63 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHCHD3Q9NX63 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHCHD3Q9NX63 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHCHD3Q9NX63 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHCHD3Q9NX63 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHCHD3Q9NX63 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHCHD3Q9NX63 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CHCHD3Q9NX63 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHCHD3Q9NX63 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHCHD3Q9NX63 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHCHD3Q9NX63 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHCHD3Q9NX63 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHCHD3Q9NX63 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHCHD3Q9NX63 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHCHD3Q9NX63 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHCHD3Q9NX63 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHCHD3Q9NX63 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHCHD3Q9NX63 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHCHD3Q9NX63 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHCHD3Q9NX63 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHCHD3Q9NX63 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHCHD3Q9NX63 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.2 ms