Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX79

STRA6, Stimulated by retinoic acid gene 6 protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRA6Q9BX79 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
STRA6Q9BX79 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
STRA6Q9BX79 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
STRA6Q9BX79 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
STRA6Q9BX79 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
STRA6Q9BX79 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
STRA6Q9BX79 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
STRA6Q9BX79 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
STRA6Q9BX79 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
STRA6Q9BX79 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
STRA6Q9BX79 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
STRA6Q9BX79 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STRA6Q9BX79 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STRA6Q9BX79 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
STRA6Q9BX79 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STRA6Q9BX79 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STRA6Q9BX79 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
STRA6Q9BX79 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STRA6Q9BX79 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STRA6Q9BX79 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
STRA6Q9BX79 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
STRA6Q9BX79 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
STRA6Q9BX79 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
STRA6Q9BX79 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
STRA6Q9BX79 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STRA6Q9BX79 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STRA6Q9BX79 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STRA6Q9BX79 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STRA6Q9BX79 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STRA6Q9BX79 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STRA6Q9BX79 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
STRA6Q9BX79 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
STRA6Q9BX79 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STRA6Q9BX79 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
STRA6Q9BX79 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
STRA6Q9BX79 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
STRA6Q9BX79 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STRA6Q9BX79 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
STRA6Q9BX79 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
STRA6Q9BX79 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STRA6Q9BX79 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STRA6Q9BX79 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
STRA6Q9BX79 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
STRA6Q9BX79 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
STRA6Q9BX79 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
STRA6Q9BX79 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
STRA6Q9BX79 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
STRA6Q9BX79 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
STRA6Q9BX79 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
STRA6Q9BX79 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
STRA6Q9BX79 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
STRA6Q9BX79 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
STRA6Q9BX79 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
STRA6Q9BX79 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
STRA6Q9BX79 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
STRA6Q9BX79 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
STRA6Q9BX79 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
STRA6Q9BX79 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
STRA6Q9BX79 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
STRA6Q9BX79 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
STRA6Q9BX79 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
STRA6Q9BX79 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
STRA6Q9BX79 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
STRA6Q9BX79 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
STRA6Q9BX79 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
STRA6Q9BX79 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
STRA6Q9BX79 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
STRA6Q9BX79 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
STRA6Q9BX79 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
STRA6Q9BX79 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
STRA6Q9BX79 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
STRA6Q9BX79 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
STRA6Q9BX79 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
STRA6Q9BX79 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
STRA6Q9BX79 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
STRA6Q9BX79 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
STRA6Q9BX79 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
STRA6Q9BX79 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms