Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ3

USP30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP30Q70CQ3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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USP30Q70CQ3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
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USP30Q70CQ3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
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USP30Q70CQ3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
USP30Q70CQ3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
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