Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ2

PHLDB3, Pleckstrin homology-like domain family B member 3, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDB3Q6NSJ2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHLDB3Q6NSJ2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHLDB3Q6NSJ2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHLDB3Q6NSJ2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHLDB3Q6NSJ2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHLDB3Q6NSJ2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHLDB3Q6NSJ2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHLDB3Q6NSJ2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHLDB3Q6NSJ2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHLDB3Q6NSJ2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHLDB3Q6NSJ2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHLDB3Q6NSJ2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHLDB3Q6NSJ2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHLDB3Q6NSJ2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PHLDB3Q6NSJ2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHLDB3Q6NSJ2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHLDB3Q6NSJ2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHLDB3Q6NSJ2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PHLDB3Q6NSJ2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHLDB3Q6NSJ2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHLDB3Q6NSJ2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHLDB3Q6NSJ2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHLDB3Q6NSJ2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHLDB3Q6NSJ2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHLDB3Q6NSJ2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHLDB3Q6NSJ2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHLDB3Q6NSJ2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHLDB3Q6NSJ2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHLDB3Q6NSJ2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHLDB3Q6NSJ2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHLDB3Q6NSJ2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHLDB3Q6NSJ2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHLDB3Q6NSJ2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHLDB3Q6NSJ2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PHLDB3Q6NSJ2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHLDB3Q6NSJ2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHLDB3Q6NSJ2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHLDB3Q6NSJ2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHLDB3Q6NSJ2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHLDB3Q6NSJ2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PHLDB3Q6NSJ2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PHLDB3Q6NSJ2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PHLDB3Q6NSJ2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PHLDB3Q6NSJ2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PHLDB3Q6NSJ2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PHLDB3Q6NSJ2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PHLDB3Q6NSJ2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PHLDB3Q6NSJ2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PHLDB3Q6NSJ2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PHLDB3Q6NSJ2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHLDB3Q6NSJ2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHLDB3Q6NSJ2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHLDB3Q6NSJ2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHLDB3Q6NSJ2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHLDB3Q6NSJ2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHLDB3Q6NSJ2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHLDB3Q6NSJ2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHLDB3Q6NSJ2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHLDB3Q6NSJ2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHLDB3Q6NSJ2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHLDB3Q6NSJ2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHLDB3Q6NSJ2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHLDB3Q6NSJ2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHLDB3Q6NSJ2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHLDB3Q6NSJ2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHLDB3Q6NSJ2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHLDB3Q6NSJ2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHLDB3Q6NSJ2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHLDB3Q6NSJ2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHLDB3Q6NSJ2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHLDB3Q6NSJ2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHLDB3Q6NSJ2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHLDB3Q6NSJ2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHLDB3Q6NSJ2 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHLDB3Q6NSJ2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PHLDB3Q6NSJ2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHLDB3Q6NSJ2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHLDB3Q6NSJ2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHLDB3Q6NSJ2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHLDB3Q6NSJ2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PHLDB3Q6NSJ2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHLDB3Q6NSJ2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHLDB3Q6NSJ2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHLDB3Q6NSJ2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHLDB3Q6NSJ2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHLDB3Q6NSJ2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHLDB3Q6NSJ2 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHLDB3Q6NSJ2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHLDB3Q6NSJ2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHLDB3Q6NSJ2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHLDB3Q6NSJ2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHLDB3Q6NSJ2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHLDB3Q6NSJ2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHLDB3Q6NSJ2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHLDB3Q6NSJ2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHLDB3Q6NSJ2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHLDB3Q6NSJ2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHLDB3Q6NSJ2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHLDB3Q6NSJ2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHLDB3Q6NSJ2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123 ms