Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC93Q567U6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC93Q567U6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC93Q567U6 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC93Q567U6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC93Q567U6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC93Q567U6 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC93Q567U6 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC93Q567U6 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC93Q567U6 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC93Q567U6 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC93Q567U6 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC93Q567U6 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC93Q567U6 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC93Q567U6 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC93Q567U6 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC93Q567U6 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC93Q567U6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC93Q567U6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC93Q567U6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC93Q567U6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC93Q567U6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC93Q567U6 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC93Q567U6 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC93Q567U6 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC93Q567U6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC93Q567U6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC93Q567U6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC93Q567U6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC93Q567U6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC93Q567U6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC93Q567U6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC93Q567U6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC93Q567U6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC93Q567U6 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC93Q567U6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC93Q567U6 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC93Q567U6 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC93Q567U6 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC93Q567U6 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC93Q567U6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC93Q567U6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC93Q567U6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC93Q567U6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC93Q567U6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC93Q567U6 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC93Q567U6 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC93Q567U6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC93Q567U6 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC93Q567U6 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC93Q567U6 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC93Q567U6 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC93Q567U6 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC93Q567U6 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC93Q567U6 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC93Q567U6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC93Q567U6 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC93Q567U6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC93Q567U6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC93Q567U6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC93Q567U6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC93Q567U6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC93Q567U6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC93Q567U6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC93Q567U6 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC93Q567U6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC93Q567U6 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC93Q567U6 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC93Q567U6 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC93Q567U6 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC93Q567U6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC93Q567U6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC93Q567U6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC93Q567U6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC93Q567U6 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC93Q567U6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC93Q567U6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC93Q567U6 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC93Q567U6 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC93Q567U6 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC93Q567U6 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC93Q567U6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC93Q567U6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC93Q567U6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC93Q567U6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
CCDC93Q567U6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC93Q567U6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC93Q567U6 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC93Q567U6 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC93Q567U6 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms