Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2I5

KRT24, Keratin, type I cytoskeletal 24, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT24Q2M2I5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT24Q2M2I5 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT24Q2M2I5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT24Q2M2I5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT24Q2M2I5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT24Q2M2I5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT24Q2M2I5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT24Q2M2I5 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT24Q2M2I5 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT24Q2M2I5 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT24Q2M2I5 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT24Q2M2I5 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT24Q2M2I5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT24Q2M2I5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT24Q2M2I5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT24Q2M2I5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT24Q2M2I5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT24Q2M2I5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT24Q2M2I5 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT24Q2M2I5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT24Q2M2I5 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT24Q2M2I5 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT24Q2M2I5 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT24Q2M2I5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT24Q2M2I5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT24Q2M2I5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT24Q2M2I5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT24Q2M2I5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT24Q2M2I5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT24Q2M2I5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KRT24Q2M2I5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KRT24Q2M2I5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KRT24Q2M2I5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KRT24Q2M2I5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KRT24Q2M2I5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KRT24Q2M2I5 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KRT24Q2M2I5 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KRT24Q2M2I5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KRT24Q2M2I5 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
KRT24Q2M2I5 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
KRT24Q2M2I5 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KRT24Q2M2I5 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KRT24Q2M2I5 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KRT24Q2M2I5 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
KRT24Q2M2I5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KRT24Q2M2I5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT24Q2M2I5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT24Q2M2I5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT24Q2M2I5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT24Q2M2I5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT24Q2M2I5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT24Q2M2I5 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT24Q2M2I5 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT24Q2M2I5 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT24Q2M2I5 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT24Q2M2I5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT24Q2M2I5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT24Q2M2I5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT24Q2M2I5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT24Q2M2I5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT24Q2M2I5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT24Q2M2I5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT24Q2M2I5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT24Q2M2I5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT24Q2M2I5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT24Q2M2I5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT24Q2M2I5 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT24Q2M2I5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT24Q2M2I5 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT24Q2M2I5 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT24Q2M2I5 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT24Q2M2I5 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT24Q2M2I5 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT24Q2M2I5 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT24Q2M2I5 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT24Q2M2I5 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT24Q2M2I5 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT24Q2M2I5 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT24Q2M2I5 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT24Q2M2I5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT24Q2M2I5 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT24Q2M2I5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT24Q2M2I5 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT24Q2M2I5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT24Q2M2I5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT24Q2M2I5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT24Q2M2I5 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT24Q2M2I5 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT24Q2M2I5 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT24Q2M2I5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT24Q2M2I5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT24Q2M2I5 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT24Q2M2I5 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT24Q2M2I5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT24Q2M2I5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT24Q2M2I5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT24Q2M2I5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT24Q2M2I5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT24Q2M2I5 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT24Q2M2I5 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.6 ms