Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TAF1CQ15572 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TAF1CQ15572 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TAF1CQ15572 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TAF1CQ15572 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TAF1CQ15572 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TAF1CQ15572 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TAF1CQ15572 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TAF1CQ15572 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TAF1CQ15572 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TAF1CQ15572 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TAF1CQ15572 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TAF1CQ15572 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TAF1CQ15572 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TAF1CQ15572 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TAF1CQ15572 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TAF1CQ15572 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TAF1CQ15572 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TAF1CQ15572 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TAF1CQ15572 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TAF1CQ15572 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TAF1CQ15572 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TAF1CQ15572 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TAF1CQ15572 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TAF1CQ15572 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TAF1CQ15572 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TAF1CQ15572 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TAF1CQ15572 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TAF1CQ15572 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TAF1CQ15572 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TAF1CQ15572 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TAF1CQ15572 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TAF1CQ15572 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TAF1CQ15572 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TAF1CQ15572 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TAF1CQ15572 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TAF1CQ15572 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TAF1CQ15572 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TAF1CQ15572 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TAF1CQ15572 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TAF1CQ15572 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TAF1CQ15572 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TAF1CQ15572 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TAF1CQ15572 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TAF1CQ15572 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TAF1CQ15572 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TAF1CQ15572 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TAF1CQ15572 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TAF1CQ15572 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TAF1CQ15572 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TAF1CQ15572 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TAF1CQ15572 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TAF1CQ15572 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TAF1CQ15572 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TAF1CQ15572 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TAF1CQ15572 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TAF1CQ15572 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TAF1CQ15572 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TAF1CQ15572 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TAF1CQ15572 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TAF1CQ15572 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TAF1CQ15572 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TAF1CQ15572 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TAF1CQ15572 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TAF1CQ15572 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TAF1CQ15572 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TAF1CQ15572 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TAF1CQ15572 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TAF1CQ15572 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TAF1CQ15572 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TAF1CQ15572 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TAF1CQ15572 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TAF1CQ15572 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TAF1CQ15572 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TAF1CQ15572 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TAF1CQ15572 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TAF1CQ15572 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TAF1CQ15572 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TAF1CQ15572 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TAF1CQ15572 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF1CQ15572 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF1CQ15572 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF1CQ15572 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF1CQ15572 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF1CQ15572 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF1CQ15572 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF1CQ15572 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF1CQ15572 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF1CQ15572 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF1CQ15572 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF1CQ15572 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF1CQ15572 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TAF1CQ15572 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF1CQ15572 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF1CQ15572 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF1CQ15572 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF1CQ15572 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF1CQ15572 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF1CQ15572 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TAF1CQ15572 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
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