Protein–RNA interactions for Protein: P38316

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, yeast

Predictions only

Length 186 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG12	P38316	VBA4	YDR119W	2307 nt		2.8	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	DUN1	YDL101C	1542 nt		2.8	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	RDS2	YPL133C	1341 nt		2.8	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	GPP2	YER062C	753 nt		2.8	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	YGR121W-A	YGR121W-A	216 nt		2.8	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	PTI1	YGR156W	1278 nt		2.8	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	YIL054W	YIL054W	318 nt		2.8	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	IME1	YJR094C	1083 nt		2.8	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	EBP2	YKL172W	1284 nt		2.8	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	YLR339C	YLR339C	552 nt		2.8	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	AAH1	YNL141W	1044 nt		2.8	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	PPT2	YPL148C	522 nt		2.8	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	ATG5	YPL149W	885 nt		2.8	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	YPL276W	YPL276W	438 nt		2.8	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	YPR053C	YPR053C	456 nt		2.8	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	ESL1	YIL151C	3357 nt		2.8	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	TSC11	YER093C	4293 nt		2.8	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	PFK26	YIL107C	2484 nt		2.8	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	TFC1	YBR123C	1950 nt		2.8	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	MON1	YGL124C	1935 nt		2.8	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	CDH1	YGL003C	1701 nt		2.79	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	MSH2	YOL090W	2895 nt		2.79	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	PKP2	YGL059W	1476 nt		2.79	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	YHR214C-D	YHR214C-D	294 nt		2.79	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	RPS22A	YJL190C	393 nt		2.79	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	YAR069C	YAR069C	294 nt		2.79	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	YBL065W	YBL065W	345 nt		2.79	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	BUD21	YOR078W	645 nt		2.79	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	YPL035C	YPL035C	348 nt		2.79	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	PET20	YPL159C	762 nt		2.79	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	LDH1	YBR204C	1128 nt		2.79	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	PHO81	YGR233C	3537 nt		2.79	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	SGS1	YMR190C	4344 nt		2.79	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	SSE2	YBR169C	2082 nt		2.78	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	SRC1	YML034W	2505 nt		2.78	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	PDR3	YBL005W	2931 nt		2.78	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	TSC13	YDL015C	933 nt		2.78	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	YDR491C	YDR491C	492 nt		2.78	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	TAN1	YGL232W	870 nt		2.78	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	YIL024C	YIL024C	570 nt		2.78	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	tW(CCA)G1	tW(CCA)G1	72 nt		2.78	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	tW(CCA)G2	tW(CCA)G2	72 nt		2.78	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	tW(CCA)J	tW(CCA)J	72 nt		2.78	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	tW(CCA)K	tW(CCA)K	72 nt		2.78	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	tW(CCA)M	tW(CCA)M	72 nt		2.78	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	tW(CCA)P	tW(CCA)P	72 nt		2.78	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	YIL156W-A	YIL156W-A	402 nt		2.78	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	SAW1	YAL027W	786 nt		2.78	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	YLR290C	YLR290C	834 nt		2.78	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	GLO1	YML004C	981 nt		2.78	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	EAF7	YNL136W	1278 nt		2.78	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	SYC1	YOR179C	567 nt		2.78	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	PRM4	YPL156C	855 nt		2.78	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	ARA1	YBR149W	1035 nt		2.78	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	YDR098C-B	YDR098C-B	5268 nt		2.78	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	YDR210C-D	YDR210C-D	5268 nt		2.78	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	YDR316W-B	YDR316W-B	5268 nt		2.78	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	YDR365W-B	YDR365W-B	5268 nt		2.78	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	YER138C	YER138C	5268 nt		2.78	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	YER160C	YER160C	5268 nt		2.78	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	YGR038C-B	YGR038C-B	5268 nt		2.78	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	YGR161C-D	YGR161C-D	5268 nt		2.78	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	YJR027W	YJR027W	5268 nt		2.78	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	YLR157C-B	YLR157C-B	5268 nt		2.78	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	YML039W	YML039W	5268 nt		2.78	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	YML045W	YML045W	5268 nt		2.78	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	YMR050C	YMR050C	5268 nt		2.78	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	YOL103W-B	YOL103W-B	5268 nt		2.78	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	YBR012W-B	YBR012W-B	5271 nt		2.78	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	YOR142W-B	YOR142W-B	5268 nt		2.78	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	YPL257W-B	YPL257W-B	5268 nt		2.78	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	YPR158W-B	YPR158W-B	5271 nt		2.78	□□□□□ -1.96
ATG12	P38316	RIT1	YMR283C	1542 nt		2.78	□□□□□ -1.97
ATG12	P38316	LCB4	YOR171C	1875 nt		2.77	□□□□□ -1.97
ATG12	P38316	CDC20	YGL116W	1833 nt		2.77	□□□□□ -1.97
ATG12	P38316	YEL075C	YEL075C	369 nt		2.77	□□□□□ -1.97
ATG12	P38316	YGR064W	YGR064W	369 nt		2.77	□□□□□ -1.97
ATG12	P38316	MPC3	YGR243W	441 nt		2.77	□□□□□ -1.97
ATG12	P38316	SDP1	YIL113W	630 nt		2.77	□□□□□ -1.97
ATG12	P38316	YNL184C	YNL184C	327 nt		2.77	□□□□□ -1.97
ATG12	P38316	TRM112	YNR046W	408 nt		2.77	□□□□□ -1.97
ATG12	P38316	MRP2	YPR166C	348 nt		2.77	□□□□□ -1.97
ATG12	P38316	MDV1	YJL112W	2145 nt		2.77	□□□□□ -1.97
ATG12	P38316	CIN1	YOR349W	3045 nt		2.76	□□□□□ -1.97
ATG12	P38316	MET5	YJR137C	4329 nt		2.76	□□□□□ -1.97
ATG12	P38316	YPL150W	YPL150W	2706 nt		2.76	□□□□□ -1.97
ATG12	P38316	snR78	snR78	87 nt		2.76	□□□□□ -1.97
ATG12	P38316	YDL242W	YDL242W	354 nt		2.76	□□□□□ -1.97
ATG12	P38316	YEL057C	YEL057C	702 nt		2.76	□□□□□ -1.97
ATG12	P38316	YGL138C	YGL138C	1038 nt		2.76	□□□□□ -1.97
ATG12	P38316	YGR039W	YGR039W	312 nt		2.76	□□□□□ -1.97
ATG12	P38316	DCG1	YIR030C	735 nt		2.76	□□□□□ -1.97
ATG12	P38316	RPS28B	YLR264W	204 nt		2.76	□□□□□ -1.97
ATG12	P38316	YMR141C	YMR141C	309 nt		2.76	□□□□□ -1.97
ATG12	P38316	RPS10A	YOR293W	318 nt		2.76	□□□□□ -1.97
ATG12	P38316	RPL36B	YPL249C-A	303 nt		2.76	□□□□□ -1.97
ATG12	P38316	snR43	snR43	209 nt		2.76	□□□□□ -1.97
ATG12	P38316	UBP8	YMR223W	1416 nt		2.76	□□□□□ -1.97
ATG12	P38316	RCY1	YJL204C	2523 nt		2.75	□□□□□ -1.97
ATG12	P38316	RAX2	YLR084C	3663 nt		2.75	□□□□□ -1.97

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