Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CGGBP1Q9UFW8 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CGGBP1Q9UFW8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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