Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXJ1

C1QTNF1, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF1Q9BXJ1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1QTNF1Q9BXJ1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1QTNF1Q9BXJ1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1QTNF1Q9BXJ1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
C1QTNF1Q9BXJ1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1QTNF1Q9BXJ1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1QTNF1Q9BXJ1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1QTNF1Q9BXJ1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1QTNF1Q9BXJ1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1QTNF1Q9BXJ1 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1QTNF1Q9BXJ1 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
C1QTNF1Q9BXJ1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1QTNF1Q9BXJ1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1QTNF1Q9BXJ1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1QTNF1Q9BXJ1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1QTNF1Q9BXJ1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1QTNF1Q9BXJ1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1QTNF1Q9BXJ1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1QTNF1Q9BXJ1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
C1QTNF1Q9BXJ1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1QTNF1Q9BXJ1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1QTNF1Q9BXJ1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1QTNF1Q9BXJ1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1QTNF1Q9BXJ1 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1QTNF1Q9BXJ1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1QTNF1Q9BXJ1 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1QTNF1Q9BXJ1 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1QTNF1Q9BXJ1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
C1QTNF1Q9BXJ1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1QTNF1Q9BXJ1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1QTNF1Q9BXJ1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1QTNF1Q9BXJ1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1QTNF1Q9BXJ1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1QTNF1Q9BXJ1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1QTNF1Q9BXJ1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
C1QTNF1Q9BXJ1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1QTNF1Q9BXJ1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1QTNF1Q9BXJ1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1QTNF1Q9BXJ1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1QTNF1Q9BXJ1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1QTNF1Q9BXJ1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1QTNF1Q9BXJ1 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1QTNF1Q9BXJ1 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
C1QTNF1Q9BXJ1 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1QTNF1Q9BXJ1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1QTNF1Q9BXJ1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1QTNF1Q9BXJ1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1QTNF1Q9BXJ1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1QTNF1Q9BXJ1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1QTNF1Q9BXJ1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
C1QTNF1Q9BXJ1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1QTNF1Q9BXJ1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1QTNF1Q9BXJ1 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1QTNF1Q9BXJ1 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1QTNF1Q9BXJ1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1QTNF1Q9BXJ1 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1QTNF1Q9BXJ1 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1QTNF1Q9BXJ1 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1QTNF1Q9BXJ1 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1QTNF1Q9BXJ1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1QTNF1Q9BXJ1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1QTNF1Q9BXJ1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1QTNF1Q9BXJ1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1QTNF1Q9BXJ1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1QTNF1Q9BXJ1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1QTNF1Q9BXJ1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1QTNF1Q9BXJ1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C1QTNF1Q9BXJ1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C1QTNF1Q9BXJ1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C1QTNF1Q9BXJ1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C1QTNF1Q9BXJ1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C1QTNF1Q9BXJ1 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms