Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSV6

TSEN34, tRNA-splicing endonuclease subunit Sen34, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSEN34Q9BSV6 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSEN34Q9BSV6 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TSEN34Q9BSV6 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSEN34Q9BSV6 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TSEN34Q9BSV6 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSEN34Q9BSV6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSEN34Q9BSV6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSEN34Q9BSV6 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSEN34Q9BSV6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSEN34Q9BSV6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSEN34Q9BSV6 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSEN34Q9BSV6 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TSEN34Q9BSV6 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSEN34Q9BSV6 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSEN34Q9BSV6 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSEN34Q9BSV6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSEN34Q9BSV6 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSEN34Q9BSV6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSEN34Q9BSV6 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSEN34Q9BSV6 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSEN34Q9BSV6 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSEN34Q9BSV6 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSEN34Q9BSV6 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSEN34Q9BSV6 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSEN34Q9BSV6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSEN34Q9BSV6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSEN34Q9BSV6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSEN34Q9BSV6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSEN34Q9BSV6 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSEN34Q9BSV6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSEN34Q9BSV6 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSEN34Q9BSV6 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSEN34Q9BSV6 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TSEN34Q9BSV6 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TSEN34Q9BSV6 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSEN34Q9BSV6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSEN34Q9BSV6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSEN34Q9BSV6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSEN34Q9BSV6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSEN34Q9BSV6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TSEN34Q9BSV6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TSEN34Q9BSV6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSEN34Q9BSV6 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSEN34Q9BSV6 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSEN34Q9BSV6 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSEN34Q9BSV6 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSEN34Q9BSV6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSEN34Q9BSV6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSEN34Q9BSV6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSEN34Q9BSV6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSEN34Q9BSV6 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSEN34Q9BSV6 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSEN34Q9BSV6 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSEN34Q9BSV6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSEN34Q9BSV6 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSEN34Q9BSV6 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSEN34Q9BSV6 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TSEN34Q9BSV6 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSEN34Q9BSV6 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSEN34Q9BSV6 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSEN34Q9BSV6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSEN34Q9BSV6 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSEN34Q9BSV6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSEN34Q9BSV6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSEN34Q9BSV6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSEN34Q9BSV6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSEN34Q9BSV6 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSEN34Q9BSV6 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSEN34Q9BSV6 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSEN34Q9BSV6 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSEN34Q9BSV6 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSEN34Q9BSV6 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TSEN34Q9BSV6 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSEN34Q9BSV6 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSEN34Q9BSV6 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSEN34Q9BSV6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSEN34Q9BSV6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSEN34Q9BSV6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSEN34Q9BSV6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSEN34Q9BSV6 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSEN34Q9BSV6 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSEN34Q9BSV6 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TSEN34Q9BSV6 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSEN34Q9BSV6 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSEN34Q9BSV6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSEN34Q9BSV6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSEN34Q9BSV6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSEN34Q9BSV6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSEN34Q9BSV6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSEN34Q9BSV6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSEN34Q9BSV6 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSEN34Q9BSV6 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSEN34Q9BSV6 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSEN34Q9BSV6 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSEN34Q9BSV6 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TSEN34Q9BSV6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSEN34Q9BSV6 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSEN34Q9BSV6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSEN34Q9BSV6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSEN34Q9BSV6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms