Protein–RNA interactions for Protein: Q92622

RUBCN, Run domain Beclin-1-interacting and cysteine-rich domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUBCNQ92622 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RUBCNQ92622 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUBCNQ92622 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RUBCNQ92622 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUBCNQ92622 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUBCNQ92622 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUBCNQ92622 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUBCNQ92622 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUBCNQ92622 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RUBCNQ92622 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RUBCNQ92622 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUBCNQ92622 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUBCNQ92622 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUBCNQ92622 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUBCNQ92622 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUBCNQ92622 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUBCNQ92622 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUBCNQ92622 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUBCNQ92622 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUBCNQ92622 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUBCNQ92622 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUBCNQ92622 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUBCNQ92622 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUBCNQ92622 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUBCNQ92622 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUBCNQ92622 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUBCNQ92622 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUBCNQ92622 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RUBCNQ92622 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RUBCNQ92622 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUBCNQ92622 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RUBCNQ92622 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUBCNQ92622 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUBCNQ92622 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUBCNQ92622 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUBCNQ92622 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUBCNQ92622 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUBCNQ92622 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUBCNQ92622 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUBCNQ92622 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RUBCNQ92622 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUBCNQ92622 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUBCNQ92622 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUBCNQ92622 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUBCNQ92622 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RUBCNQ92622 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUBCNQ92622 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUBCNQ92622 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUBCNQ92622 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUBCNQ92622 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUBCNQ92622 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUBCNQ92622 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUBCNQ92622 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RUBCNQ92622 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUBCNQ92622 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUBCNQ92622 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUBCNQ92622 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUBCNQ92622 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUBCNQ92622 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUBCNQ92622 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUBCNQ92622 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUBCNQ92622 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUBCNQ92622 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUBCNQ92622 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUBCNQ92622 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUBCNQ92622 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RUBCNQ92622 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUBCNQ92622 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUBCNQ92622 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUBCNQ92622 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUBCNQ92622 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUBCNQ92622 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUBCNQ92622 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUBCNQ92622 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RUBCNQ92622 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RUBCNQ92622 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUBCNQ92622 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUBCNQ92622 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUBCNQ92622 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUBCNQ92622 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUBCNQ92622 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUBCNQ92622 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUBCNQ92622 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUBCNQ92622 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUBCNQ92622 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUBCNQ92622 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUBCNQ92622 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUBCNQ92622 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUBCNQ92622 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUBCNQ92622 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUBCNQ92622 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUBCNQ92622 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.4 ms