Protein–RNA interactions for Protein: Q12267

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, yeast

Predictions only

Length 1,418 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SMC4	Q12267	TIF35	YDR429C	825 nt		2.98	□□□□□ -1.93
SMC4	Q12267	MPH1	YIR002C	2982 nt		2.98	□□□□□ -1.93
SMC4	Q12267	PBA1	YLR199C	831 nt		2.98	□□□□□ -1.93
SMC4	Q12267	YLR302C	YLR302C	363 nt		2.98	□□□□□ -1.93
SMC4	Q12267	SPO1	YNL012W	1896 nt		2.98	□□□□□ -1.93
SMC4	Q12267	ATG29	YPL166W	642 nt		2.97	□□□□□ -1.93
SMC4	Q12267	FKS1	YLR342W	5631 nt		2.96	□□□□□ -1.94
SMC4	Q12267	YAL026C-A	YAL026C-A	438 nt		2.95	□□□□□ -1.94
SMC4	Q12267	YLR363W-A	YLR363W-A	258 nt		2.95	□□□□□ -1.94
SMC4	Q12267	ARF3	YOR094W	552 nt		2.95	□□□□□ -1.94
SMC4	Q12267	LAP2	YNL045W	2016 nt		2.95	□□□□□ -1.94
SMC4	Q12267	SMP1	YBR182C	1359 nt		2.95	□□□□□ -1.94
SMC4	Q12267	YHP1	YDR451C	1062 nt		2.94	□□□□□ -1.94
SMC4	Q12267	GTR1	YML121W	933 nt		2.94	□□□□□ -1.94
SMC4	Q12267	SSU72	YNL222W	621 nt		2.94	□□□□□ -1.94
SMC4	Q12267	YBR197C	YBR197C	654 nt		2.94	□□□□□ -1.94
SMC4	Q12267	YDR089W	YDR089W	2610 nt		2.94	□□□□□ -1.94
SMC4	Q12267	OAF3	YKR064W	2592 nt		2.94	□□□□□ -1.94
SMC4	Q12267	KAR5	YMR065W	1515 nt		2.94	□□□□□ -1.94
SMC4	Q12267	MGT1	YDL200C	567 nt		2.93	□□□□□ -1.94
SMC4	Q12267	PFA5	YDR459C	1125 nt		2.93	□□□□□ -1.94
SMC4	Q12267	IZH1	YDR492W	951 nt		2.93	□□□□□ -1.94
SMC4	Q12267	YER165C-A	YER165C-A	357 nt		2.93	□□□□□ -1.94
SMC4	Q12267	BRR6	YGL247W	594 nt		2.93	□□□□□ -1.94
SMC4	Q12267	ADH4	YGL256W	1149 nt		2.93	□□□□□ -1.94
SMC4	Q12267	YMR272W-B	YMR272W-B	108 nt		2.93	□□□□□ -1.94
SMC4	Q12267	SNX41	YDR425W	1878 nt		2.93	□□□□□ -1.94
SMC4	Q12267	NIC96	YFR002W	2520 nt		2.93	□□□□□ -1.94
SMC4	Q12267	COS111	YBR203W	2775 nt		2.93	□□□□□ -1.94
SMC4	Q12267	LIF1	YGL090W	1266 nt		2.93	□□□□□ -1.94
SMC4	Q12267	YGL101W	YGL101W	648 nt		2.93	□□□□□ -1.94
SMC4	Q12267	KOG1	YHR186C	4674 nt		2.93	□□□□□ -1.94
SMC4	Q12267	YMR310C	YMR310C	954 nt		2.93	□□□□□ -1.94
SMC4	Q12267	YPR203W	YPR203W	309 nt		2.93	□□□□□ -1.94
SMC4	Q12267	SAD1	YFR005C	1347 nt		2.92	□□□□□ -1.94
SMC4	Q12267	PEX17	YNL214W	600 nt		2.92	□□□□□ -1.94
SMC4	Q12267	AIM39	YOL053W	1188 nt		2.92	□□□□□ -1.94
SMC4	Q12267	VAM10	YOR068C	345 nt		2.92	□□□□□ -1.94
SMC4	Q12267	YKL075C	YKL075C	1353 nt		2.91	□□□□□ -1.94
SMC4	Q12267	CFT1	YDR301W	4074 nt		2.91	□□□□□ -1.94
SMC4	Q12267	snR83	snR83	306 nt		2.91	□□□□□ -1.94
SMC4	Q12267	YDR209C	YDR209C	414 nt		2.91	□□□□□ -1.94
SMC4	Q12267	YGL014C-A	YGL014C-A	162 nt		2.91	□□□□□ -1.94
SMC4	Q12267	GLN4	YOR168W	2430 nt		2.9	□□□□□ -1.94
SMC4	Q12267	GPB1	YOR371C	2694 nt		2.9	□□□□□ -1.95
SMC4	Q12267	VHR2	YER064C	1518 nt		2.89	□□□□□ -1.95
SMC4	Q12267	YLR365W	YLR365W	333 nt		2.89	□□□□□ -1.95
SMC4	Q12267	ATG17	YLR423C	1254 nt		2.89	□□□□□ -1.95
SMC4	Q12267	IOC3	YFR013W	2364 nt		2.89	□□□□□ -1.95
SMC4	Q12267	YCR013C	YCR013C	648 nt		2.88	□□□□□ -1.95
SMC4	Q12267	YJR056C	YJR056C	711 nt		2.88	□□□□□ -1.95
SMC4	Q12267	GCD7	YLR291C	1146 nt		2.88	□□□□□ -1.95
SMC4	Q12267	HAT1	YPL001W	1125 nt		2.88	□□□□□ -1.95
SMC4	Q12267	SEY1	YOR165W	2331 nt		2.88	□□□□□ -1.95
SMC4	Q12267	SET2	YJL168C	2202 nt		2.88	□□□□□ -1.95
SMC4	Q12267	POL1	YNL102W	4407 nt		2.87	□□□□□ -1.95
SMC4	Q12267	RBK1	YCR036W	1002 nt		2.87	□□□□□ -1.95
SMC4	Q12267	YGR168C	YGR168C	1131 nt		2.87	□□□□□ -1.95
SMC4	Q12267	YHL037C	YHL037C	402 nt		2.87	□□□□□ -1.95
SMC4	Q12267	ELO3	YLR372W	1038 nt		2.87	□□□□□ -1.95
SMC4	Q12267	CUS2	YNL286W	858 nt		2.87	□□□□□ -1.95
SMC4	Q12267	CDC55	YGL190C	1581 nt		2.87	□□□□□ -1.95
SMC4	Q12267	YNL193W	YNL193W	1677 nt		2.87	□□□□□ -1.95
SMC4	Q12267	YGR226C	YGR226C	210 nt		2.86	□□□□□ -1.95
SMC4	Q12267	YHR210C	YHR210C	1026 nt		2.86	□□□□□ -1.95
SMC4	Q12267	OST6	YML019W	999 nt		2.86	□□□□□ -1.95
SMC4	Q12267	SPR28	YDR218C	1272 nt		2.85	□□□□□ -1.95
SMC4	Q12267	ADK2	YER170W	678 nt		2.85	□□□□□ -1.95
SMC4	Q12267	YVH1	YIR026C	1095 nt		2.85	□□□□□ -1.95
SMC4	Q12267	PML39	YML107C	1005 nt		2.85	□□□□□ -1.95
SMC4	Q12267	NFI1	YOR156C	2181 nt		2.85	□□□□□ -1.95
SMC4	Q12267	MSH3	YCR092C	3057 nt		2.85	□□□□□ -1.95
SMC4	Q12267	RPL27B	YDR471W	411 nt		2.85	□□□□□ -1.95
SMC4	Q12267	RPC40	YPR110C	1008 nt		2.85	□□□□□ -1.95
SMC4	Q12267	THI22	YPR121W	1719 nt		2.84	□□□□□ -1.95
SMC4	Q12267	VMA8	YEL051W	771 nt		2.84	□□□□□ -1.96
SMC4	Q12267	YKR051W	YKR051W	1257 nt		2.84	□□□□□ -1.96
SMC4	Q12267	YAP7	YOL028C	738 nt		2.84	□□□□□ -1.96
SMC4	Q12267	ATP3	YBR039W	936 nt		2.84	□□□□□ -1.96
SMC4	Q12267	BTS1	YPL069C	1008 nt		2.84	□□□□□ -1.96
SMC4	Q12267	CAT8	YMR280C	4302 nt		2.83	□□□□□ -1.96
SMC4	Q12267	PHO13	YDL236W	939 nt		2.83	□□□□□ -1.96
SMC4	Q12267	SET6	YPL165C	1122 nt		2.83	□□□□□ -1.96
SMC4	Q12267	YBL005W-B	YBL005W-B	5268 nt		2.82	□□□□□ -1.96
SMC4	Q12267	FRE2	YKL220C	2136 nt		2.82	□□□□□ -1.96
SMC4	Q12267	ADY4	YLR227C	1482 nt		2.82	□□□□□ -1.96
SMC4	Q12267	TEC1	YBR083W	1461 nt		2.82	□□□□□ -1.96
SMC4	Q12267	TIF4631	YGR162W	2859 nt		2.81	□□□□□ -1.96
SMC4	Q12267	YDL242W	YDL242W	354 nt		2.81	□□□□□ -1.96
SMC4	Q12267	MRPL38	YKL170W	417 nt		2.81	□□□□□ -1.96
SMC4	Q12267	YBL012C	YBL012C	402 nt		2.81	□□□□□ -1.96
SMC4	Q12267	SET1	YHR119W	3243 nt		2.81	□□□□□ -1.96
SMC4	Q12267	TOF1	YNL273W	3717 nt		2.8	□□□□□ -1.96
SMC4	Q12267	TRA1	YHR099W	11235 nt		2.8	□□□□□ -1.96
SMC4	Q12267	YHL045W	YHL045W	348 nt		2.8	□□□□□ -1.96
SMC4	Q12267	YIL024C	YIL024C	570 nt		2.8	□□□□□ -1.96
SMC4	Q12267	YLR428C	YLR428C	345 nt		2.8	□□□□□ -1.96
SMC4	Q12267	AFT2	YPL202C	1251 nt		2.8	□□□□□ -1.96
SMC4	Q12267	LAA1	YJL207C	6045 nt		2.79	□□□□□ -1.96
SMC4	Q12267	VPH1	YOR270C	2523 nt		2.79	□□□□□ -1.96

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 65.1 ms