Protein–RNA interactions for Protein: P32340

NDI1, Rotenone-insensitive NADH-ubiquinone oxidoreductase, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NDI1P32340 AKR1YDR264C 2295 nt3.39□□□□□ -1.87
NDI1P32340 YPR022CYPR022C 3402 nt3.38□□□□□ -1.87
NDI1P32340 HTB1YDR224C 396 nt3.38□□□□□ -1.87
NDI1P32340 PMI40YER003C 1290 nt3.38□□□□□ -1.87
NDI1P32340 SVP26YHR181W 687 nt3.38□□□□□ -1.87
NDI1P32340 SOD1YJR104C 465 nt3.38□□□□□ -1.87
NDI1P32340 TEM1YML064C 738 nt3.38□□□□□ -1.87
NDI1P32340 RAD14YMR201C 1116 nt3.38□□□□□ -1.87
NDI1P32340 TPM1YNL079C 600 nt3.38□□□□□ -1.87
NDI1P32340 LDS2YOL047C 1071 nt3.38□□□□□ -1.87
NDI1P32340 MSR1YHR091C 1932 nt3.38□□□□□ -1.87
NDI1P32340 DSE1YER124C 1722 nt3.38□□□□□ -1.87
NDI1P32340 THR4YCR053W 1545 nt3.38□□□□□ -1.87
NDI1P32340 MTR4YJL050W 3222 nt3.38□□□□□ -1.87
NDI1P32340 STE24YJR117W 1362 nt3.38□□□□□ -1.87
NDI1P32340 ARP9YMR033W 1404 nt3.37□□□□□ -1.87
NDI1P32340 KAP95YLR347C 2586 nt3.37□□□□□ -1.87
NDI1P32340 FRE4YNR060W 2160 nt3.37□□□□□ -1.87
NDI1P32340 YHR080CYHR080C 4038 nt3.37□□□□□ -1.87
NDI1P32340 GPM2YDL021W 936 nt3.37□□□□□ -1.87
NDI1P32340 YGL242CYGL242C 546 nt3.37□□□□□ -1.87
NDI1P32340 GLO1YML004C 981 nt3.37□□□□□ -1.87
NDI1P32340 DLT1YMR126C 1029 nt3.37□□□□□ -1.87
NDI1P32340 FDH2YPL275W 711 nt3.37□□□□□ -1.87
NDI1P32340 YPR077CYPR077C 372 nt3.37□□□□□ -1.87
NDI1P32340 PHO88YBR106W 567 nt3.37□□□□□ -1.87
NDI1P32340 STU2YLR045C 2667 nt3.37□□□□□ -1.87
NDI1P32340 YNR063WYNR063W 1824 nt3.37□□□□□ -1.87
NDI1P32340 CCM1YGR150C 2595 nt3.37□□□□□ -1.87
NDI1P32340 UTP5YDR398W 1932 nt3.36□□□□□ -1.87
NDI1P32340 ARG5,6YER069W 2592 nt3.36□□□□□ -1.87
NDI1P32340 YDL199CYDL199C 2064 nt3.36□□□□□ -1.87
NDI1P32340 EBS1YDR206W 2655 nt3.36□□□□□ -1.87
NDI1P32340 YEA4YEL004W 1029 nt3.36□□□□□ -1.87
NDI1P32340 MIG3YER028C 1185 nt3.36□□□□□ -1.87
NDI1P32340 FMP32YFL046W 624 nt3.36□□□□□ -1.87
NDI1P32340 CGR1YGL029W 363 nt3.36□□□□□ -1.87
NDI1P32340 TAN1YGL232W 870 nt3.36□□□□□ -1.87
NDI1P32340 YGR126WYGR126W 693 nt3.36□□□□□ -1.87
NDI1P32340 CFD1YIL003W 882 nt3.36□□□□□ -1.87
NDI1P32340 YKL131WYKL131W 522 nt3.36□□□□□ -1.87
NDI1P32340 GTT2YLL060C 702 nt3.36□□□□□ -1.87
NDI1P32340 YMR122W-AYMR122W-A 255 nt3.36□□□□□ -1.87
NDI1P32340 ERG29YMR134W 714 nt3.36□□□□□ -1.87
NDI1P32340 RUF5-1RUF5-1 710 nt3.36□□□□□ -1.87
NDI1P32340 RUF5-2RUF5-2 710 nt3.36□□□□□ -1.87
NDI1P32340 RAS1YOR101W 930 nt3.36□□□□□ -1.87
NDI1P32340 SAS5YOR213C 747 nt3.36□□□□□ -1.87
NDI1P32340 CTP1YBR291C 900 nt3.36□□□□□ -1.87
NDI1P32340 SEA4YBL104C 3117 nt3.36□□□□□ -1.87
NDI1P32340 YGL176CYGL176C 1665 nt3.36□□□□□ -1.87
NDI1P32340 PKH1YDR490C 2301 nt3.36□□□□□ -1.87
NDI1P32340 EXO5YBR163W 1758 nt3.35□□□□□ -1.87
NDI1P32340 PRP22YER013W 3438 nt3.35□□□□□ -1.87
NDI1P32340 MIP6YHR015W 1980 nt3.35□□□□□ -1.87
NDI1P32340 CLB3YDL155W 1284 nt3.35□□□□□ -1.87
NDI1P32340 GPP2YER062C 753 nt3.35□□□□□ -1.87
NDI1P32340 YFL065CYFL065C 309 nt3.35□□□□□ -1.87
NDI1P32340 YGR190CYGR190C 366 nt3.35□□□□□ -1.87
NDI1P32340 EPT1YHR123W 1176 nt3.35□□□□□ -1.87
NDI1P32340 YHR214C-EYHR214C-E 300 nt3.35□□□□□ -1.87
NDI1P32340 YJL032WYJL032W 315 nt3.35□□□□□ -1.87
NDI1P32340 GLG2YJL137C 1143 nt3.35□□□□□ -1.87
NDI1P32340 MBR1YKL093W 1020 nt3.35□□□□□ -1.87
NDI1P32340 PCD1YLR151C 1023 nt3.35□□□□□ -1.87
NDI1P32340 YAR070CYAR070C 300 nt3.35□□□□□ -1.87
NDI1P32340 YLR290CYLR290C 834 nt3.35□□□□□ -1.87
NDI1P32340 RAD33YML011C 534 nt3.35□□□□□ -1.87
NDI1P32340 YOR366WYOR366W 354 nt3.35□□□□□ -1.87
NDI1P32340 FIG1YBR040W 897 nt3.35□□□□□ -1.87
NDI1P32340 SRL4YPL033C 846 nt3.35□□□□□ -1.87
NDI1P32340 PPT2YPL148C 522 nt3.35□□□□□ -1.87
NDI1P32340 MTL1YGR023W 1656 nt3.35□□□□□ -1.87
NDI1P32340 SHQ1YIL104C 1524 nt3.34□□□□□ -1.87
NDI1P32340 REC8YPR007C 2043 nt3.34□□□□□ -1.87
NDI1P32340 MSM1YGR171C 1728 nt3.34□□□□□ -1.87
NDI1P32340 ARG2YJL071W 1725 nt3.34□□□□□ -1.87
NDI1P32340 AI3Q0060 1248 nt3.34□□□□□ -1.87
NDI1P32340 YDR431WYDR431W 312 nt3.34□□□□□ -1.87
NDI1P32340 APA2YDR530C 978 nt3.34□□□□□ -1.87
NDI1P32340 LIF1YGL090W 1266 nt3.34□□□□□ -1.87
NDI1P32340 YHR054CYHR054C 1065 nt3.34□□□□□ -1.87
NDI1P32340 YJR037WYJR037W 384 nt3.34□□□□□ -1.87
NDI1P32340 EMC2YJR088C 879 nt3.34□□□□□ -1.87
NDI1P32340 INN1YNL152W 1230 nt3.34□□□□□ -1.87
NDI1P32340 YOR238WYOR238W 912 nt3.34□□□□□ -1.87
NDI1P32340 YPL035CYPL035C 348 nt3.34□□□□□ -1.87
NDI1P32340 RDS2YPL133C 1341 nt3.34□□□□□ -1.87
NDI1P32340 APM3YBR288C 1452 nt3.34□□□□□ -1.88
NDI1P32340 SSM4YIL030C 3960 nt3.34□□□□□ -1.88
NDI1P32340 ETP1YHL010C 1758 nt3.33□□□□□ -1.88
NDI1P32340 SMC3YJL074C 3693 nt3.33□□□□□ -1.88
NDI1P32340 snR83snR83 306 nt3.33□□□□□ -1.88
NDI1P32340 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt3.33□□□□□ -1.88
NDI1P32340 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt3.33□□□□□ -1.88
NDI1P32340 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt3.33□□□□□ -1.88
NDI1P32340 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt3.33□□□□□ -1.88
NDI1P32340 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt3.33□□□□□ -1.88
NDI1P32340 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt3.33□□□□□ -1.88
NDI1P32340 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt3.33□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 28.8 ms