Protein–RNA interactions for Protein: P19793

RXRA, Retinoic acid receptor RXR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRAP19793 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RXRAP19793 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RXRAP19793 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RXRAP19793 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RXRAP19793 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RXRAP19793 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RXRAP19793 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RXRAP19793 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RXRAP19793 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RXRAP19793 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RXRAP19793 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RXRAP19793 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RXRAP19793 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RXRAP19793 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RXRAP19793 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RXRAP19793 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RXRAP19793 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RXRAP19793 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RXRAP19793 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RXRAP19793 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RXRAP19793 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RXRAP19793 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RXRAP19793 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RXRAP19793 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RXRAP19793 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RXRAP19793 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RXRAP19793 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RXRAP19793 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RXRAP19793 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RXRAP19793 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RXRAP19793 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RXRAP19793 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RXRAP19793 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RXRAP19793 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RXRAP19793 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RXRAP19793 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RXRAP19793 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RXRAP19793 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RXRAP19793 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RXRAP19793 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RXRAP19793 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RXRAP19793 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RXRAP19793 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RXRAP19793 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RXRAP19793 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RXRAP19793 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RXRAP19793 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RXRAP19793 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RXRAP19793 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RXRAP19793 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RXRAP19793 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RXRAP19793 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RXRAP19793 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RXRAP19793 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RXRAP19793 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RXRAP19793 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RXRAP19793 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RXRAP19793 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RXRAP19793 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RXRAP19793 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RXRAP19793 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RXRAP19793 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RXRAP19793 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RXRAP19793 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RXRAP19793 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RXRAP19793 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RXRAP19793 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RXRAP19793 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RXRAP19793 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RXRAP19793 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RXRAP19793 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RXRAP19793 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RXRAP19793 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RXRAP19793 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RXRAP19793 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RXRAP19793 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RXRAP19793 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RXRAP19793 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RXRAP19793 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RXRAP19793 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RXRAP19793 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RXRAP19793 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RXRAP19793 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RXRAP19793 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RXRAP19793 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RXRAP19793 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RXRAP19793 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RXRAP19793 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RXRAP19793 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RXRAP19793 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RXRAP19793 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RXRAP19793 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RXRAP19793 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RXRAP19793 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RXRAP19793 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RXRAP19793 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RXRAP19793 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RXRAP19793 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RXRAP19793 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RXRAP19793 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms