Protein–RNA interactions for Protein: P04183

TK1, Thymidine kinase, cytosolic, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TK1P04183 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TK1P04183 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TK1P04183 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TK1P04183 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TK1P04183 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TK1P04183 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TK1P04183 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TK1P04183 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TK1P04183 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TK1P04183 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TK1P04183 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TK1P04183 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TK1P04183 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TK1P04183 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TK1P04183 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TK1P04183 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TK1P04183 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TK1P04183 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TK1P04183 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TK1P04183 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TK1P04183 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TK1P04183 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TK1P04183 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TK1P04183 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TK1P04183 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TK1P04183 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TK1P04183 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TK1P04183 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TK1P04183 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TK1P04183 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TK1P04183 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TK1P04183 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TK1P04183 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TK1P04183 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TK1P04183 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TK1P04183 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TK1P04183 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TK1P04183 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TK1P04183 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TK1P04183 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TK1P04183 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TK1P04183 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TK1P04183 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TK1P04183 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TK1P04183 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TK1P04183 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TK1P04183 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TK1P04183 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TK1P04183 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TK1P04183 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TK1P04183 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TK1P04183 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TK1P04183 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TK1P04183 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TK1P04183 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TK1P04183 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TK1P04183 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TK1P04183 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TK1P04183 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TK1P04183 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TK1P04183 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TK1P04183 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TK1P04183 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TK1P04183 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TK1P04183 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TK1P04183 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TK1P04183 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
TK1P04183 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TK1P04183 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TK1P04183 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TK1P04183 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TK1P04183 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TK1P04183 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TK1P04183 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TK1P04183 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TK1P04183 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TK1P04183 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TK1P04183 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TK1P04183 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TK1P04183 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TK1P04183 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TK1P04183 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TK1P04183 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TK1P04183 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TK1P04183 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TK1P04183 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TK1P04183 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TK1P04183 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TK1P04183 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TK1P04183 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TK1P04183 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TK1P04183 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TK1P04183 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TK1P04183 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TK1P04183 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TK1P04183 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TK1P04183 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TK1P04183 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TK1P04183 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TK1P04183 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148 ms