Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC78A2IDD5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC78A2IDD5 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC78A2IDD5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC78A2IDD5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC78A2IDD5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms