Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM28Q13263 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM28Q13263 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM28Q13263 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM28Q13263 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIM28Q13263 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM28Q13263 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM28Q13263 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM28Q13263 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM28Q13263 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM28Q13263 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM28Q13263 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM28Q13263 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM28Q13263 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM28Q13263 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIM28Q13263 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM28Q13263 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM28Q13263 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM28Q13263 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM28Q13263 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM28Q13263 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM28Q13263 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM28Q13263 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIM28Q13263 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM28Q13263 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM28Q13263 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM28Q13263 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM28Q13263 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM28Q13263 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM28Q13263 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM28Q13263 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM28Q13263 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM28Q13263 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
TRIM28Q13263 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIM28Q13263 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIM28Q13263 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIM28Q13263 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIM28Q13263 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIM28Q13263 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIM28Q13263 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIM28Q13263 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIM28Q13263 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIM28Q13263 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIM28Q13263 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIM28Q13263 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TRIM28Q13263 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TRIM28Q13263 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TRIM28Q13263 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TRIM28Q13263 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM28Q13263 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM28Q13263 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM28Q13263 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM28Q13263 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM28Q13263 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM28Q13263 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM28Q13263 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM28Q13263 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM28Q13263 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM28Q13263 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM28Q13263 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM28Q13263 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM28Q13263 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM28Q13263 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM28Q13263 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM28Q13263 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM28Q13263 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM28Q13263 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM28Q13263 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM28Q13263 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM28Q13263 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM28Q13263 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM28Q13263 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM28Q13263 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM28Q13263 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM28Q13263 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM28Q13263 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM28Q13263 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM28Q13263 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM28Q13263 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM28Q13263 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM28Q13263 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM28Q13263 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM28Q13263 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM28Q13263 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM28Q13263 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM28Q13263 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM28Q13263 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM28Q13263 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM28Q13263 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM28Q13263 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM28Q13263 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM28Q13263 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM28Q13263 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM28Q13263 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM28Q13263 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM28Q13263 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM28Q13263 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM28Q13263 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM28Q13263 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM28Q13263 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
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