Protein–RNA interactions for Protein: P38316

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, yeast

Predictions only

Length 186 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG12	P38316	PBI1	YPL272C	1554 nt		2.95	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	CLN2	YPL256C	1638 nt		2.95	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	YDL026W	YDL026W	312 nt		2.95	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	QRI7	YDL104C	1224 nt		2.95	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	YDR340W	YDR340W	303 nt		2.95	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	FRQ1	YDR373W	573 nt		2.95	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	KXD1	YGL079W	657 nt		2.95	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	TRI1	YMR233W	681 nt		2.95	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	PEX11	YOL147C	711 nt		2.95	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	HNT3	YOR258W	654 nt		2.95	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	YPL107W	YPL107W	747 nt		2.95	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	MSB2	YGR014W	3921 nt		2.95	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	FRE8	YLR047C	2061 nt		2.95	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	YGR237C	YGR237C	2358 nt		2.95	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	ATG13	YPR185W	2217 nt		2.95	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	SEC15	YGL233W	2733 nt		2.94	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	ATP25	YMR098C	1839 nt		2.94	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	YCR015C	YCR015C	954 nt		2.94	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	YDL241W	YDL241W	372 nt		2.94	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	VFA1	YER128W	612 nt		2.94	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	ADH4	YGL256W	1149 nt		2.94	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	POP6	YGR030C	477 nt		2.94	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	ATP12	YJL180C	978 nt		2.94	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	RSM26	YJR101W	801 nt		2.94	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	DID4	YKL002W	699 nt		2.94	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	PCD1	YLR151C	1023 nt		2.94	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	BUR2	YLR226W	1188 nt		2.94	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	YNL162W-A	YNL162W-A	219 nt		2.94	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	DDI3	YNL335W	678 nt		2.94	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	SUR1	YPL057C	1149 nt		2.94	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	YPR050C	YPR050C	414 nt		2.94	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	PBP2	YBR233W	1242 nt		2.94	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	YCL001W-A	YCL001W-A	462 nt		2.94	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	ECM18	YDR125C	1362 nt		2.94	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	YDL199C	YDL199C	2064 nt		2.94	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	SEC27	YGL137W	2670 nt		2.94	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	BUB1	YGR188C	3066 nt		2.94	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	ARG2	YJL071W	1725 nt		2.93	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	DNA2	YHR164C	4569 nt		2.93	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	ERG11	YHR007C	1593 nt		2.93	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	BCS1	YDR375C	1371 nt		2.93	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	DYN1	YKR054C	12279 nt		2.93	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	RPS29B	YDL061C	171 nt		2.93	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	CLB3	YDL155W	1284 nt		2.93	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	YDL186W	YDL186W	834 nt		2.93	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	YDR149C	YDR149C	708 nt		2.93	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	DDI2	YFL061W	678 nt		2.93	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	QCR10	YHR001W-A	234 nt		2.93	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	SOL3	YHR163W	750 nt		2.93	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	YLR444C	YLR444C	303 nt		2.93	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	HUB1	YNR032C-A	222 nt		2.93	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	NAB6	YML117W	3405 nt		2.93	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	APN2	YBL019W	1563 nt		2.92	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	MEK1	YOR351C	1494 nt		2.92	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	EMP70	YLR083C	2004 nt		2.92	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	FAR1	YJL157C	2493 nt		2.92	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	TGL2	YDR058C	981 nt		2.92	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	KEG1	YFR042W	603 nt		2.92	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	ERP6	YGL002W	651 nt		2.92	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	CGR1	YGL029W	363 nt		2.92	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	MRPL6	YHR147C	645 nt		2.92	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	YAL031W-A	YAL031W-A	309 nt		2.92	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	YJR111C	YJR111C	852 nt		2.92	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	YKT6	YKL196C	603 nt		2.92	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	TDA8	YAL064C-A	381 nt		2.92	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	YLR311C	YLR311C	348 nt		2.92	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	YOR082C	YOR082C	342 nt		2.92	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	DBP5	YOR046C	1449 nt		2.92	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	ILS1	YBL076C	3219 nt		2.91	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	RIF1	YBR275C	5751 nt		2.91	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	RDI1	YDL135C	609 nt		2.91	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	YDL162C	YDL162C	357 nt		2.91	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	YER039C-A	YER039C-A	219 nt		2.91	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	SAM37	YMR060C	984 nt		2.91	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	TVP18	YMR071C	504 nt		2.91	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	RPS7A	YOR096W	573 nt		2.91	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	DGA1	YOR245C	1257 nt		2.91	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	PEX1	YKL197C	3132 nt		2.91	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	RAD5	YLR032W	3510 nt		2.9	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	ITC1	YGL133W	3795 nt		2.9	□□□□□ -1.94
ATG12	P38316	HRD1	YOL013C	1656 nt		2.9	□□□□□ -1.95
ATG12	P38316	RPL35B	YDL136W	363 nt		2.9	□□□□□ -1.95
ATG12	P38316	RRT13	YER066W	558 nt		2.9	□□□□□ -1.95
ATG12	P38316	YLR416C	YLR416C	399 nt		2.9	□□□□□ -1.95
ATG12	P38316	COS1	YNL336W	1146 nt		2.9	□□□□□ -1.95
ATG12	P38316	MSN1	YOL116W	1149 nt		2.9	□□□□□ -1.95
ATG12	P38316	YOR385W	YOR385W	873 nt		2.9	□□□□□ -1.95
ATG12	P38316	VPS64	YDR200C	1815 nt		2.9	□□□□□ -1.95
ATG12	P38316	TFC4	YGR047C	3078 nt		2.9	□□□□□ -1.95
ATG12	P38316	SET1	YHR119W	3243 nt		2.89	□□□□□ -1.95
ATG12	P38316	NUF2	YOL069W	1356 nt		2.89	□□□□□ -1.95
ATG12	P38316	YMR018W	YMR018W	1545 nt		2.89	□□□□□ -1.95
ATG12	P38316	RAD55	YDR076W	1221 nt		2.89	□□□□□ -1.95
ATG12	P38316	DOG1	YHR044C	741 nt		2.89	□□□□□ -1.95
ATG12	P38316	LSM12	YHR121W	564 nt		2.89	□□□□□ -1.95
ATG12	P38316	YBL096C	YBL096C	309 nt		2.89	□□□□□ -1.95
ATG12	P38316	RAS1	YOR101W	930 nt		2.89	□□□□□ -1.95
ATG12	P38316	YOR114W	YOR114W	885 nt		2.89	□□□□□ -1.95
ATG12	P38316	YOR238W	YOR238W	912 nt		2.89	□□□□□ -1.95
ATG12	P38316	MUM2	YBR057C	1101 nt		2.89	□□□□□ -1.95

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