Protein–RNA interactions for Protein: P0C7V0

LINC00271, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00271, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00271P0C7V0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINC00271P0C7V0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LINC00271P0C7V0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00271P0C7V0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00271P0C7V0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00271P0C7V0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00271P0C7V0 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00271P0C7V0 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00271P0C7V0 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00271P0C7V0 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00271P0C7V0 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00271P0C7V0 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00271P0C7V0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00271P0C7V0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00271P0C7V0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00271P0C7V0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC00271P0C7V0 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC00271P0C7V0 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC00271P0C7V0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC00271P0C7V0 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC00271P0C7V0 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC00271P0C7V0 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC00271P0C7V0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC00271P0C7V0 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC00271P0C7V0 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC00271P0C7V0 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC00271P0C7V0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC00271P0C7V0 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC00271P0C7V0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC00271P0C7V0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC00271P0C7V0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC00271P0C7V0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC00271P0C7V0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC00271P0C7V0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC00271P0C7V0 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC00271P0C7V0 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC00271P0C7V0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC00271P0C7V0 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC00271P0C7V0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC00271P0C7V0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC00271P0C7V0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC00271P0C7V0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC00271P0C7V0 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC00271P0C7V0 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC00271P0C7V0 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC00271P0C7V0 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC00271P0C7V0 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC00271P0C7V0 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC00271P0C7V0 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC00271P0C7V0 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC00271P0C7V0 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC00271P0C7V0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC00271P0C7V0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC00271P0C7V0 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00271P0C7V0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00271P0C7V0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00271P0C7V0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00271P0C7V0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00271P0C7V0 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00271P0C7V0 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00271P0C7V0 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00271P0C7V0 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00271P0C7V0 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00271P0C7V0 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00271P0C7V0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00271P0C7V0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00271P0C7V0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC00271P0C7V0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
LINC00271P0C7V0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LINC00271P0C7V0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LINC00271P0C7V0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00271P0C7V0 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00271P0C7V0 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00271P0C7V0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00271P0C7V0 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00271P0C7V0 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00271P0C7V0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00271P0C7V0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00271P0C7V0 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00271P0C7V0 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00271P0C7V0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00271P0C7V0 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00271P0C7V0 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00271P0C7V0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00271P0C7V0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00271P0C7V0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00271P0C7V0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00271P0C7V0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00271P0C7V0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00271P0C7V0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00271P0C7V0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC00271P0C7V0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC00271P0C7V0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC00271P0C7V0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC00271P0C7V0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC00271P0C7V0 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC00271P0C7V0 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC00271P0C7V0 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC00271P0C7V0 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC00271P0C7V0 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms